| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,517,355 | C→T | Q121Q (CAG→CAA) | fecR ← | anti‑sigma transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA‑bound ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,517,355 | 0 | C | T | 97.4% | 1436.7 / 15.2 | 428 | Q121Q (CAG→CAA) | fecR | anti‑sigma transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA‑bound ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (8/3); new base T (206/209); total (215/213) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.21e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 434 total aligned reads displayed.
GGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGCTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGC > NC_000913/4517207‑4517502 | ggACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGttgttg < 6:495423/151‑1 (MQ=255) acacGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGAc > 1:141053/1‑151 (MQ=255) acGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACgg > 6:1156379/1‑151 (MQ=255) cGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGCTGACGGc > 7:767039/1‑151 (MQ=255) ggAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGcg > 4:251605/1‑150 (MQ=255) ggAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCt > 3:1038636/1‑151 (MQ=255) cGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTGCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGc > 2:1142089/1‑151 (MQ=255) gTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAACCGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCCGCGTGCGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGcc > 6:666095/1‑151 (MQ=255) 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cGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTg > 3:1454936/1‑150 (MQ=255) tGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGAcg > 2:1546139/1‑151 (MQ=255) tGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGAcg > 8:499977/1‑151 (MQ=255) ggAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGAcg < 1:1594799/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGAcgg > 8:719994/1‑151 (MQ=255) aGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGAcggc < 3:308431/151‑1 (MQ=255) gggAGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGt > 6:277127/1‑151 (MQ=255) ggAGCCATCTTCCAGTTGTGGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTg < 5:1626508/151‑1 (MQ=255) aGCCATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTg > 1:76310/1‑149 (MQ=255) cATCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCg < 6:1308853/151‑1 (MQ=255) aTCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCgg > 8:656388/1‑151 (MQ=255) aTCTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCgg > 3:914826/1‑151 (MQ=255) cTTCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGCCCTTCGCCGGAGTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCGTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGt > 4:1670230/1‑151 (MQ=255) ttCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGt > 8:1230014/1‑150 (MQ=255) tCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCgg < 8:836474/147‑1 (MQ=255) tCCAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCgg < 8:1619911/147‑1 (MQ=255) gcAGTTGTTGTCGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGGAGACCTTCGGCTGTTTCCGACTGGCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAAGAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTTTc < 1:342446/150‑1 (MQ=255) cAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCg < 4:820008/151‑1 (MQ=255) cAGTTGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCg > 7:510153/1‑151 (MQ=255) cAGTGGTTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCg < 4:323945/151‑1 (MQ=255) gttgttGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTg > 2:459950/1‑151 (MQ=255) gttgttGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGGGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTg < 6:1246296/151‑1 (MQ=255) | GGACACGGAAGGGGCGTTGCAGGGCATCTTTCGCGGTAGTAATGGCGATTTCACCGTACCAGAGCCGGACGGTGCGCTGATGCGCATCAAAACGCACATCCGCCGCGCTTTGGGTATTCAGCGTGAGCAGGGAGCCATCTTCCAGTTGCTGACGGCTGACTGTGCCTTTGGCGGTGCGGTAATCTGCCCGCAGACCTTCGCCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGC > NC_000913/4517207‑4517502 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |