| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 1,674,769 | Δ12 bp | coding (857‑868/1035 nt) | tqsA → | pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 1674781 = | 2 (0.000) | coding (869/1035 nt) | tqsA | pheromone AI‑2 transporter | |||||
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GTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTCTGTTAAGCG > NC_000913/1674631‑1674930 | tcccgaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggct > 8:198835‑M2/151‑151 (MQ=255) cccgaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggctt < 7:873493‑M2/2‑1 (MQ=255) cccgaatattggttcaggcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggct < 7:601101‑M2/1‑1 (MQ=255) cgaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTc > 2:1391880‑M2/148‑151 (MQ=255) aatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTcc > 3:260964‑M2/146‑150 (MQ=255) atattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCcac > 4:1520537‑M2/145‑151 (MQ=255) attggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACAt < 4:890367‑M2/9‑1 (MQ=255) attggttcagtcctcgcggcaatcacccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgtttgtggttcttgcggtatatcttcttattaatctggtcttcggcaatcttctggagccgagtatcatgggtcTTTCCTCAt < 6:1194642‑M2/9‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |