| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,560,996 | 0 | G | T | 24.6% | 727.0 / 75.9 | 379 | intergenic (+98/‑372) | yffL/yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (148/137); new base T (31/62); total (180/199) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.89e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 385 total aligned reads displayed.
AAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGC > NC_000913/2560846‑2561146 | aaGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt < 5:1577793/151‑1 (MQ=255) tGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGTGTCAAAAGTTGCCGTTAAgg > 2:840838/1‑149 (MQ=255) gCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 1:1808925/151‑1 (MQ=255) gCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 2:288975/151‑1 (MQ=255) cAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 7:1292162/1‑151 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt < 3:1610098/151‑1 (MQ=255) cGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc > 6:419702/1‑150 (MQ=255) cGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCa < 8:1200889/151‑1 (MQ=255) gAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa < 7:970925/151‑1 (MQ=255) gAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa < 1:811235/151‑1 (MQ=255) aTACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaat > 3:1090692/1‑149 (MQ=255) tACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGAGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAATTTGCCTTTAAGGAGTGTCaaa > 4:820667/1‑149 (MQ=255) ccAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt < 7:1035443/151‑1 (MQ=255) attattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGCCGGGCAATGTTCACGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGCGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGCTGTCTCAAAAGATGACGTTAAGGAGGGACAAAAGTTgaacat > 6:97602/1‑146 (MQ=255) tattCAATCCGTAGAAACTGAAATTACGGAATCAGGCGGGGATTGTTCCGGCCTTTTGTTTGCGTTAATTCGATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGGCGTTTGTGGTGGGTGAAAAGTTCGCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 1:1015656/150‑1 (MQ=25) attCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGTCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg < 8:804635/151‑1 (MQ=255) ttCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGTGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGCTCAAAAGTTGAAGTTAAgg > 6:232743/1‑151 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGgggg < 1:327764/151‑1 (MQ=255) gCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt < 3:1309237/151‑1 (MQ=255) ccGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTGTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc < 7:380675/151‑1 (MQ=255) cGTACAACATGAAATAACGGAATCAGTCGTGCATTGTTACCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTACATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCa < 3:957309/151‑1 (MQ=38) cGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCa < 6:319312/151‑1 (MQ=255) cGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGTGTCAAAAGATgaagtgtagggggggc > 4:1081852/1‑135 (MQ=255) acaacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaa < 1:1374144/150‑1 (MQ=255) acaacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGGAAAAATTTGCCGTTAAGCTTGGTCAAAATTTGACGtgtagctggctgaaa > 1:1636001/1‑136 (MQ=255) caacaTGAAATAACGGAATCCGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg < 5:821218/151‑1 (MQ=255) caacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTAAAAATTTGCAGTTAAGGTGGGTCGAAAGTTTAAGTTAAGGTGGGTCaaaat > 2:740350/1‑150 (MQ=255) cacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGCCAATTTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGt < 1:16789/150‑1 (MQ=255) aTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTGAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGGGCTAAAGTTGCCTAgg > 7:270643/1‑150 (MQ=255) tAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGTCAAAAGTTGCCGGTAAGGTGGGTCTAAAGTTGCCGAGt > 5:769608/1‑150 (MQ=255) aaCGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGACGAGTa > 5:1024273/1‑150 (MQ=255) cGGAATCAGGCGGGCAATTTTCCCGCCTTTTGTTTGCCTTAATTACATGAATTCAGGGGGGTCAAAAGTAGCCGTTAGGGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGa < 5:781684/151‑1 (MQ=38) cAGGCGTGCATTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTct < 6:1819578/150‑1 (MQ=255) cgtagggCATTTTTCCCGGCCTTTGTATGCCATTATTTAATGAATTCTGGTGGGTAAAAATTTGGCCTTACTGGTGGGTCAATAGTTGCCTTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctac < 6:1487906/147‑1 (MQ=16) aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAATTTGCCGTGAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGTCGCAAAAGTTGCCTAGTAAGCAGTctac > 2:1336450/1‑151 (MQ=38) aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGGCAAAATTTGACGAGTAAGAATTcga > 4:1749050/1‑148 (MQ=255) aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGACGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGCCTAGTAAGAATTcta > 3:47102/1‑150 (MQ=255) ccGGGCACTCTTCCAGCCGTATGTTTTCCTTAAATCAATGAATTCAGGTTGGTAAAAATTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTTAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctacta < 2:377076/150‑1 (MQ=21) cGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGCTCAAAAGTTGCCGTTACTGTTGGGTAAAACTTTGCCGTTAAGGAGGCTAAAAATTTGAAGTTTACGGGGGTCAAAAGTTGACGAGTAAGAATTcttcaat > 4:693050/1‑146 (MQ=255) gcagtcttCCAGCCTTTTCTTTGCCTTAATTTACTGCAGTGTGTGGGGTCAAAAGTAGCCGTTCTTGGTGGGTCTAATGATGCAGTTAAGTTGGGTCAAAAGTTGCAGTTCAGGTGTGTCAAAAGTTTCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa < 6:703290/145‑1 (MQ=255) gatttcttcctgtattttcttttcCTTTAATCAATGAATTCATGTGTGTAAAAAGTTGCCTTTAGTGTTGGGTCAAAAGTTGCCTTTATGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTa < 2:599972/136‑1 (MQ=21) gCAATGTTCCCGCCTTTTGTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGGGGGTCAAAAGTAGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa < 1:341176/151‑1 (MQ=255) gCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGTGTGAAAAGTTGCCGAGAAAGAATTCTACTATTa > 3:269888/1‑150 (MQ=255) gCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAATTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGACGTTAAGGTGGGGCAAAATTTGCAGAGAAAGAATGCTACAAtat > 3:740362/1‑148 (MQ=37) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAATGTAGCCGTTAAGCTGCGTCAATAGTTGGCGTTAAGGTGGGTCAAAAATTGCCGAGTAAGAATTCTAATATTaatatt > 3:606400/1‑147 (MQ=38) ttCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTATAGGAGGCTCAATAGTTTAAGTGAAGGTGGGTCAAATTTTGACTAGTAACGAATCTACAATTAAAAAtt > 6:835487/1‑150 (MQ=19) ttCCAGCCTTACCTTTGCCTTAATTACATGAATTCAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGCTAAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAAtt < 1:446397/150‑1 (MQ=38) tCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGCATTAAAGGTGGGGCAAATTTTGAAGAGTAACAATTGTAATATTATGAATTCt > 2:1558438/1‑151 (MQ=21) cccGCCTTTTCTTTCCCTTAATTCAATGAATTCCTGTGGCTCAAAAGTAGCCCTTCGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 3:381463/151‑1 (MQ=37) aaggcTTTTGTTTTCCTTTATTTAATGAATTCATTTTGGTTAAAATTTGGCTTTATTGGTGGGTATATTGTTGCCTTTTATTTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 4:445416/146‑1 (MQ=16) agCCTTTTCTTTGCCTTAATTACATGAATTCAGGTGTGTCAAAAGTTGCCTTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAgg < 6:1017831/150‑1 (MQ=255) ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACGATTATCATTTATAGGCgcc > 7:1091787/1‑149 (MQ=37) tttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGCGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCCACGGGat > 7:610609/1‑150 (MQ=255) tGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAATAGTTGCCGTGAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACGATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGtt > 6:1644120/1‑151 (MQ=255) cataaataaaTGAATTCCGGGGGGTAAAAAGCAGGCTTTAGTGGTGGGTAAATACCTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGttttt < 5:1688794/142‑1 (MQ=25) cTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATAGTGGTGTGTCAAAATTTGCCTTGAAGGAGAGTCCAAATTTGCAGATAACCGGGGGGAAAATTTGAATAGAAAGAATTGTAAGATAAAAATTTCTAggacacgtgatatttt > 8:1496110/1‑137 (MQ=255) tAAATCCAGGAATTCAGGGGGGCCAAAAGCTGCCGTTAGGGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGGTGCCCTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGtttttt < 3:83257/150‑1 (MQ=37) tcaaTGAATTCAGGTGGGTCAAAAGCTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGCTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGcc < 3:1403626/147‑1 (MQ=255) ccATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGAGGGTCAAAATTTTAAGTTAAGGTGTCGGTAATTTTGCCGAGGAACCCGTCTACTATTAAGATTTCAAGCCGCGGCCAGTATTTAAGCCTc > 5:1866195/1‑151 (MQ=12) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGCTGGCGTTAGGGGTGGGTCAAAAGGTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTcc < 1:748478/151‑1 (MQ=255) aaTTCAGGTGGGTAAAAATAAGCCGTTACGGGTGGGTAAATAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggt < 1:1096177/151‑1 (MQ=37) aTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGTGTCAAAATTTGGCGTTAAGGTGGGTCTAATTTTGCATAGTAAGAATTCTACAATTAAGAATTGTAGGCGACGTGAGTTTTTTAGcgttacgg > 4:344552/1‑142 (MQ=255) aTTCAGGAGGGTTAAAATCTGCCGTTACTGGTGGGTAAATTGTTGCCTTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggtc < 1:207296/151‑1 (MQ=37) tCAGTTGGGGCAAAAGTTGCCGTTACTGGGGGGTCAAAAGCTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggtcg < 1:1479130/150‑1 (MQ=38) ggggTGAAAATTAGCGGTTATGGGTGGGTATAATGTTGCCTTTTATTTGCGTCAAATGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATa < 3:1241870/150‑1 (MQ=255) ggTCAAAATTAGCCTTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATag < 8:649492/150‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagag < 5:300156/151‑1 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTGAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagag > 8:1687091/1‑149 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGCCGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagag > 1:1263589/1‑149 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagag > 6:582326/1‑149 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGACTAACGGTCGGTCATagag > 6:78460/1‑149 (MQ=255) aaaaGTTGCCCTTAGGGGTGGGTCAAAAGGTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGt < 1:1022005/151‑1 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTc > 4:1668204/1‑151 (MQ=255) aagtatgctttATTGGTGGGTAAAATGTTGCCTTTAAGTTGGGTAAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCg < 4:1460421/142‑1 (MQ=38) aaGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTGAAAATTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACTGAAGTTTTTAAGCCTACCGGTCGGTCATAGAGAGTCg > 8:377429/1‑151 (MQ=38) tGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGGTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt > 6:1190285/1‑150 (MQ=255) cgCCCTTAGTGGTGGCTCAAAAGGTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTa < 5:600648/150‑1 (MQ=255) ggcGTTAGGGGTGGGTCAAATCTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTag < 5:491731/149‑1 (MQ=255) gctttAGGGGGGGGTCAAATGTTGCCGTTAATGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 8:134838/148‑1 (MQ=255) cGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGGCGGGAGTTTTTTAGCCTCGCGGTCGCTCATAGAGAGTCTCGTag > 4:1281380/1‑149 (MQ=255) gTTACTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGGTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGt < 5:1372343/151‑1 (MQ=255) gtggtgGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaa > 6:134052/1‑150 (MQ=255) gttgggtattttgTTGCCTTTTAGTTGGGTTAAATGTTTGATTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc < 2:1194624/138‑1 (MQ=255) ggtgggtaatttgTTGCCTTTAAGTTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc < 8:1063823/138‑1 (MQ=39) ggtggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc > 4:1544873/1‑150 (MQ=255) gtggGTCAATAGTTGGCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACa < 3:1778563/150‑1 (MQ=255) ggggTCAGATGCTGCCGTTACTGTGCGTTAAAACCTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACaga < 7:1488518/150‑1 (MQ=255) tCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCGGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaaga > 8:2581/1‑150 (MQ=255) aaaaGTTGCCGTTAAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAATGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAatt < 6:1445519/151‑1 (MQ=255) ataGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAatta < 4:268403/149‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattat > 5:1216674/1‑151 (MQ=255) aGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattatt > 7:1843006/1‑151 (MQ=255) ttGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTTGCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTAttt < 2:667882/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCCGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcg > 7:1637446/1‑151 (MQ=255) gCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgc > 2:1478865/1‑151 (MQ=255) ccGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgcc > 3:1021093/1‑151 (MQ=255) cGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgccg < 8:58241/151‑1 (MQ=255) cGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTAGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCCCTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTGAAACAGAACAATTATTTcgccc > 7:661530/1‑150 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgccgc > 2:1043535/1‑151 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgccgc > 8:1774500/1‑151 (MQ=255) | AAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGC > NC_000913/2560846‑2561146 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |