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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 389 (0.920) | 214/300 | 0.0 | 96.1% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4542042 = | 15 (0.040) | coding (6/597 nt) | fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA | |||||
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |