Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_000913 | 2,732,992 | G→A | I394I (ATC→ATT) | clpB ← | protein disaggregation chaperone |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_000913 | 2,732,992 | 0 | G | A | 97.0% | 1262.3 / 16.5 | 374 | I394I (ATC→ATT) | clpB | protein disaggregation chaperone |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/6); new base A (184/177); total (190/184) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
Only 100 of 384 total aligned reads displayed.
GCATATCCAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCGATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAATGGTA > NC_000913/2732844‑2733139 | gCATATCCAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAAt < 7:1669146/151‑1 (MQ=255) tatCCAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATc > 8:824841/1‑149 (MQ=255) ccAGAGGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTc < 5:698128/151‑1 (MQ=255) cAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCg < 8:1323249/151‑1 (MQ=255) cAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCg < 6:848643/151‑1 (MQ=255) gACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGAt > 3:1397113/1‑151 (MQ=255) ccGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCGATCAGGTCGATg < 3:376975/150‑1 (MQ=255) ttttACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCttt > 5:522774/1‑151 (MQ=255) 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aCTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATcc < 7:1074442/151‑1 (MQ=255) tGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCgg > 1:1137973/1‑151 (MQ=255) tcatcaGACTCTTTCATTAAGGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGc < 7:14249/150‑1 (MQ=255) tcatcaGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAg < 5:1264478/149‑1 (MQ=255) catcaGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCAATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCt < 8:298140/150‑1 (MQ=255) 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atcaatcaGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAATGGt > 8:1670404/1‑150 (MQ=255) atcaatcaGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAATGGTa < 1:1528394/151‑1 (MQ=255) | GCATATCCAGACGTTTTTTACTGGCTTCATCAGACTCTTTCATTAACGCCTGTTGTTCCAGTTTGAGCTGGATGATACGACGATCGAGTCGGTCGAGTTCTTCTGGTTTTGAGTCAATCTGCATACGAATGCTGGATGCTGCTTCATCGATCAGGTCGATGGCTTTATCCGGCAGCTGACGGTCAGCAATGTAGCGATGAGACAACGTCGCCGCTGCAACAATTGCCGGGTCAGTAATTTGCACATGGTGGTGCAATTCGTAACGTTCTTTCAGGCCACGCAGAATCGCAATGGTA > NC_000913/2732844‑2733139 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |