Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,585,673 | 0 | C | T | 97.7% | 1441.7 / 13.7 | 427 | W363* (TGG→TGA) | hsdR | endonuclease R Type I restriction enzyme |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.04e-01 |
Only 100 of 427 total aligned reads displayed.
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aGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGTCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTc < 8:682283/151‑1 (MQ=255) aGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGTCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTc < 8:427479/151‑1 (MQ=255) ggATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGTCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCAtt > 4:193626/1‑151 (MQ=255) aTTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTTGTGTCCTGTCAGCTGGTTTCATTCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGa < 7:1005186/151‑1 (MQ=255) ttttAAACGGTTGTTTTCCGCTGGTGTCCTTTCAGCTGGTTTCATACTCTTGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGa < 2:881522/150‑1 (MQ=255) tAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGTCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCt > 7:1429592/1‑151 (MQ=255) aaCCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGTCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTgg > 4:1445118/1‑151 (MQ=255) ccGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGTCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTCTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCg > 4:1104680/1‑151 (MQ=255) gttgttTGCCGCTGGTGTCCTGTCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCggg > 2:123647/1‑151 (MQ=255) gttTGCCGCTGGTGTCCTGTCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGaa < 1:607336/150‑1 (MQ=255) 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ccTGTCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTCGATATTGTTACg < 7:998488/151‑1 (MQ=255) cTGTCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTCGATATTGTTACGt > 5:1412720/1‑151 (MQ=255) | ACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTCGATATTGTTACGT > NC_000913/4585525‑4585820 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |