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aGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTTTTCATACCGATGGATTattt > 2:90195/1‑148 (MQ=255) aGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACtg > 2:156452/1‑151 (MQ=255) aGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACtg > 8:900844/1‑151 (MQ=255) gACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTgtgg < 4:357357/151‑1 (MQ=255) gACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTgtgg > 5:1562762/1‑151 (MQ=255) ttGTTCGCACCTTCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGc > 8:1048917/1‑151 (MQ=255) gTTCGCACCTTCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCa < 2:247935/150‑1 (MQ=255) ccttccttAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGtt < 2:701068/151‑1 (MQ=255) tccttAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGt < 2:802747/150‑1 (MQ=255) tccttAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGt > 3:1545762/1‑150 (MQ=255) tccttAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGAACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGt > 5:1296424/1‑150 (MQ=255) ccttAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTAc > 2:1436491/1‑151 (MQ=255) | ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTAC > NC_000913/688902‑689194 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |