Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 1396764 | 1440913 | 44150 | 63 [60] | [59] 62 | fnr–ldhA | fnr,ogt,ydaH,b1337,ydaJ,ydaK,ydaL,b1341,b1342,dbpA,ydaO,b1345,ydaQ,ydaC,lar,recT,recE,racC,ydaE,ydaD,sieB,ydaF,b1355,ydaR,ydaS,ydaT,ydaU,b1360,ydaW,b1362,trkG,b1364,b1365,ydaY,b1367,b1368,b1369,trs55,b1371,b1372,ynaC,b1374,ynaE,ynaF,b1377,ydbK,hslJ,ldhA |
CATAAGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAGG > NC_000913/1440865‑1440989 | cacaaGACTTTCTCCAGTGCTGTTGACTCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAACTTTCCAATTTCATTGa > 1:3481570/4‑76 (MQ=255) cacaaGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGa > 1:3475260/4‑76 (MQ=255) acaaGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATGTTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGaa < 1:1206475/74‑1 (MQ=255) acaaGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGaa < 2:310188/74‑1 (MQ=255) acaaGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGaa > 1:267486/3‑76 (MQ=255) acaaGACTTTATCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGaa > 1:310188/3‑76 (MQ=255) caaGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGaaa > 2:16123/2‑76 (MQ=255) gACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTACGCTACTAAAAATATTTTACCCAATTTCAAATTTCCTTGAACGCt < 2:5712947/76‑1 (MQ=255) aCTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTa > 1:3980311/1‑76 (MQ=255) tttCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAACTCTAATTGAAAGCTATg < 2:4597718/76‑1 (MQ=255) tttCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATg < 1:3299761/76‑1 (MQ=255) tctcCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAACAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGc < 1:4468354/76‑1 (MQ=255) tctcCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGc < 2:3909111/76‑1 (MQ=255) tctcCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGc < 1:3034125/76‑1 (MQ=255) tctcCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGc < 1:3080467/76‑1 (MQ=255) tctcCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGc < 1:3196198/76‑1 (MQ=255) tcCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGa > 2:5231518/1‑76 (MQ=255) ccAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGat < 1:1138581/76‑1 (MQ=255) acAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGat < 1:1182960/75‑1 (MQ=255) cAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGata < 2:1383312/76‑1 (MQ=255) aGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGatat > 1:10845/1‑76 (MQ=255) aGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGatat < 2:3980310/76‑1 (MQ=255) aTGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGaa > 2:2657413/1‑76 (MQ=255) aTGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGaa < 2:2293245/76‑1 (MQ=255) aTGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGaa < 1:973670/76‑1 (MQ=255) gTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGaaaa < 1:2355373/76‑1 (MQ=255) gTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGaaaa < 2:2121475/76‑1 (MQ=255) gTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGaaaa < 1:5242630/76‑1 (MQ=255) tGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAAt > 1:1221367/1‑76 (MQ=255) aaTCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATtc > 1:5470171/1‑76 (MQ=255) tCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTCTGGCTATATTGAAAAATtcat < 1:834363/76‑1 (MQ=255) tCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATtcat > 1:2224273/1‑76 (MQ=255) cacaTTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATtcatc < 2:4800544/76‑1 (MQ=255) caTTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATcaa < 2:5198089/76‑1 (MQ=255) caTTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATcaa < 2:4680015/76‑1 (MQ=255) caTTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATcaa < 2:3799502/76‑1 (MQ=255) tttAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATcaaca < 2:2884994/76‑1 (MQ=255) tttAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATcaaca > 2:2163354/1‑76 (MQ=255) tttAAGCTACTAAAAATATTGTACAAAAGTTAAAATTTCATTGAAAGCTATGGCGATATTGCAAAATTCATcaaca < 2:2904925/76‑1 (MQ=255) ttAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATcaacaa > 1:2289584/1‑76 (MQ=255) ttAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATcaacaa < 1:3690837/76‑1 (MQ=255) tAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCaacaac < 2:1212727/76‑1 (MQ=255) tAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCaacaac > 2:2269175/1‑76 (MQ=255) aGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTa < 2:3935698/76‑1 (MQ=255) gCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTAt < 1:2163354/76‑1 (MQ=255) tactaAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGc > 2:2799384/1‑76 (MQ=255) tactaAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGc < 1:1902024/76‑1 (MQ=255) tactaAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGc < 1:7840/76‑1 (MQ=255) ctaAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCtt > 2:1962258/1‑76 (MQ=255) taAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTa > 2:5121345/1‑76 (MQ=255) aaaaaTATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAg < 1:993522/76‑1 (MQ=255) aaaaaTATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAg > 1:1977623/1‑76 (MQ=255) aaaaTATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAgt > 2:2874145/1‑76 (MQ=255) aaaaTATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAgc > 2:1187397/1‑75 (MQ=255) aaaTATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAgtg < 1:4747296/76‑1 (MQ=255) aaaTATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAgtg > 2:493034/1‑76 (MQ=255) aaTATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAgtga > 2:5645955/1‑75 (MQ=255) atatTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTa < 2:89479/76‑1 (MQ=255) tatTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAg < 2:2952418/76‑1 (MQ=255) atTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAgg > 1:5643180/1‑76 (MQ=255) atTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAgg < 2:188418/76‑1 (MQ=255) atTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAgg > 2:756305/1‑76 (MQ=255) | CATAAGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAGG > NC_000913/1440865‑1440989 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |