| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 446 total aligned reads displayed.
GCGGGAGCGTTTTACTGTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCA > NC_000913/3393666‑3393965 | ggggAGCGTTTTACTGTCTGCCGACCATATAGCTCGATCGAGCGTCATCTTTTGACCGAGCTAGCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCTGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAAATTTTACCGCt < 6:1405943/150‑1 (MQ=255) gcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCt < 1:639628‑M2/2‑1 (MQ=255) cggGAGCGTTTTACTGTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCt < 3:593008/151‑1 (MQ=255) cggGAGCGTTTTACTGTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCt > 7:1230670/1‑151 (MQ=255) cggGAGCGTTTTACTGTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCt < 8:1304274/151‑1 (MQ=255) gacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGTg > 4:867428‑M2/146‑151 (MQ=255) acaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGTgg > 2:120883‑M2/145‑151 (MQ=255) cGTTTTACTGTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAgggaa < 1:522785/151‑5 (MQ=255) aaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGTGGt < 1:167784‑M2/8‑1 (MQ=255) aagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgcaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGTGGtt > 7:989384‑M2/143‑151 (MQ=255) tttACTGTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTc < 8:1491135/150‑1 (MQ=255) ttACTGTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCa < 4:965149/150‑1 (MQ=255) aaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtgggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaatcatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGTGGTTCAcc < 3:24786‑M2/13‑1 (MQ=255) aaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGTGGTTCAcc > 1:1135178‑M2/139‑151 (MQ=255) aatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGTGGTTCAccc > 6:979465‑M2/138‑151 (MQ=255) cTGTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCg > 3:727781/1‑151 (MQ=255) gTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCg < 5:855826/149‑1 (MQ=255) gTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGc < 1:1230484/150‑1 (MQ=255) 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gatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAGGGCAGATCAATGccc > 4:234471‑M2/33‑151 (MQ=255) gTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGc < 3:954679/149‑1 (MQ=255) gaTTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACttt > 2:756337/1‑151 (MQ=255) ttGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGTTCCCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGACCACTTTAc > 1:264013/1‑151 (MQ=255) tatcagggacttgttcgcaccttccCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTAc > 4:481843‑M2/26‑151 (MQ=255) gCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTAcc > 1:914584/1‑150 (MQ=255) ccATCTACCTTATCTTTTAGCGCTAGTGGTTCTCCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTTAGTGACTGCTCACATTCTTTATATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGGCCACTTTACCAt < 5:444342/151‑1 (MQ=255) gacttgttcgcaccttccCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCcca < 3:344569‑M2/133‑1 (MQ=255) cAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATccc > 7:1179742/1‑150 (MQ=255) ttgttcgcaccttccCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCccacgc > 1:1012647‑M2/16‑151 (MQ=255) gttcgcaccttccCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCGCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTTCCATCccacgcca < 4:1042465‑M2/138‑1 (MQ=255) aaCGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCccacgccac < 7:563591/150‑1 (MQ=255) aCGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCcacgccacgc < 7:1486736/151‑1 (MQ=255) cGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCt > 1:1156939/1‑151 (MQ=255) gTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGAGCGCCGTGCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTg < 1:1101651/151‑1 (MQ=255) cggtACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGCAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTg < 2:872912/148‑1 (MQ=255) tttACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGc > 1:778252/1‑151 (MQ=255) accttccCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGc > 5:956525‑M2/8‑151 (MQ=255) tACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGcc > 5:370127/1‑150 (MQ=255) tccCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACt > 3:1065479‑M2/4‑151 (MQ=255) gCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTTACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCa < 6:576198/151‑1 (MQ=255) cCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCCTCCCCCGCCCCGCTGCCACTc > 8:380297‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCGGGAGCGTTTTACTGTCTGCCGCCCAAATAGCACGATCGAGCGTCAGCTTTTGACCGAGCAACCAGCGGCTATTGAAATGATTATCCGCACCAGCCTGTCCGGTTAATTCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCA > NC_000913/3393666‑3393965 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |