| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287084 | 175 (0.410) | 82 (0.220) | 34/260 | 31.9 | 26.2% | intergenic (+558/+3) | narI/tpr | nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit/protamine‑like protein |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 311 (0.850) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTT > NC_000913/1286935‑1287233 | gTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTAGAACCTTAGAGCAACCTTGTCATAATTACGCTCATGGGAAGAATATTTGAATGGG‑GAGTCGGTTGAGATTTAAAAAACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGCttg > 6:425855/1‑150 (MQ=2) ttGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGACGGATTACTcc > 3:1193834/1‑150 (MQ=255) ttGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgtcc > 3:435524/1‑146 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGGGGTGGGGGAAGGATTagaccc > 3:694790/1‑146 (MQ=255) gCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgc < 1:1252776/151‑1 (MQ=255) ccTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcg < 5:843306/151‑1 (MQ=255) ccTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCG‑GATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgtccctg > 5:1552841/1‑143 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGCGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgtccgggcgg > 5:1298240/1‑140 (MQ=255) ggCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCG‑GATTCGCTTGAAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaaacttcta > 4:204893/1‑138 (MQ=11) ggCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGTCAgtgcgg > 2:885173/1‑147 (MQ=255) cAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGCGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaaagatcggagcc > 3:984922/1‑136 (MQ=14) aaCGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTagagcggaagcggacc > 2:804848/1‑136 (MQ=255) aCGCTCTCTCGCTGGCGCTCCAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCt < 7:467494/151‑1 (MQ=255) gCTCTCTCGCTGACGCTCTAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTc < 6:830266/151‑1 (MQ=255) gCTGCCGCTCAAGGCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCtt < 5:1101857/149‑1 (MQ=255) cccgACGCGCGAGCCCCACCTTCGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATCCGCTTGAGAGGGACGGGAGACTTGACAGGTTCCGATCTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCg < 3:1166442/148‑1 (MQ=9) cTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAATCAGCTCTTCGAGCATCCCCCATccg > 4:639004/1‑149 (MQ=17) tGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGTACTCGCTGCGCGCATCCCCCTTcagt > 1:1052327/1‑148 (MQ=17) tGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCGTCGCCCTGCggg > 5:1419618/1‑151 (MQ=255) gtcGCTCAAGGCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGt < 3:1297553/149‑1 (MQ=255) aCGCTCGAGCCCAACCGAAGCCGCAGCTGCTGCTCCGTCGGCGCTTGTGTTGAATATTTTCTTGTG‑GCTTTGCTTGAGATTTCCGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTc < 1:345532/151‑1 (MQ=2) gCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGt < 5:795493/151‑1 (MQ=255) aGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCt > 5:411825/1‑151 (MQ=255) aaCCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGTTTGAGATTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGc < 8:1471684/151‑1 (MQ=16) ttgTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAAc < 6:809640/147‑1 (MQ=9) tggTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACg < 7:888969/148‑1 (MQ=2) tggTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAAc < 7:545200/147‑1 (MQ=21) cGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACt < 6:452285/102‑1 (MQ=255) gAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGctctct < 3:485749/151‑1 (MQ=40) gAAGCTTCACATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGATTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGctctct < 3:832660/151‑1 (MQ=255) aaGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCtctctc < 5:194642/151‑1 (MQ=40) aGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCg < 7:1445899/151‑1 (MQ=40) aGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCg < 4:412224/151‑1 (MQ=40) cgctcAGCCTTCCCCGCCTGGGCAGAATCTCTGATTGCG‑GACTCGCTTGATATTTAATTTTCTTTGGAAACCGATGGAGCTCTTCAAATCCTTACTCAGCGCTGCGCTCTTCGACGCTCTTGGGTTTT‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTg < 7:334923/149‑1 (MQ=2) gtgcgcgtccgctcGCATGGGCAGAAGCTGTCAGTGAG‑GATGCGGTTGTCAGTTCATGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTG‑CCTGTGGCAACGTTCTCTCGCtt < 2:81533/137‑2 (MQ=2) ccctCCTTCCCCGCATCGGCACAGTATTTCCTGGCG‑GTCAGCCGTGAGCGTTGACGCTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGgcg < 5:695602/148‑1 (MQ=11) ccgccaggcccggctGGGCAGAATATTTGAGTTCC‑GATGCGCTTGAGACTTCCGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGgcgc < 5:545963/137‑1 (MQ=11) ccgccTTCCCCGCCTGCGCAGAATATGTGA‑TGCGCTCTTCGCTTGAGAGTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGgcgc < 2:1120255/148‑1 (MQ=14) aacgcTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGgcgc < 2:1074147/147‑1 (MQ=255) aTCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTg < 6:1620785/146‑1 (MQ=18) ccTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGTTTGAGACTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGgc < 4:1061784/146‑1 (MQ=9) ccTCCCCCGCCGGGGCAGAATCTTTCATCGCG‑GATTCGCTTGAGTTTTTTTGTTGTTTGGACTCTCATGGTGTTGTCGCAATTATTACTCACTGTTGCGCTCGTCGCCCTTC‑TTCCGTTGTCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCg < 4:841461/151‑1 (MQ=255) cTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 8:588420/94‑1 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCGTCCCCCGTCGGGTCCTTG‑CCTGGGGCAACGCTCTCTCGGGGGCGCCCgcc > 2:1238234/1‑149 (MQ=14) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAg < 2:173424/150‑1 (MQ=255) cccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGATCTAAGAGCATCACCCTTCGGGACGTTT‑CCTGAGGCAAAGGTCTCTCGCTTTCGCACGAATcc > 4:258706/1‑150 (MQ=14) cccgcggCAGAATATTTTATTGCG‑GATTCGCGTGAGACTTCCGGCTGCTCTGTACTTCATGGTGGTGTGCGTTGTCTTATTCCGAGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAAc < 2:388369/146‑1 (MQ=2) aTGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑GCTGCGGCAACGCACTCTAGCGGGCGCTCGAGTGGAAcc > 4:902583/1‑150 (MQ=255) gttcctatctatTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGATTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAAcc < 5:1576033/140‑1 (MQ=11) gttctgAATATTTGATTGCG‑GATTCGGTTGAGAGTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTg < 7:636298/146‑1 (MQ=255) gggCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCtt < 6:76089/150‑1 (MQ=255) gggCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGTCAACGCTCTCTCGCTGGCGATCGAGTCGAACCTTg < 7:1586292/151‑1 (MQ=255) aGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCg < 8:1426809/151‑1 (MQ=255) ttGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaac < 3:1593747/68‑6 (MQ=255) tGATTTCG‑GATTCGCTTGAGATTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGTGGTATGGATTACTCTGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTtc < 8:1383932/150‑1 (MQ=11) gagtGCG‑TATTCGCTTGAGAGTTCAGGTACTTTTGAACGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCGCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTtctc < 4:967468/148‑1 (MQ=255) gg‑gATTCGTTTGAGACTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCt < 8:31344/150‑1 (MQ=9) cG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCTTCCCCCTTCGGGTCGTTT‑CCTGAGGCAACGCTCTCTCGCTATCGCTCGAATCGAACCTTAGTAGAAGGTTCTCAACCt > 6:1524995/1‑151 (MQ=14) g‑gATTCGGTTGAGAGTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCtt < 8:746996/151‑1 (MQ=255) g‑gATTCGCTTGAGAGTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTTGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCtt < 1:87276/151‑1 (MQ=255) ccaggcgtaaggcacttCAGGCCCTTCTGCTAGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTG‑CCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCtt < 1:209488/136‑1 (MQ=21) aTTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGGGGCAACGCTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTCGTCGAAGGTTCTCAACCt > 2:699747/1‑148 (MQ=14) ttCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCATGGTCGAAGCTTCTCATccatacc > 5:771502/1‑146 (MQ=255) cgtttGAGATTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTcccc < 7:1507527/147‑1 (MQ=9) tGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGGGGCAACGGTCTCTCGCTTGCGCTCGAATCGAACCTTGGTAGAAGGTTCTCATCCTTCCCCGCATg > 5:729908/1‑151 (MQ=14) gagaTTTCCGGGTCTTTTGAAAGTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCTCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATg < 7:439154/150‑1 (MQ=255) gagaTTTCAGTGTCTTTTGATAGTGATGGTGGTTGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCTTTTTTATGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTATCTCTCTGTCGCTCGAGTATTACCTTGGTCGAAGCTTCTCTTGCTTCCCCGCATg < 7:1052645/150‑1 (MQ=11) gagaGTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATgg < 1:1186624/151‑1 (MQ=255) gagaGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATg < 5:902243/150‑1 (MQ=255) agagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 4:771986/151‑1 (MQ=255) acttCAGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCa < 5:832544/149‑1 (MQ=25) acttCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCa < 5:1517713/149‑1 (MQ=255) ttCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAg < 6:1154803/150‑1 (MQ=14) cAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAat < 1:1441625/151‑1 (MQ=25) cTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGGCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTa > 3:1530640/1‑150 (MQ=2) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTaa < 4:1418202/149‑1 (MQ=38) gtatctgTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAAtt < 6:148856/144‑1 (MQ=255) gtGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAGTACTCACCGCTGCTCTCGTGGCGCTGCGGCGCGCTG‑CCGGGGGCAACGCGCAGGGGCTGCCGCTCGAGGCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAAt < 2:277983/148‑1 (MQ=2) ggAAAGGGATGGGGCCGGGGCAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCGCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGc < 3:1096608/150‑1 (MQ=11) aaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 2:129636/109‑1 (MQ=35) aGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGa < 8:423349/150‑1 (MQ=38) gTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAAttagatagg > 1:149147/1‑144 (MQ=9) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCg < 8:1534280/151‑1 (MQ=35) aTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCg < 6:544756/121‑1 (MQ=32) tggtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAAATGCGGATTCGtt > 2:158310/1‑151 (MQ=25) ggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTggg < 6:191373/150‑1 (MQ=38) tggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATACTTACCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTAGTTGGGaat > 6:60476/1‑150 (MQ=255) gggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGAGGATTCGTTGGGAAGt > 7:1181192/1‑151 (MQ=255) ggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGCACCTTGGTAGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGGAGtt > 5:1641247/1‑151 (MQ=255) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAg < 1:627366/151‑1 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg < 8:854218/151‑1 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg < 6:661001/151‑1 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAAACCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGGGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg > 2:596200/1‑151 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGCACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGCATATTTAATTGGGGCTTGGTTGGGAAGTTGAgggg > 3:456637/1‑150 (MQ=14) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGAc < 7:682531/151‑1 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGt < 1:1650141/143‑1 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGAc > 8:479594/1‑151 (MQ=255) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACCCTCTCTCCCGGGCGCGCGAGTCGAACCCTTGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCCCATGGGGAGAATATTTAATTGCGGCTTCGTTGGGTAGGTGACGGAc > 4:407643/1‑150 (MQ=14) ttACTCAGCGCTGGGGGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTGTCGCTGTCGCTCGAGTGGAACCTTCGTCGAAGCTTGTCATCCTTCGCCGCATGGGGATAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACt < 3:1216164/150‑1 (MQ=14) ttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtt > 6:139358/1‑151 (MQ=255) | GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCG‑GATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTG‑CCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTT > NC_000913/1286935‑1287233 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |