Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,414,625 | C→T | R117R (CGC→CGT) | aidB → | DNA alkylation damage repair protein; flavin‑containing DNA binding protein, weak isovaleryl CoA dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,414,625 | 0 | C | T | 97.9% | 1264.1 / 9.3 | 378 | R117R (CGC→CGT) | aidB | DNA alkylation damage repair protein; flavin‑containing DNA binding protein, weak isovaleryl CoA dehydrogenase |
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.52e-01 |
Only 100 of 404 total aligned reads displayed.
AATTATTGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGCGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTC > NC_000913/4414477‑4414774 | ttattGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCgtgcgg > 8:1420735/1‑151 (MQ=255) tattGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCgtgcggc > 6:431341/1‑151 (MQ=255) tattGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCgcgcgg < 2:948421/150‑1 (MQ=255) tattGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGGCTGGACGATCTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCgtgcgg < 8:248548/150‑1 (MQ=255) ttGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCgtgcggcgc > 1:327026/1‑151 (MQ=255) cTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGtttt > 5:771020/1‑151 (MQ=255) tACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGtttt > 5:1109988/1‑150 (MQ=255) tACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGtttt > 5:1074884/1‑150 (MQ=255) aCGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTa < 2:481370/150‑1 (MQ=255) cGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATg < 7:260029/151‑1 (MQ=255) tGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGtt > 7:795838/1‑150 (MQ=255) gcgcAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTAc < 2:1656974/151‑1 (MQ=255) cAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATg < 2:398456/151‑1 (MQ=255) 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aCGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAgg < 1:225067/151‑1 (MQ=255) cGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAggg > 1:437309/1‑151 (MQ=255) aTGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTc < 3:223865/151‑1 (MQ=255) gtgCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGt > 8:635671/1‑151 (MQ=255) gCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTa < 8:778997/151‑1 (MQ=255) 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agaagaCGCTCGCTCCGGCGCATTAGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTCAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCACGACTgg > 3:794902/1‑151 (MQ=255) gaagaCGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTgg > 5:1352107/1‑150 (MQ=255) aagaCGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGAc > 8:403335/1‑151 (MQ=255) gaCGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCa < 1:1434536/151‑1 (MQ=255) gaCGCGCGCGCCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGGTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGGCGTTATGTCCGATACCCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCa < 4:116275/151‑1 (MQ=255) gctcCGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCt < 8:234818/151‑1 (MQ=255) ccGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTAtt < 7:1226129/151‑1 (MQ=255) ccGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTAtt < 4:1355752/151‑1 (MQ=255) cGGCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTg > 7:1577447/1‑151 (MQ=255) ggCGCATTTGTGGCGCGTGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTg > 4:244749/1‑150 (MQ=255) 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gcgtgcgGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGAt < 5:62346/151‑1 (MQ=255) gcgcggcgcgTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATtc < 2:1345615/151‑1 (MQ=255) | AATTATTGCGCTACGATGCGCAAGGACGCCGTCTGGACGATGTGCGTTTTCACCCCGCCTGGCACCTGCTGATGCAGGCGCTATGTACCAATCGGGTGCACAATCTTGCCTGGGAAGAAGACGCTCGCTCCGGCGCATTTGTGGCGCGCGCGGCGCGTTTTATGTTACATGCGCAGGTTGAGGCAGGGTCGTTATGTCCGATAACCATGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTC > NC_000913/4414477‑4414774 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |