| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,308,693 | IS1 (–) +9 bp | intergenic (‑48/‑87) | clsA ← / → yciY | cardiolipin synthase 1/uncharacterized protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1308693 = | 11 (0.030) | 370 (0.880) | 189/300 | 0.6 | 96.9% | intergenic (‑48/‑95) | clsA/yciY | cardiolipin synthase 1/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1308701 | 11 (0.030) | 482 (1.140) | 224/300 | 0.0 | 97.6% | intergenic (‑56/‑87) | clsA/yciY | cardiolipin synthase 1/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 370 total aligned reads displayed.
CTAGCCTGACGCTGCATGCGCCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1308840‑1308693‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAC < NC_000913/1979270‑1979137 CTAGCCTGACGCTGCATGCGCCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCTAGATGAATCCGGT > 7:646454/1‑151 GCCTGACGCTGCATGCGCCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGAT < 3:976466/151‑1 TGAAGCTGCATGCGCCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCT > 1:1365741/1‑151 GACGCTGCATGCGCCAGCGCCCCACTTCCGTGCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTG < 7:527120/151‑1 GCTGCATGCGCCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCTATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCA < 2:1039223/151‑1 GCATGCGCCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAA < 3:726787/149‑1 ATGCGCCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTA < 7:784682/151‑1 tggGCCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATCGTCATTATACCACCCCCCCCGACGCTGACCACAGCTTTTCCCGCTTTTTTATTTGACAGATGAATCCGGTGATGCTGCgtactaac > 1:169038/4‑143 GCGCCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAAGTACTCTATGCACTAACTGAATGGTCATTATACCGCGACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCGAGATGAATCCTGTGATGCTGGCAACTTACT < 3:1301152/151‑1 CCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 4:1201615/151‑1 GCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 6:16163/151‑1 GCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGGCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 4:748262/151‑1 CGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 3:382041/151‑1 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6:342136/1‑151 CCGTTCAACTCCGCTTCATTGTAACTACAGCATGCAAAAACAGAAAGGGCAATAAACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 4:630950/150‑1 CGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTGTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTTTATGATGGT < 8:111494/151‑1 GTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTt > 7:1135882/1‑150 TTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 2:1620848/1‑151 TACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 8:844857/1‑151 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TTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCA < 7:1447578/150‑1 TTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCA < 1:151190/150‑1 TTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCA > 7:1286615/1‑150 CCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAG < 7:331040/151‑1 CCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAA > 7:1338940/1‑149 CCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGC < 1:444362/151‑1 CGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCA < 6:1477601/151‑1 GTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCG > 8:1265016/1‑151 GTTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCG < 5:151409/151‑1 TTTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGC > 3:503858/1‑151 TTTTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGC < 2:623551/150‑1 TTTATTTGGCAGATGAATCGGGTGTTGCTGCCATCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGTCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAGGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCC < 4:186458/150‑1 TTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGG > 5:1304584/1‑151 TTATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGG > 2:382566/1‑151 TATTTTCCCGATGAATCCGGTGATGCTGCCCACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGG < 4:1420356/150‑1 TATTTGCCAGATGAATCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGG > 2:971661/1‑150 CTAGCCTGACGCTGCATGCGCCAGCGCCCCACTTCCGTTCTACTCCGCTTCATGTTAACTACTCTATGCAATAACAGAATGGTCATTATACCCCCACCCCCGACGCTGACCAGTGCTTTTCCCGCGTTTTTATTTGCCAGATGAATCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1308840‑1308693‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAC < NC_000913/1979270‑1979137 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |