Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,286,870 | 0 | C | A | 24.1% | 292.7 / 13.4 | 153 | intergenic (+344/+217) | narI/tpr | nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit/protamine‑like protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (57/53); new base A (34/1); total (93/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.65e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT > NC_000913/1286720‑1287019 | ggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTcc < 8:892665/151‑1 (MQ=255) ggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTcc < 2:163863/151‑1 (MQ=255) acggattccgccccgcTCCCCGCTCCGCCCTTCGGGCCGTTGCCTGCGCCAACGCGCTCTCGCTGGCGCCCAAGTCCACCCTGGGTCGACGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCACAATATTTGATTGCGTATTCGTTTCACAATTCCgg < 2:756914/138‑1 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGGCTGCGGCCACGCTCTCTCGCTGGCGCTGAAGTCGCACCGTGGGGGGAGCGTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGGAGAATATTTGATTGGGGGTTGGGTTGAGACTTGCgg > 5:1072383/1‑151 (MQ=11) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGCAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCCGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAATTGCgg > 5:186062/1‑151 (MQ=255) ggtttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTGGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCgggg < 6:930917/148‑1 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCCACGCTCTCTCGCTGGCGCTGAAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGCTTCGGTTGAGATTTCCgggg > 7:399214/1‑151 (MQ=14) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGCACCATTGTCGAAGCTTCTCATACTTACCCCCATGGGCAGAATATTTGATTTCGGATTACGTTGAGAATTAAgggg > 2:579213/1‑151 (MQ=11) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCgggg < 5:404011/151‑1 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCgggg < 5:1414952/151‑1 (MQ=255) gagtACTCTGCGCTGAGCGCTTCGCCGTGCGGGTGGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTCGCGCTCAAGTCGAACGTTGGTCGAAGCTTCTCATCGTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGTATTGGTTTTAGAATTCCGGGGc < 4:1316036/148‑1 (MQ=14) gATTTCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCGCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGc < 3:544797/151‑1 (MQ=255) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCCGGGGCt > 6:932865/1‑151 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCttt < 1:612029/150‑1 (MQ=255) tCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAATTCCGGGGCTTTTg > 6:450277/1‑150 (MQ=255) cAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCtttta < 4:1000215/149‑2 (MQ=255) cAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTg < 5:969007/149‑1 (MQ=255) cAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGCTCGGTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGTCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGaa < 5:425439/151‑1 (MQ=255) aGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGaaa < 5:99677/151‑1 (MQ=255) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACCCACTCTAGCACGCGCTAAAGACCAACCATTGTCGAAGCATAAAAACCTTACACCCAAGGGCAGAAAATTTGATTTAGGATTCGCTTGTGAATTCAGGGGGATTTGAAAGt > 4:291141/1‑151 (MQ=2) gcgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCGCAAGTCGAACCTTTGTCGCAGCTTCTCATCCTTCCCCACATGGGCAGAATATTTGATTGCGGTTTCGGTTGAGAATTCAGGGGCTTTTGAAAGTGAtg > 5:696855/1‑151 (MQ=11) gcgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGAAACGCTCTCTCGCTGGCTCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAt < 2:1391384/150‑1 (MQ=255) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCTGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtgg < 6:830896/151‑1 (MQ=255) cgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtggtg < 6:513949/151‑1 (MQ=255) gcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGGGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCCAGGCGAACCTTGGTGGCAGCGTCACATCCGTGCCCGGGGGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGTGAATTGCCGGGCTTTTGAAAGtggtggtgg > 6:1422050/1‑151 (MQ=14) gcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtggtgg < 4:553568/151‑1 (MQ=255) gcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGGCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtggtgg < 4:1213736/151‑1 (MQ=255) cTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCCGGGGCTTTTGATagggagggggc > 7:637462/1‑147 (MQ=14) cGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtggtggtgg < 3:406602/150‑1 (MQ=255) cGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAtggtggtgg < 8:861315/150‑1 (MQ=255) cGCCCTTCGGGGCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggg < 5:850388/151‑1 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACCCTCTCTCGCTGGCGCTCAACTCGAACCTTGGTCGAATCTTCTCATCCTTCCCCGCATTGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATGGAAAATTCCGGGACTTTTGAAAGTCATGGTGGTgggg > 3:588211/1‑151 (MQ=11) cacTTCTGGTCGTTGCCTGCGTCAACGCTCTCTCTCTGGCGCTCAAGTCGAACGTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGAGGATTCGTTTGAGAATTCGGTGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 5:1548473/149‑1 (MQ=17) gcggggcgcggcgtGCGGCAACGGTCTCTCGGTGGCGATCATTCCTACACTTGTTCTAATCGTATCCTCCTTAACCGCGTGGGCATAATATTTTATTCCGTATTCGTTTCAGTATTCGTGTGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAgg < 3:721457/138‑1 (MQ=9) gggcGTTGGCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAAACTTGGTCGAATCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTCGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt < 7:149337/148‑1 (MQ=17) ggTCGTTGCCTGCGGCTACGCTCTCTCGGTGGCTCTCAAGTCGAACCTTGTTCTAATCTTCTCATCGTTCCACGCGTGGGCATAATATTTGATTGCGTATTCGTTTGAGATTTCCGGTTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt < 6:1212283/151‑1 (MQ=14) ggTCGGTGGCTGAGGCATCGGTATCTCTCGGGCGATCACGTCTAACCTTGTTGTAATTTTCTCAACCTTCACCGCTTGGGCATAATACTTTATTCCGGATTCGTTTCAGTATTGCGTTGCTTATGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt < 8:872862/151‑1 (MQ=12) gggggggtgcgtgaaCGCTCGCTCGCGGGCGCTCAATGCGAACCTTGGTGTTAGCTTCTCATCGTTACCCGGTGGGGCATAATTTATTATTTGGGATTAGTTTCAGTTTTCCTGGCCTTTAGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACt < 5:1312346/138‑1 (MQ=9) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAGAATTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAgagatcgt > 2:75740/1‑143 (MQ=14) gCCTGCGGCAACGCTCTCTCGGCGCCGCTCCAGTCTAACCTTGGTCGAATCTTATCATCCTTACCCGCGGGGGCAGACTCTTTGATTCCGGATTCGTTAGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgc < 8:349286/151‑1 (MQ=14) gCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgc > 3:728059/1‑151 (MQ=255) ccTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGACTTCAGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaaccct > 6:729783/1‑143 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGACCCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCTGGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGCGTTCGGGGGGTGTTGCGAGTGATGGTGGTGGGGGCAGGATTACTCcgcgg > 7:942152/1‑150 (MQ=11) 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cAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTAGTc > 2:521389/1‑151 (MQ=25) cAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTGGTc > 3:907635/1‑151 (MQ=16) aGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTAGTc > 1:354545/1‑150 (MQ=255) gAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTATCGCTGCCGCTCGAGGCGCACCTTAGTCg > 6:1312220/1‑150 (MQ=255) atatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGCTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCGGCCGCTCGCGCCgcccctgcgtcgc > 7:697878/1‑137 (MQ=14) tatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGACGAACCTTCGTCGAAGc > 8:851951/1‑151 (MQ=255) tatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGc > 3:812045/1‑151 (MQ=255) gtttGATTTGCGATTAGTTTGAGGTTTCGTGTTCTTTAGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAAGGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCt < 7:841154/150‑1 (MQ=11) atTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTTCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCGTAGTCGAAGCt > 7:998346/1‑151 (MQ=255) tagattcgcgagtCGTTTGAGAATTCGGGGGCTTTTGAAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCtt < 6:569468/138‑1 (MQ=14) tGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCGCGAGCCGCACCTTGGTCGAAGCTtcg > 6:670335/1‑150 (MQ=255) gATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGTCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGGCGAACCTTAGTCGAAGCTtctc > 5:1448451/1‑151 (MQ=255) gATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTtctc > 5:902770/1‑151 (MQ=255) ttGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTCATGGTGGTGGGGCAAGGATTACTCAGCGCTGCGAGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAAAGATCTCTCGCTGCCGCGCGAGCCGACCCTTGGTCGAAGCTTCTCAt > 5:773389/1‑151 (MQ=14) ggATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGACTCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCACCCtt > 8:145912/1‑151 (MQ=255) ttCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGACGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTccc > 5:733180/1‑151 (MQ=255) ttCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTccc > 5:233371/1‑151 (MQ=255) gTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAACTTGCGGGTGGTGGCGGACGGATTAGGCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc < 4:889450/151‑1 (MQ=14) gTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGCAAGTATTAATCAGCAATGCTCGATTCGCACTTCGGGTAGTTGCATGAGGCAACGCTATATAAATGACGCTCGAGCCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc > 2:410930/1‑151 (MQ=14) ttGAGAATTCCGGGGNTTTTGAAAGNGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGTCACCGCTGCCCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTTNCGCAACGCTCAATANCTGCGGCTGGGGGGGNACGGTTGTCGAAGGTNCTGANNCTTnncgnnnn > 6:410233/1‑146 (MQ=2) agaATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGGCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg > 3:1447378/1‑151 (MQ=255) cGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTTCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAat > 4:722380/1‑150 (MQ=255) cGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGc > 2:1060277/1‑145 (MQ=17) cGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATCGCCAGAat > 2:512367/1‑150 (MQ=255) | GGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT > NC_000913/1286720‑1287019 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |