| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.54e-02 | |||||||||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
CCCGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTT > NC_000913/1674620‑1674920 | cccGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGt > 4:433390/1‑151 (MQ=255) aaTATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGc > 5:1373903/1‑151 (MQ=255) gTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCt > 3:457937/1‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |