| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 935,551 | 0 | A | C | 24.6% | 468.6 / 56.4 | 307 | P776P (CCA→CCC) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (110/107); new base C (71/0); total (198/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.46e-18 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
CCACACGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACA‑GCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGT > NC_000913/935402‑935701 | acacGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 3:210310/151‑1 (MQ=255) acacGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 8:1064936/151‑1 (MQ=255) acGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAat > 8:1660399/1‑150 (MQ=255) cGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAatat < 8:1516119/151‑1 (MQ=255) cGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAatat < 1:1297239/151‑1 (MQ=255) gAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATc > 2:1698581/1‑151 (MQ=255) aCCGTTGTTTACGCCAATTGTTGACCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGCTTGCACGGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACACCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATcag < 8:374692/151‑1 (MQ=255) ccGTTGTTTACGCCAATTGTTGATCCTGTACAGCAGCCGCATCAACCCGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATcagc < 5:227241/151‑1 (MQ=255) ccGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCGACAACCGCCGGTTGCGCCTCAGCCCCAATATcagc > 2:1514163/1‑151 (MQ=255) cGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCTCATCcccacaatccgcc > 8:228405/1‑142 (MQ=18) cGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCACTATcagcc > 3:1313712/1‑150 (MQ=255) tgttTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCACTATCCGCAGcc > 2:13159/1‑151 (MQ=255) tACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCTCAACAACCGCTTGCACCGCAGCATCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGca < 6:284446/150‑1 (MQ=255) ccAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCAACAACAGCAGGTTGCGCCTCAGCCCCAATATCAGCAGCCGCaacaac > 2:481989/1‑151 (MQ=255) ccAATAGTTGATCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCaacaac < 3:1058637/151‑1 (MQ=255) tgttgAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTGCGCCGCAGCCGCAGTATCCGCAGCAACAACAGCCCGTTACGCCTCATCCCCACAATCCGCAGCTGCAACAACCgc > 7:1563455/1‑148 (MQ=17) gttgAACCTGTACAGCATCAGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCATTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCTCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGtt < 5:1695392/150‑1 (MQ=255) ttgAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTCCGCCTCAACCCCACTATCAGCAGCAGCATCAACCgaaga > 5:1277470/1‑146 (MQ=17) 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ggTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACA‑GCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACACTGCTTCAt > 2:818177/1‑151 (MQ=255) gccgcAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACA‑GCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTg > 4:1077740/1‑151 (MQ=255) ccgcAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACA‑GCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGt > 7:1681326/1‑151 (MQ=255) ggcAGCCACAAGATCACCAGCCCCAACAACCGGTTGCGCCACA‑GCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGtt < 2:97004/150‑1 (MQ=255) gctggaacaATTTCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCTCA‑GCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTg < 8:687320/145‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |