| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,673,557 | Δ120 bp | intergenic (‑56/‑237) | mdtJ ← / → tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673556 | 1 (0.000) | 377 (0.930) | 218/296 | 0.0 | 99.5% | intergenic (‑55/‑357) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673677 = | 3 (0.010) | intergenic (‑176/‑236) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 390 total aligned reads displayed.
TTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTC > NC_000913/1673527‑1673827 | ccatttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaat > 8:23502‑M2/151‑151 (MQ=255) ttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTa < 6:1528350‑M2/4‑1 (MQ=255) tccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGt > 1:601169‑M2/146‑148 (MQ=255) tccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAg < 4:1358093‑M2/5‑1 (MQ=255) ccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGaa < 3:250065‑M2/7‑1 (MQ=255) ccctcactgacgctcgcccatttcatagacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagcaagccctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattatttaaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGa > 8:831847‑M2/145‑150 (MQ=255) cactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGaaaa < 6:82099‑M2/9‑1 (MQ=255) cactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATa < 3:922816‑M2/11‑1 (MQ=255) cactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATa < 1:516903‑M2/11‑1 (MQ=255) tgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACg > 8:1349878‑M2/138‑151 (MQ=255) tgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACg > 6:274386‑M2/138‑151 (MQ=255) gacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACg < 2:1382204‑M2/14‑1 (MQ=255) gctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcatgcaagagaattattttaattttctcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAAAGtca > 6:1193748‑M2/134‑149 (MQ=255) cgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGa < 4:112801‑M2/20‑1 (MQ=255) gcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAAc < 4:467815‑M2/22‑1 (MQ=255) cccatttcatttacagcttacaggttatttctgtatcaatatccagatctaataaaatcatataaatatacattttccttctccttcaagagaattattttaattttcgcttaattcatcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACa < 7:220258‑M2/23‑1 (MQ=255) ccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACa > 1:375318‑M2/128‑150 (MQ=255) catttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACaaa < 6:1404377‑M2/25‑1 (MQ=255) catttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACaa > 4:287006‑M2/127‑150 (MQ=255) atttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAAt < 2:1555235‑M2/26‑1 (MQ=255) tcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGt > 6:44697‑M2/123‑151 (MQ=255) cattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTc < 5:1080886‑M2/30‑1 (MQ=255) cgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATAtt > 5:1525277‑M2/113‑151 (MQ=255) gtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATAtt > 1:258817‑M2/112‑150 (MQ=255) ggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAAtt < 4:1418825‑M2/45‑1 (MQ=255) gtaatttctgtagaaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAAtt > 5:141388‑M2/106‑150 (MQ=255) aatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATc < 3:549547‑M2/48‑1 (MQ=255) atttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATcc > 5:380603‑M2/103‑151 (MQ=255) ttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCg < 7:451842‑M2/50‑1 (MQ=255) tgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAgt > 5:1351219‑M2/98‑151 (MQ=255) gtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCa < 3:739474‑M2/52‑1 (MQ=255) gtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAg < 6:609071‑M2/53‑1 (MQ=255) tagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgctaaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAgtgt > 8:610013‑M2/96‑151 (MQ=255) agcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGtt < 8:383702‑M2/57‑1 (MQ=255) agccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTtct > 3:1439914‑M2/89‑151 (MQ=255) agccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTtct < 8:1169708‑M2/63‑1 (MQ=255) cccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTtctc < 5:711573‑M2/64‑1 (MQ=255) ccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCg > 1:1407257‑M2/87‑151 (MQ=255) ccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCg < 1:430528‑M2/65‑1 (MQ=255) cagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGt > 3:357495‑M2/86‑151 (MQ=255) acctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCAt > 3:891132‑M2/83‑151 (MQ=255) cctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATc < 2:1287201‑M2/70‑1 (MQ=255) aataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcgc < 4:1532878‑M2/72‑1 (MQ=255) ataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCgg > 7:1379703‑M2/78‑151 (MQ=255) aaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGgat > 7:1030780‑M2/76‑151 (MQ=255) aaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGgatg > 1:1483328‑M2/75‑151 (MQ=255) atccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGgatgat > 3:1342039‑M2/73‑151 (MQ=255) aataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAAtt > 8:1014841‑M2/69‑151 (MQ=255) ataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaggaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTg < 7:831028‑M2/84‑1 (MQ=255) aaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTc > 5:59219‑M2/66‑151 (MQ=255) aatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTcc > 8:333042‑M2/65‑151 (MQ=255) atatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCt > 2:900576‑M2/64‑151 (MQ=255) atatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCt > 5:1295707‑M2/64‑151 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCg > 5:921116‑M2/62‑151 (MQ=255) tgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGtt > 5:1154673‑M2/56‑151 (MQ=255) ccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcaccgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGa < 7:1391783‑M2/98‑1 (MQ=255) cttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAac > 4:648332‑M2/52‑151 (MQ=255) cttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAac > 3:619414‑M2/52‑151 (MQ=255) ttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGATTCTCGTCATCTCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAac > 8:1553920‑M2/51‑150 (MQ=255) tctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAacac > 6:101031‑M2/50‑151 (MQ=255) tctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAac < 3:454130‑M2/100‑1 (MQ=255) tctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaCGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAac < 4:890912‑M2/100‑1 (MQ=255) cctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGcc < 1:76446‑M2/105‑1 (MQ=255) caagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAt > 4:1252762‑M2/43‑151 (MQ=255) caagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAt > 8:1266263‑M2/43‑151 (MQ=255) agagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAttt < 7:55924‑M2/111‑1 (MQ=255) agaattattttaattttcggttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACTTACTTAAGAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGAGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGt < 3:1524327‑M2/113‑1 (MQ=255) agaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGt > 7:590530‑M2/39‑151 (MQ=255) gaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTa < 3:830002‑M2/114‑1 (MQ=255) aattattttaattttcgcttaattcagctaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAAGAAATTCTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATATTTGTCCTCGGTAGTTGAACACGACTGATTTGTa < 6:218567‑M2/114‑1 (MQ=255) tattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCa < 5:784381‑M2/117‑1 (MQ=255) tattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCa < 4:1044650‑M2/117‑1 (MQ=255) tattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCa < 3:1036696‑M2/117‑1 (MQ=255) tattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCAt > 1:1199660‑M2/34‑151 (MQ=255) tattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGGGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCa < 5:217083‑M2/117‑1 (MQ=255) ttttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCAGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGATTGTCGTCATCGCGGATGATATTTGTCCTCGGTAGTTGCACACGCCGGATTTGTATCAt > 8:863345‑M2/32‑149 (MQ=255) ttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGc < 1:1570123‑M2/121‑1 (MQ=255) aattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTa < 3:1172075‑M2/124‑1 (MQ=255) attttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTaa < 1:1082848‑M2/125‑1 (MQ=255) attttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTa > 1:870772‑M2/27‑150 (MQ=255) ttttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTa > 2:824713‑M2/26‑149 (MQ=255) tttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTa > 2:1039850‑M2/25‑148 (MQ=255) taattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAAc < 2:603932‑M2/133‑1 (MQ=255) taattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAAc < 3:986818‑M2/133‑1 (MQ=255) taattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACt > 7:701136‑M2/18‑151 (MQ=255) aattcagcgaaagcaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTc < 4:938798‑M2/135‑1 (MQ=255) aattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACt < 6:1633568‑M2/134‑1 (MQ=255) aattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACt < 4:1630231‑M2/134‑1 (MQ=255) tcatcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCaa < 5:551317‑M2/137‑1 (MQ=255) cagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATAAACTCaaa > 7:1093814‑M2/13‑150 (MQ=255) gcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAata < 6:347882‑M2/141‑1 (MQ=255) gaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAtt > 7:348074‑M2/9‑151 (MQ=255) gaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAtt > 7:129041‑M2/9‑151 (MQ=255) aaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAttt < 3:1455180‑M2/144‑1 (MQ=255) aaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAtttt < 4:565162‑M2/145‑1 (MQ=255) accaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTc < 3:138788‑M2/146‑1 (MQ=255) ccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTc > 8:930976‑M2/5‑150 (MQ=255) aaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACt > 8:1069024‑M2/3‑151 (MQ=255) aTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACtt < 2:463724‑M2/150‑1 (MQ=255) aTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACtt < 7:156463‑M2/150‑1 (MQ=255) | TTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTTC > NC_000913/1673527‑1673827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |