| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,270,497 | C→T | intergenic (+895/+128) | yhaC → / ← garK | pentapetide repeats‑related protein/glycerate kinase I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,270,497 | 0 | C | T | 97.5% | 1235.3 / 10.7 | 369 | intergenic (+895/+128) | yhaC/garK | pentapetide repeats‑related protein/glycerate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/4); new base T (192/165); total (198/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
CCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTC > NC_000913/3270349‑3270644 | ccGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCt > 6:1143170/1‑151 (MQ=255)ccGGGTGCAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTCGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCt > 4:1230964/1‑151 (MQ=255) cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTGTCTGTTGCCCTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCCGGC‑GGTATCTg > 5:55010/1‑151 (MQ=255) cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTg < 5:1665648/151‑1 (MQ=255) ggAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCAc < 7:356571/150‑1 (MQ=255) tttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGc > 7:1277008/1‑151 (MQ=255) aCCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCt < 3:1204828/151‑1 (MQ=255) aCCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCt < 6:350800/151‑1 (MQ=255) ccGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCCCCCTGcccg > 3:262848/1‑149 (MQ=255) cGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTAt > 8:895319/1‑151 (MQ=255) gTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTGCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTAtt > 2:1401299/1‑150 (MQ=255) gTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGGCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATg < 8:1666012/151‑1 (MQ=255) gCCACGGACTGTTACCAGCCTCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATgg < 1:794575/150‑1 (MQ=255) gCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATgg > 4:237113/1‑150 (MQ=255) ccACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCAATgg > 1:1404711/1‑149 (MQ=255) cACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAga < 8:263635/151‑2 (MQ=255) cACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGc > 4:879541/1‑151 (MQ=255) aCGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCGTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGcc < 4:1146801/151‑1 (MQ=255) 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cTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTGTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGAc > 1:222147/1‑151 (MQ=255) ttACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCCCCCTGCCCTATGGAGCCCGGCCttt > 4:713516/1‑151 (MQ=255) ttACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCAGCCCGATGGAGCCCCGACgtt > 1:1055676/1‑151 (MQ=255) ccAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTtcct > 4:794963/1‑151 (MQ=255) ccGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTcctcccc < 6:1015531/151‑1 (MQ=255) gcggcgCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTcctcccctccc > 2:770234/1‑150 (MQ=255) gcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTcctcccctccc > 2:223174/1‑150 (MQ=255) gcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCg < 6:479845/151‑1 (MQ=255) ggggcgcTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGcc < 6:168345/148‑1 (MQ=255) gTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAACCCGGACTTTCCTCCCCTCCGccc < 4:577724/151‑1 (MQ=255) 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cTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCCCCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGacgacgacg > 6:142931/1‑150 (MQ=255) ttACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCCTCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTGCCCCCCCGGG‑GGTGTCTGGGACCCGGCCCGTTGGGGCCCGGGGGTGACGCCCCGCCCCCCGGCCCCCCCGAagccggcgcaccgcc > 5:1595735/1‑137 (MQ=255) tACCTTATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGAACTGGTCGTGGGTGTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGAATTTCCTCCCCTCCGCCCGTCT‑CCCCGAAGAGGACGACGACTaa < 6:1287514/149‑1 (MQ=255) tACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGCCTTTCCTACCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGaac > 3:142927/1‑150 (MQ=255) tACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGG‑CGACGACGAAg < 7:893371/150‑1 (MQ=255) 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ccGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATATGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCCCCCCTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAACCGGCGCCTg > 8:1143144/1‑151 (MQ=255) ccGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTg < 7:431562/151‑1 (MQ=255) tccgcgGGCCATCGGCGGCTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGCTTCCCCCCCAGGC‑GTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTca < 2:1164174/147‑2 (MQ=255) gcgGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCTCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGCCGAAGCGGCGCCTGTCTGGTc > 5:176344/1‑150 (MQ=255) gcgGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCa < 3:687707/151‑1 (MQ=255) 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cACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGCCTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTgcg > 7:715177/1‑151 (MQ=255) cACTGGTCGTGGGGTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTgcg < 3:1348738/151‑1 (MQ=255) ggTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTgcgcg < 1:1228222/149‑1 (MQ=255) cgtgcgtgTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGCCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCt < 6:256244/150‑1 (MQ=255) cGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGCCGAAGCGGCGACGGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGGATAGAGGGTTTGCGCGGCCtt > 8:1202224/1‑151 (MQ=255) 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cccccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCcgcg > 2:1045118/1‑151 (MQ=255) cccccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCcgcg > 7:1081871/1‑151 (MQ=255) ccccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGt < 3:361464/151‑1 (MQ=255) cccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGtt < 7:605112/151‑1 (MQ=255) cccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGtt < 2:1567346/151‑1 (MQ=255) cccAGGC‑GGTATCTGGCACCCTGCCCTATCGAGCCCGGACTTTCGTCCGCTCGGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGtt < 7:179357/151‑1 (MQ=255) ccAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTg > 7:1545774/1‑151 (MQ=255) cAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTgc > 3:957086/1‑151 (MQ=255) cAGGC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTgc < 1:633992/151‑1 (MQ=255) ggC‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTgcgc < 2:852549/151‑1 (MQ=255) c‑GTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCa > 6:220662/1‑150 (MQ=255) c‑GTTATCTGGAACCCTGCCCTATGGAGACCCGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACCACGAAGCGGCCACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGAATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCCCa > 6:641732/1‑150 (MQ=255) | CCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGC‑GTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTC > NC_000913/3270349‑3270644 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |