| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,337,864 | C→T | V22V (GTG→GTA) | adiY ← | adi system transcriptional activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,337,864 | 0 | C | T | 97.6% | 1556.2 / 16.0 | 457 | V22V (GTG→GTA) | adiY | adi system transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/4); new base T (254/192); total (261/196) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 457 total aligned reads displayed.
TATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGAGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCAAATCCTCATACATGTACTCCTGAGTGCGAATAAAAGACCAGTTCTCGCTAAAGCAAAGCGATACCGGGAAATGGTTATATAATTGTATGATG > NC_000913/4337716‑4338012 | tATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGAGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTTAc > 8:564332/1‑151 (MQ=255) ttCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGAGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTTAccc > 4:986857/1‑151 (MQ=255) tCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGAGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTTACCCt > 5:1594473/1‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |