| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTT > NC_000913/1286934‑1287234 | ggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCTAGGCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt < 1:1632969/151‑1 (MQ=255)ggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCTAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt < 1:1340748/151‑1 (MQ=255) gTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCGCTCGCGGCCGCTCGAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGGGGGGGAAGGATTa < 7:372495/151‑1 (MQ=11) 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ggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTTCCTGCGGCAACGCTATATCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCATGGTAGAAGCTTATCATCCATACCCGCATGGGCAGAATAATTAATTGCGGAATAGTTGGGAAGTTc > 7:359125/1‑150 (MQ=14) ggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTATAGCTGGCGCTCGAGTCGAACCATGGTCGAACCTTATAAAACTTAACCCCAAGGGCAGAAAATTTAATTTCGGATTGGTTGGGGAGtta > 5:1555762/1‑149 (MQ=14) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAg < 3:81825/151‑1 (MQ=255) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGGCGTTGTCTTCGGCAACGCTCTCTCGCTCGAGCGCTAGTCGATCCTTGGTCGAAACTTCTAATCCTTAACAGGATATGGAGCATATTTAAGTGCGGAtaagaaaggaagttc > 1:337934/1‑135 (MQ=2) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAgg < 5:457707/151‑1 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg < 6:221417/151‑1 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg > 7:1026034/1‑151 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg < 4:764205/151‑1 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg < 4:3684/151‑1 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTAGAAGCATATCATCCTTACCCGCAAGGGCAGAATATTTAATTTCGGATTCGTTGGGAAggtgatgg > 7:172552/1‑144 (MQ=14) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGa < 8:831474/151‑1 (MQ=255) cgcgtACTCAGCGCGGCGCGCTTCGCCCTTCGGTTATTTTCATGCCGCAACGCTCTCTCGCTCTCGCTGGAGGGGAATCTTGTTCTTAGCTTGTCATCCGTCAGCTCTTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGa < 2:631526/147‑1 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGCACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTGGTTGGGAAGTTCAgggcg > 3:22142/1‑149 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCAACCTTCCCCGCATGGGGACAAAATTTAATATCGGAGTAGTTGGGAAGTTCAcggtc > 3:705907/1‑149 (MQ=14) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCGCGAGTCGCACCTTGGTCGCAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGTTTGGTTGGGTAGTTGAgggcc > 3:1204544/1‑149 (MQ=14) aTTACTGAGATCTGCTCGCTTCTTCCTTCGGGTCGTTGCTTTATTTAATTTTTTCTCGCTGTAGCTCGAGTCGATCCTTTGTAGAATATTCTCTTTCTTCCCAGCATGGGCAGAATATTTTATTGCTGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGAc < 1:1570830/150‑1 (MQ=255) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGGGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTAGAGTCGAACCTTGGTCAAAGCTTATCATGCTTCCCCGCATGGGCATAATATTTAATTGGGTATTCGTTGGGAATTTCAGGGagt > 5:726303/1‑149 (MQ=14) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGCACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACt > 2:1098206/1‑151 (MQ=255) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCCACGCTCTCTCGCGGGCGCTCGAGTCGCACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCCGAATATTTAATTGCGGCTTCGTTGGGAAGTTGAgggccgtt > 3:916639/1‑146 (MQ=14) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTGGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCCTCCTTCCCCGCATGGGGAGAATATTTTATTGCGGATTGGGTGGGTAGTTGAggggggtt > 8:1341103/1‑146 (MQ=11) | GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTT > NC_000913/1286934‑1287234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |