| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 157,585 | C→T | D50N (GAT→AAT) | folK ← | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 157,585 | 0 | C | T | 97.1% | 1405.5 / 19.1 | 419 | D50N (GAT→AAT) | folK | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/7); new base T (181/226); total (186/233) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 421 total aligned reads displayed.
ATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCAT > NC_000913/157437‑157732 | atgTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGAtttt < 3:1132128/151‑1 (MQ=255) gTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTTCGTTTAAGTAATCGCGTTGATTTTGc > 6:1577594/1‑151 (MQ=255) cGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCg < 2:1278599/150‑1 (MQ=255) 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gggtGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATTGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTg < 4:870621/148‑1 (MQ=255) gATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCa < 6:676161/150‑1 (MQ=255) | ATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCAT > NC_000913/157437‑157732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |