| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 292,433 | G→A | F172F (TTC→TTT) | yagK ← | CP4‑6 prophage; conserved protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 292,433 | 0 | G | A | 97.1% | 1387.0 / 19.2 | 409 | F172F (TTC→TTT) | yagK | CP4‑6 prophage; conserved protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/5); new base A (188/209); total (195/214) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.05e-01 | |||||||||||
Only 100 of 418 total aligned reads displayed.
CAAATAAGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGGAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCTGATCGTAATCCCCG > NC_000913/292285‑292580 | cAAATAAGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGaaa < 3:1168469/151‑1 (MQ=255)aaaaTAAGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTAGAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGaaa < 2:1494926/150‑1 (MQ=255) aaTAAGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGt > 4:748181/1‑151 (MQ=255) aaTAAGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGt > 7:1652668/1‑151 (MQ=255) aaTAAGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGt < 2:791205/151‑1 (MQ=255) tAAGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTc > 1:1459977/1‑150 (MQ=255) tAAGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTc > 7:923079/1‑150 (MQ=255) tAAGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTc > 6:1464703/1‑150 (MQ=255) aGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGt > 7:682172/1‑151 (MQ=255) tgCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGt > 1:1680147/2‑150 (MQ=255) ggCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGt > 2:970202/1‑150 (MQ=255) cTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACt > 5:1246927/1‑150 (MQ=255) ttCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTAt > 8:1666469/1‑151 (MQ=255) tctcACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTAt < 5:1139381/150‑1 (MQ=255) ctcACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTg > 5:1520788/1‑151 (MQ=255) cACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGGAAGTCAGTACTATTGgt > 1:1554959/1‑151 (MQ=255) aCTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGGAAGTCAGTACTATTGgtg > 6:1390703/1‑151 (MQ=255) aCTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGgtg > 5:667475/1‑151 (MQ=255) aCTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGgtg > 3:1011655/1‑151 (MQ=255) gagaAGGCGATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGgtgt < 2:1131877/149‑1 (MQ=255) gagaAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCt < 4:8774/151‑1 (MQ=255) agaAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTa < 7:2865/151‑1 (MQ=255) ggCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGcac < 2:1630471/151‑1 (MQ=255) ccATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACAt < 1:558188/151‑1 (MQ=255) cATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATa < 6:212166/151‑1 (MQ=255) cATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATa < 4:451881/151‑1 (MQ=255) tACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACtt > 5:359483/1‑151 (MQ=255) tACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACtt > 6:459740/1‑151 (MQ=255) aCCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACtt < 8:648939/150‑1 (MQ=255) aCCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTa < 1:644451/151‑1 (MQ=255) ccGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTAc < 3:1583563/151‑1 (MQ=255) cGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTAc > 2:1244771/1‑150 (MQ=255) gACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACCGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGAGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTAc > 5:1020022/1‑149 (MQ=255) aCTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCATCTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGt < 6:980672/151‑1 (MQ=255) aCTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGt < 6:1575959/151‑1 (MQ=255) attACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGtt < 3:767309/150‑1 (MQ=255) tACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAACCAGTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGGCTAGCACATACTTACAGttt < 8:148927/150‑1 (MQ=255) tACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGtt < 7:525723/149‑1 (MQ=255) aCAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTc > 8:1444934/1‑151 (MQ=255) cAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCa < 5:798133/151‑1 (MQ=255) cAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCa < 1:795429/151‑1 (MQ=255) gTTCGATTTGGCTACAGCCTATGTTAGGGTCTCCTTCACGAAACACTTTGCTTTGAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTTTCAGCGCGTGGTTGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATAGTTACAGTTTTCAgg < 3:671504/151‑1 (MQ=255) gTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAgg > 2:349674/1‑151 (MQ=255) gATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGaaaa < 6:859776/151‑1 (MQ=255) gATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGaaaa < 7:1490354/151‑1 (MQ=255) gATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGACTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTAAAGTTTTCAGGaaa > 1:395340/1‑150 (MQ=255) aTTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAAt < 7:801132/151‑1 (MQ=255) ttGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATg < 1:615799/150‑1 (MQ=255) ggCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGga < 8:795105/150‑1 (MQ=255) gCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGgacc < 7:568116/151‑1 (MQ=255) tACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGgacc > 8:746206/1‑149 (MQ=255) tACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGgacc > 5:1368467/1‑149 (MQ=255) aCAGCCGAAGTTCCGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGgacca < 2:516154/149‑1 (MQ=255) aCAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGgaccag < 1:751924/150‑1 (MQ=255) gCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGgaccagacca < 1:681017/151‑1 (MQ=255) ccGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGgaccagacc > 7:122298/1‑149 (MQ=255) ccGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGaccagaccag < 3:714046/151‑1 (MQ=255) gAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAggg > 8:1242829/1‑151 (MQ=255) tACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGAt < 6:1179020/150‑1 (MQ=255) aCGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGGAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCg > 5:1579280/1‑151 (MQ=255) aCGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATc < 4:1331041/150‑1 (MQ=255) gTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGCACAGGGTGATCGtct > 8:44183/1‑151 (MQ=255) gTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGtct < 4:1543557/151‑1 (MQ=255) cTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGtctctctc > 3:928304/1‑151 (MQ=255) tCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTcc > 2:276850/1‑150 (MQ=255) aaCTCTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCa < 7:1031485/151‑1 (MQ=255) aaCACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCa < 6:172377/151‑1 (MQ=255) aaCACTTTGCTTTCAACTATGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCa < 1:116512/151‑1 (MQ=255) cacTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAgg < 4:607146/151‑1 (MQ=255) acTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGGAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAggg < 6:1629450/151‑1 (MQ=255) cTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGgc > 1:957355/1‑151 (MQ=255) ttGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGGAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGgc < 1:491927/149‑1 (MQ=255) ttGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGgc < 6:697473/149‑1 (MQ=255) tGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGgcgc < 8:556964/150‑1 (MQ=255) gCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCt < 4:295836/150‑1 (MQ=255) gCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCt < 8:1009506/150‑1 (MQ=255) ttCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTa < 1:1226860/150‑1 (MQ=255) tGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTcc > 4:1168912/1‑151 (MQ=255) aGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCtgtg > 8:693181/1‑150 (MQ=255) aGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGa < 5:175154/151‑1 (MQ=255) ggTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGat < 6:418889/151‑1 (MQ=255) aGTCCAGTCGTGTTAAGAGCGCCTGGTAGTGCTGCTGAAAGTCTTTACTATTGGTGTCTAGCACATAGTTAGAGTTTTCAGGAAAATGGAACAGACCATGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGatca < 6:559378/150‑1 (MQ=255) gTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGatcatc > 2:609250/1‑151 (MQ=255) cAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCct < 3:392647/151‑1 (MQ=255) gggTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTa > 8:1094054/1‑149 (MQ=255) gTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGt > 3:881890/1‑151 (MQ=255) tAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGtt < 5:584000/150‑1 (MQ=255) tAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGtt > 4:515529/1‑150 (MQ=255) tAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTATAAGGtt > 3:1449471/1‑150 (MQ=255) aCAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGAGATCATCCCTCTAAGGTTATc > 6:1335743/1‑151 (MQ=255) cAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCg > 4:1606498/1‑151 (MQ=255) gcCTGGTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCt > 4:1077564/1‑151 (MQ=255) ggTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCTGAt < 1:1345475/150‑1 (MQ=255) ggTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCTGAt < 3:1643836/150‑1 (MQ=255) gTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCTGATCg < 8:1549343/151‑1 (MQ=255) gTAGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCTGATCg > 2:925393/1‑151 (MQ=255) aGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCTGATCGt > 8:1348140/1‑150 (MQ=255) aGTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCTGATCGt > 4:1483745/1‑150 (MQ=255) gTTCTGCTGAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCTGATCGTaa < 3:274988/151‑1 (MQ=255) gctgAAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCTGATCGTAATcccc > 3:511090/1‑151 (MQ=255) | CAAATAAGGCCTTCTCACTGAGAAGGCCATTACCGACTTACAGTTCGATTTGGCTACAGCCGAAGTTACGGTCTCCTTCACCAAACACTTTGCTTTCAACTTTGGTCAGGTAGTCCAGTCGGGTTAACAGCGCCTGGTAGTTCTGCTGGAAGTCAGTACTATTGGTGTCTAGCACATACTTACAGTTTTCAGGAAAATGGACCAGACCAGGGTGATCGTCTCTCTCCAGTCTCAGGGCGCTGTACCAGGCTCCTGTGATCATCCCTCTAAGGTTATCGTCCTGATCGTAATCCCCG > NC_000913/292285‑292580 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |