| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 821,444 | 0 | G→T | 12.6% | 40.0 ‑48.9 0.0 | 502 | G218W (GGG→TGG) | ybhM | BAX Inhibitor‑1 family inner membrane protein |
| Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (63/0): ref base (185/253): total (248/254) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.01e-22 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 512 total aligned reads displayed.
CGTTTTATCATTATGATGACGTTGACAGGGTTGGCCCTGGTAATCATCGTGAATGCGGCATTAATGAGTGAACGGCCCATTTGGATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGAATTGGCGGGGAAATGCCATAGTGAAGAGTTGTGGAGTCCGGTTCGTTGCGCTTTTACAGGTGCATTAACACTCTATTACTATTTTATCGGCTTCTTTGGGATACTTGCCGCGATAGCTATAACGCTTGTCTGGCAAAGGCATACGC‑GTTTTTTTCATT‑AG‑CCGTAAATGCACATACTAAAGAACTTAACTAAACTTCACATCGCCGCTTCATTTTTCGCCCGTAGCTTCTTCGCCTGGCTTTCCAGCAACAGGTAACAGATCAGCGCCAGCAGCAGTGGGATAAAGTAATACAGCACACGGTAAGCGAGTAGGGCGGCGATAATTGTACCTTTGGAGGTATGCTCCC > NC_000913/821195‑821693 | cGTTTTATCATTATGATGACGTTGACAGGGTTGGCCCTGGTAATCATCGTGAATGCGGCATTAATGAGTGAACGGCCCATTTGGATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGAATTGGCGGGGAAATGCCATAGTGAAGAGTTGTGGAGTCCGGTTCGTTGCGCTTTTACAGGTGCATTAACACTCTATTACTATTTTATCGGCTTCTTTgg < 2:832804/251‑1 (MQ=255) 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aTTACTATTTTATCGGCTTCTTTGGGATACTTGCCGCGATAGCTATAACGCTTGTCTGGCAAAGGCATACGC‑GTTTTTTTCATT‑AG‑CCGTAAATGCACATACTAAAGAACTTAACTAAACTTCACATCGCCGCTTCATTTTTCGCCCGTAGCTTCTTCGCCTGGCTTTCCAGCAACAGGTAACAGATCAGCGCCAGCAGCAGTGGGATAAAGTAATACAGCACACGGTAAGCGAGt < 1:2408207/236‑1 (MQ=255) aTCGGCTTCTTTGGGATACTTGCCGCGATAGCTATAACGCTTGTCTGGCAAAGGCATACGC‑GTTTTTTTCATT‑AG‑CCGTAAATGCACATACTAAAGAACTTAACTAAACTTCACATCGCCGCTTCATTTTTCGCCCGTAGCTTCTTCGCCTGGCTTTCCAGCAACAGGTAACAGATCAGCGCCAGCAGCAGTGGGATAAAGTAATACAGCACACGGTAAGCGAGTAGGGCGGCGATAATTGTACCTTTGGa > 1:883236/1‑251 (MQ=255) cGGCTTCTTTGGGATACTTGCCGCGATAGCTATAACGCTTGTCTGGCAAAGGCATACGC‑GTTTTTTTCATT‑AG‑CCGTAAATGCACATACTAAAGAACTTAACTAAACTTCACATCGCCGCTTCATTTTTCGCCCGTAGCTTCTTCGCCTGGCTTTCCAGCAACAGGTAACAGATCAGCGCCAGCAGCAGTGGGATAAAGTAATACAGCACACGGTAAGCGAGTAGGGCGGCGATAATTGTACCTTTGGAgg < 2:5636181/251‑1 (MQ=255) cGGCTTCTTTGGGATACTTGCCGCGATAGCTATAACGCTTGTCTGGCAAAGGCATACGC‑GTTTTTTTCATT‑AG‑CCGTAAATGCACATACTAAAGAACTTAACTAAACTTCACATCGCCGCTTCATTTTTCGCCCGTAGCTTCTTCGCCTGGCTTTCCAGCAACAGGTAACAGATCAGCGCCAGCAGCAGTGGGATAAAGTAATACAGCACACGGTAAGCGAGTAGGGCGGCGATAATTGTACCTTTGGAgg < 1:3899079/251‑1 (MQ=255) tcttTGGGATACTTGCCGCGATAGCTATAACGCTTGTCTGGCAAAGGCATACGC‑GTTTTTTTCATT‑AG‑CCGTAAATGCACATACTAAAGAACTTAACTAAACTTCACATCGCCGCTTCATTTTTCGCCCGTAGCTTCTTCGCCTGGCTTTCCAGCAACAGGTAACAGATCAGCGCCAGCAGCAGTGGGATAAAGTAATACAGCACACGGTAAGCg > 2:5046841/1‑215 (MQ=255) tttGGGATACTTGCCGCGATAGCTATAACGCTTGTCTGGCAAAGGCATACGC‑GTTTTTTTCATT‑AG‑CCGTAAATGCACATACTAAAGAACTTAACTAAACTTCACATCGCCGCTTCATTTTTCGCCCGTAGCTTCTTCGCCTGGCTTTCCAGCAACAGGTAACAGATCAGCGCCAGCAGCAGTGGGATAAAGTAATACAGCACACGGTAAGCGAGTAGGGCGGCGATAATTGTACCTTTGGAGGTATGCt > 1:3796387/1‑250 (MQ=255) ttGGGATACTTGCCGCGATAGCTATAACGCTTGTCTGGCAAAGGCATACGC‑GTTTTTTTCATT‑AG‑CCGTAAATGCACATACTAAAGAACTTAACTAAACTTCACAt > 1:5405203/1‑106 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |