| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 311,717 | 0 | G | A | 97.1% | 1534.3 / 19.8 | 455 | intergenic (‑381/‑395) | ecpR/ykgL | putative transcriptional regulator for the ecp operon/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/8); new base A (203/238); total (209/246) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 489 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |