Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,271,130 | C→T | E914E (GAG→GAA) | uvrA ← | ATPase and DNA damage recognition protein of nucleotide excision repair excinuclease UvrABC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,271,130 | 0 | C | T | 97.4% | 1146.4 / 12.1 | 343 | E914E (GAG→GAA) | uvrA | ATPase and DNA damage recognition protein of nucleotide excision repair excinuclease UvrABC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/6); new base T (169/165); total (172/171) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.36e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.68e-01 |
Only 100 of 349 total aligned reads displayed.
GAAGAAAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCTGAATATCGGCG > NC_000913/4270982‑4271277 | gaagaaAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGAtttc < 4:845469/151‑1 (MQ=255) aagaaAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATTTcg > 5:694790/1‑151 (MQ=255) agaaAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAACGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTGTCTGGCGTACCGGAGACGAGGAGTTcgc > 3:1174211/1‑151 (MQ=255) aaaCGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATTTCgccgcc < 5:1311372/151‑1 (MQ=255) aaaCGTAAATTGCTGGTGCAACTATGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGACGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTATGGCGTACCGGAGACGAGGATTTCgccgcc > 6:948351/1‑151 (MQ=255) aaCGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATTTCGCCGcca < 1:60029/151‑1 (MQ=255) cGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATTTCGCCGccacc > 2:959135/1‑151 (MQ=255) tAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGCCGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATTTCGCCGCcaccac > 4:633267/1‑151 (MQ=255) 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ggCGTACCGGAGACGAGGATTTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGa < 3:335715/148‑1 (MQ=255) ggCGTACCGGAGACGAGGATTTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGa < 2:1269867/148‑1 (MQ=255) cGTACCGGAGACGAGGATTTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGt < 1:183338/151‑1 (MQ=255) aCCGGAGACGAGGATTTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGc < 4:118349/151‑1 (MQ=255) ccGGAGACGAGGATTTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCt < 1:837293/151‑1 (MQ=255) 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cGAGGATTTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCTGAATATc < 2:467041/151‑1 (MQ=255) gAGGATTTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCTGAATATCg > 7:754933/1‑151 (MQ=255) | GAAGAAAAACGTAAATTGCTGGTGCAACTCTGAAAGGAAAAGGCCGCTCAGAAAGCGGCCTTAACGATTACAGCATCGGCTTAAGGAAGCGTGCCGTGTGTGATGCTTCGCACTCCGCGACGGTTTCTGGCGTACCGGAGACGAGGATCTCGCCGCCACCACTGCCGCCTTCTGGTCCCAGGTCGACAATCCAGTCAGCGGTTTTGATCACGTCGAGATTGTGCTCAATCACCACAATGGTGTTGCCCTGATCGCGCAGTTTATGCAGTACGTCGAGCAGTTGCTGAATATCGGCG > NC_000913/4270982‑4271277 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |