| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,950,099 | C→T | intergenic (‑130/‑223) | yifB ← / → ilvL | magnesium chelatase family protein and putative transcriptional regulator/ilvG operon leader peptide |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,950,099 | 0 | C | T | 97.1% | 1490.9 / 16.7 | 448 | intergenic (‑130/‑223) | yifB/ilvL | magnesium chelatase family protein and putative transcriptional regulator/ilvG operon leader peptide |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/9); new base T (194/240); total (198/250) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 448 total aligned reads displayed.
GAACAATTGACAGTGACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGCTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCAAAA > NC_000913/3949951‑3950246 | aCAATTGACAGTGACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGc > 5:1265358/1‑151 (MQ=255) cAATTGACAGTGACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGc > 4:1225866/1‑150 (MQ=255) cAATTGACAGTGACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCa < 3:1429635/151‑1 (MQ=255) aGTGACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGCTCGCAAAAATGCa < 1:542306/151‑1 (MQ=255) gTGACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGc > 6:437063/1‑149 (MQ=255) gACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGc < 5:896528/150‑1 (MQ=255) aCATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCgg < 7:86048/151‑1 (MQ=255) aGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGc > 7:971233/1‑141 (MQ=255) aGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACaa > 5:1375455/1‑150 (MQ=255) gCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACaa > 7:197465/1‑149 (MQ=255) cccTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAgg > 1:1320731/1‑151 (MQ=255) cccTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATAATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAgg > 7:551598/1‑151 (MQ=255) cctcctTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGa < 7:1257086/151‑1 (MQ=255) cctTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGAt < 8:1414513/149‑1 (MQ=255) cctTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTACTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATg > 8:1178012/1‑150 (MQ=255) ttGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAAc > 5:1064102/1‑151 (MQ=255) tGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAAc < 7:771479/150‑1 (MQ=255) aGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTAc > 3:413801/1‑151 (MQ=255) aGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTAc < 2:292547/151‑1 (MQ=255) aCCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAgg < 3:587928/151‑1 (MQ=255) aCCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAgg < 8:827406/151‑1 (MQ=255) cATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGCACTACGAGGa > 8:206021/1‑150 (MQ=255) cATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGaa < 2:1316058/151‑1 (MQ=255) aTTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGa > 2:501632/1‑149 (MQ=255) ttATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATg > 6:1118614/1‑137 (MQ=255) aTGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAggg > 7:1546120/1‑150 (MQ=255) aTGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAggg < 3:290678/150‑1 (MQ=255) aTGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGa < 4:851518/151‑1 (MQ=255) tgtgCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTTGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGa < 2:941424/150‑1 (MQ=255) tgtgCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGa > 6:1543411/1‑150 (MQ=255) tgtgCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGa > 5:537907/1‑150 (MQ=255) gtgCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGaac > 4:149907/1‑151 (MQ=255) gtgCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGaac < 6:1204657/151‑1 (MQ=255) tAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACAt > 3:540008/1‑151 (MQ=255) atCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATAc > 1:322477/1‑151 (MQ=255) cGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTg < 3:1099214/151‑1 (MQ=255) gctgctGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTg > 8:1546743/1‑150 (MQ=255) gTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGa < 3:1583749/151‑1 (MQ=255) aGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAAt > 1:701024/1‑151 (MQ=255) cccGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAAttt < 5:753097/151‑1 (MQ=255) ccGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAAtttt > 6:753663/1‑151 (MQ=255) gCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAAtttttt < 8:717966/151‑1 (MQ=255) gCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAAtttttt < 1:1593761/151‑1 (MQ=255) cTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAAttttttt > 1:918701/1‑151 (MQ=255) aaTTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAAttttttt < 8:110411/149‑1 (MQ=255) aTTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTtcac > 6:823577/1‑151 (MQ=255) ttCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAATTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTtcact > 4:480158/1‑151 (MQ=255) tGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTcactcact > 4:692786/1‑151 (MQ=255) gAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTcactcact > 8:591519/1‑150 (MQ=255) atttttAGTGGCTGATTGCTGTTTATTTGTGCAAGGGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtat < 4:991932/149‑1 (MQ=255) aaTTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtat < 5:339771/151‑1 (MQ=255) aTTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtatt < 7:1069852/151‑1 (MQ=255) aTTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtatt < 4:1543426/151‑1 (MQ=255) aTTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtatt < 2:827237/151‑1 (MQ=255) tttAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtatttt > 2:1086833/1‑151 (MQ=255) tttAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtatttt > 2:414387/1‑151 (MQ=255) tttAGTGCCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtattt < 4:111462/150‑1 (MQ=255) aGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtattttatt < 4:392882/151‑1 (MQ=255) aGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGCTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtattttatt > 2:122592/1‑151 (MQ=255) gTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACtattttattt < 2:607146/151‑1 (MQ=255) ggCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTAttttt < 5:787545/151‑1 (MQ=255) gCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTAttttt > 3:916047/1‑150 (MQ=255) gCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTa < 7:1351905/151‑1 (MQ=255) tGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTat > 6:1353091/1‑149 (MQ=255) tGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTaa > 1:1000203/1‑150 (MQ=255) tGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTaa > 4:1264786/1‑150 (MQ=255) gATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTaaa < 8:445141/150‑1 (MQ=255) gATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTaaa > 7:1149297/1‑150 (MQ=255) gATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTaa < 2:731297/149‑1 (MQ=255) aTTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTaaaa > 1:851678/1‑150 (MQ=255) aTTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGAAGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTaaaaa < 5:231928/151‑1 (MQ=255) tCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTaaaaaa < 1:1482846/150‑1 (MQ=255) tGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAaacaac > 8:367220/1‑151 (MQ=255) tGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAaacaac > 7:1499804/1‑151 (MQ=255) ttATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAAcaacaa < 3:683808/150‑1 (MQ=255) ttATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAAt > 4:738051/1‑151 (MQ=255) tATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAAt < 1:1672751/150‑1 (MQ=255) ttGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTta < 6:273155/150‑1 (MQ=255) gtgCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTatat > 3:793866/1‑151 (MQ=255) gCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGCTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTg < 3:1277732/151‑1 (MQ=255) cAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTTGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGa < 4:81625/151‑1 (MQ=255) aaGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAGCATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGa > 1:1153973/1‑150 (MQ=255) aaGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGaa < 4:198792/151‑1 (MQ=255) aaGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGa > 4:1614209/1‑150 (MQ=255) aaGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGCTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGaa < 5:1556597/151‑1 (MQ=255) aGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTTGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGaaa < 7:922480/151‑1 (MQ=255) tGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAatt > 5:457700/1‑151 (MQ=255) agttgagttgTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAattatt < 8:1350758/151‑1 (MQ=255) ttgagttgTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAAttatta > 1:1232530/1‑150 (MQ=255) ttgagttgTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAAttatta > 3:1231226/1‑150 (MQ=255) tgagttgTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTaa > 5:1474912/1‑150 (MQ=255) gagttgTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTaaa < 6:924720/150‑1 (MQ=255) gagttgTTCTGGCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAAc < 7:1220790/151‑1 (MQ=255) ggCGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATaa < 7:65009/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGGAAAGATGGTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATaa < 5:997931/150‑1 (MQ=255) cGGTGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATaaaaa < 8:1533390/151‑1 (MQ=255) tGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCg > 3:1549415/1‑151 (MQ=255) tGGAATGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCg > 7:399002/1‑151 (MQ=255) aaTGATGTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGcc < 5:1183031/151‑1 (MQ=255) atgTTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCaaaa < 6:592834/151‑1 (MQ=255) | GAACAATTGACAGTGACATAAGCCCTCCTTGAGTCACCATTATGTGCATAAGATATCGCTGCTGTAGCCCGCTAATTCGTGAATTTTAGTGGCTGATTCCTGTTTATTTGTGCAAGTGAAGTTGAGTTGTTCTGGCGGTGGAATGATGCTCGCAAAAATGCAGCGGACAAAGGATGAACTACGAGGAAGGGAACAACATTCATACTGAAATTGAATTTTTTTCACTCACTATTTTATTTTTAAAAAACAACAATTTATATTGAAATTATTAAACGCATCATAAAAATCGGCCAAAA > NC_000913/3949951‑3950246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |