New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 696863 = | 146 (0.350) | 91 (0.230) +GAAGAAACAATC |
38/276 | 31.7 | 26.5% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
? | NC_000913 | = 697134 | 402 (0.950) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
TAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTA > NC_000913/696719‑697013 | tAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCt > 5:660729/1‑151 (MQ=255) aCTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTa < 6:1071986/151‑1 (MQ=255) aGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGATCCAGGGAATGCCGGTATCAAAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAGCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTg < 8:581929/151‑1 (MQ=255) cTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACACCCGCGGTGACGCGCTTAGTCGAAGAGACTCGCTGGGGTACCTgg > 1:769517/1‑150 (MQ=18) aGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGa > 3:556809/1‑150 (MQ=255) gCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACTAGCGCGGTGAAGCGATTAGGCGAAGCTCATGGCTCGGGTACCTGGAtaccctg > 2:1197555/1‑145 (MQ=17) tgttgaataataTGGCTGGGGTACCAGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAggg < 5:87848/139‑1 (MQ=255) aaattGGCTGGGGTACGTGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTgg < 2:1003179/125‑1 (MQ=255) tGGCTGGGGTACCAGGATTCGAACCTCGTATTGCTTTTATCATAATGCGGTGACTTAGAGCTTGTCTTTACCGCAATAACTGTGCGTTGAAGCGCGTACTCGTATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTAt < 4:890888/149‑1 (MQ=12) gttACCTGGATTCGCACCAGGGAATGCCGGTATCAAATACCGGTGCCTTACGGCTTGTCGATACCCCAATAACCGCGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCg < 4:948831/149‑1 (MQ=37) gctACCGGGATGCTAACCAGGGAATGCCTGTATCAACTCACGGTGCCTTACGGCGTGTCGATACCCAAAAAACCGCGCTCCGAACCGAGTTGTCTAATTAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCg < 5:628265/149‑1 (MQ=12) ccgaggATTCGAACCACGGAATGCCGGTATCATTATCTTTTTAATTATAGCTTGTCGATAGAGAAATAACCGTTCTGTGAAACTCTTTCGCTAATATTATGTCTTGGGTTCCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTg < 8:785883/147‑1 (MQ=2) ccgacgATGCGAACCACGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGt < 2:1118305/145‑1 (MQ=255) acgaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCATTTTTCTGTGACTTTCCGCTTGGCGATAGCTAAATAACGGGGCTGTGTAGCGCTTTCTAGTAGTAGATGGCTTGGTTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGt < 8:447610/146‑1 (MQ=12) acgaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCTGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATg > 1:239538/5‑101 (MQ=14) cccgctctcgcgacAGGCAATGCCGCTATCACAATCCGGTTCCTTACTGATTGTATATACCACACTAACCGGGCTGTGAACCTCTTACTCGAAGAAGATTGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGc < 4:261243/138‑1 (MQ=16) ccacgaatCGAACCACGGAATTCCTTTATCAAAAACCGGAGCCTTACCGCTTGTCGAGCGAGCAACACCAGTGCTGTGTTGCGCTTTCGCGAAGTACATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGc < 3:652926/144‑1 (MQ=9) ttCGAACCACGGAATGCCGGTATCATAATCCGGTGACTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACAGGGCTTTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAcc < 8:498128/140‑1 (MQ=37) tCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAGCAGGGCGGTGAACCGCGTACTCGAAGCAGCTGGATGCGGTACCTGGATTCGAACGAGGGAATGCCGGTATCAAAAAGCGGTGcgtgac > 5:913949/1‑144 (MQ=25) 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tCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAAACGGGCGCTGAAACGCGAACTCTAAGAAAATCGCTGCTGTAACTCGATTACAAACAGGCAATGCAGGAATCAAAAACCGCTGCGTTAACGCTAGCCCATACCCCaaaaca > 2:1511557/1‑145 (MQ=12) aaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTAAATCGAAGAAGATGGCTGGTTTACCTGGATGCGCACCAGGGAAGGCCCGTATAAAATACCGCTGCCTTACCGCTTGCCCATCCCGCATcact > 1:172412/1‑143 (MQ=255) tGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTgggg < 8:750588/68‑1 (MQ=255) ggcTTACGGCTTGGCGATACCCCAATAACCGCGCGGGGAACCGCGTAGTGTTCGTAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTg < 3:811391/149‑1 (MQ=18) ggcTTACCGCGTGGCGAGACCCCAAAAACCGGGCGGGGAACCGCTTACTCGAATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTg < 5:77003/149‑1 (MQ=21) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGACCCGGTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGCTTCGCACCAGGGAATGCCGGGATCAAAAACCGGTGCCTTCCCGCTTGGCGCTACCCCATCCGTACAACggtgtcgg > 6:450665/1‑144 (MQ=38) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAAGGTCTTACTCGaagaag > 7:45143/1‑57 (MQ=25) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGaagaag < 2:45304/57‑1 (MQ=255) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTCGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGCTGCCTTACCGCTAGGCGATACCCCATCCGTACAACGATTTCTg > 4:373018/1‑151 (MQ=255) ccTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTgg > 2:467094/1‑151 (MQ=255) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAGCCGGGCGGTGAACCGCTTAGTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTAGAACGCttggtcgt > 6:1176187/1‑145 (MQ=255) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt > 1:1162125/1‑151 (MQ=255) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTAATCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACAGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt > 3:397494/1‑151 (MQ=255) ttACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTg > 2:716341/1‑151 (MQ=255) ttACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTGTCTGGTg > 8:185/1‑151 (MQ=255) tACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATCCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCtcg > 8:1382354/1‑146 (MQ=255) aCCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGa > 2:1304993/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAAt > 8:1652577/1‑151 (MQ=255) cGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATg > 6:617992/1‑151 (MQ=255) gCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATgg > 6:517646/1‑151 (MQ=255) gttGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGt < 4:99605/150‑1 (MQ=255) cTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGCTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATgct > 3:1201997/1‑149 (MQ=255) 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cccaAATAACCGGGCGGGGAACCGAGTAGTGGTAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCTGTATCAAAAACCGGTGCGTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg < 3:875502/151‑1 (MQ=21) cccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 7:515466/1‑150 (MQ=255) ccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 7:77812/1‑149 (MQ=255) ccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCT‑GATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCgagc > 1:789279/1‑150 (MQ=255) cAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCgagc > 1:616197/1‑150 (MQ=255) aTAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACt > 6:661023/1‑151 (MQ=255) aTAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACt > 8:1247919/1‑151 (MQ=255) tAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACtt > 1:944589/1‑151 (MQ=255) tAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACtt > 1:1423365/1‑151 (MQ=255) cGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGCAc > 6:283507/1‑151 (MQ=255) 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ttttgttcttcgaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcg < 8:1493264/138‑1 (MQ=255) ttttttcttagaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcggc < 4:537258/141‑1 (MQ=255) ttgtaattagaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcggcg < 4:1286856/142‑1 (MQ=255) tgtttagtcgaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcggcg < 7:939815/141‑1 (MQ=255) gtgttcttcgaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGgcgc < 5:281583/142‑1 (MQ=255) 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tcttcgaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAGGACAGCGCTTTCGCGGTAATGGTGCGGACGTCGAGCCTTTACCTCGCACCCCTCGAGgcgcgtcc > 5:985197/6‑147 (MQ=2) tagtcgaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAg < 4:1146525/145‑1 (MQ=255) aagaagATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGcc > 4:1213691/1‑148 (MQ=255) agaagaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGa > 3:1167581/1‑150 (MQ=255) agaagaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGa > 2:303750/1‑150 (MQ=255) 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TAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTA > NC_000913/696719‑697013 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |