Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 3,025,676 +C coding (535/570 nt) ygfQ → hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009133,025,6751.C100.0% 379.3 / NA 145L178F (TTG→TTCygfQhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/0);  new base C (60/85);  total (60/85)

Only 100 of 157 total aligned reads displayed.

CGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCC  >  NC_000913/3025600‑3025747
                                                                            |                                                                        
   tatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGcca                                                                       >  1:2745328/1‑74 (MQ=255)
   tatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGcca                                                                       <  2:4738216/76‑3 (MQ=255)
   tatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGcca                                                                       >  1:3124496/1‑74 (MQ=255)
    atcggGCTGGGTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGccag                                                                      >  2:1686203/1‑73 (MQ=255)
       gggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGGTTGCCAGTgg                                                                    <  1:3382656/76‑1 (MQ=255)
       gggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTgg                                                                    <  1:1979910/76‑1 (MQ=255)
       gggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTgg                                                                    >  1:2668813/1‑76 (MQ=255)
        ggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGGTTGCCAGTGgc                                                                   <  1:3234983/76‑1 (MQ=255)
        ggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgc                                                                   <  2:4436278/76‑1 (MQ=255)
         gCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcg                                                                  <  1:3933118/76‑1 (MQ=255)
          cTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcgc                                                                 >  1:1594412/1‑76 (MQ=255)
           tGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCt                                                                >  1:1384640/1‑76 (MQ=255)
            gTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTc                                                               <  1:442985/76‑1 (MQ=255)
            gTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTc                                                               <  1:1073289/76‑1 (MQ=255)
              ttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCgg                                                             >  1:2054144/1‑76 (MQ=255)
              tgctggtgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCgg                                                             <  2:4855321/74‑1 (MQ=255)
               tCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGt                                                            <  2:2642001/76‑1 (MQ=255)
                ctgctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTg                                                           >  1:1683873/1‑76 (MQ=255)
                  gctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCCGTGGCGCTCGGTggg                                                         >  2:4568627/1‑74 (MQ=255)
                  gctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCg                                                         >  1:62757/1‑76 (MQ=255)
                  gctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCg                                                         <  2:4239965/76‑1 (MQ=255)
                  gctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGGGCg                                                         >  2:527074/1‑76 (MQ=255)
                   ctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGt                                                        >  1:4569999/1‑76 (MQ=255)
                   ctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGt                                                        <  1:410869/76‑1 (MQ=255)
                    tgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCggt                                                       >  1:1534743/1‑74 (MQ=255)
                    tgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGtt                                                       >  2:1211285/1‑76 (MQ=255)
                    tgcggATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGTTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGtt                                                       <  1:229299/76‑1 (MQ=255)
                    tgcggATGGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGtt                                                       <  2:265139/76‑1 (MQ=255)
                      ctgATTGCTGCTAACGGTTTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTa                                                     <  1:128158/76‑1 (MQ=255)
                      ctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTa                                                     <  1:1092803/76‑1 (MQ=255)
                       tgATTGCTGCTAACGGTGTGGGCATGGGTATCAAAAACCCGCTTGAAGGCGTGCCAGTGCCGCTCGGTGCGTTTAc                                                    >  2:1624306/1‑76 (MQ=37)
                         aTTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcct                                                  <  1:2816920/76‑1 (MQ=255)
                         aTTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcct                                                  <  1:2850798/76‑1 (MQ=255)
                          ttGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctc                                                 <  1:3797349/76‑1 (MQ=255)
                          ttGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctc                                                 >  1:4588102/1‑76 (MQ=255)
                          ttGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctc                                                 <  1:4578891/76‑1 (MQ=255)
                           tgctgcTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCCGTGGCGCTCGGTGGGTTtcctccc                                               >  2:1887809/1‑75 (MQ=255)
                            gctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctcct                                               >  2:3327322/1‑76 (MQ=255)
                            gctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctcct                                               <  2:1784830/76‑1 (MQ=255)
                             ctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCtt                                              >  1:2998567/1‑76 (MQ=255)
                              tgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGCAGGCTTGCCAGGGGCGCCCGGGGCGTTTCACTACTTc                                             >  2:1555541/1‑76 (MQ=255)
                              tgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTc                                             <  1:2715034/76‑1 (MQ=255)
                               gctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTcc                                            <  1:3252419/76‑1 (MQ=255)
                                ctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTccc                                           <  1:2516175/76‑1 (MQ=255)
                                  agcGGTGTGGGTATCGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg                                         <  2:3024079/74‑1 (MQ=255)
                                  aaCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg                                         <  2:2466420/76‑1 (MQ=255)
                                  aaCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg                                         <  2:3588964/76‑1 (MQ=255)
                                  aaCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg                                         <  1:4766285/76‑1 (MQ=255)
                                  aaCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg                                         <  2:3576809/76‑1 (MQ=255)
                                  aaCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGGGGCGCCCGGGGGGTTTATCTCCTTccctg                                         >  2:4820692/1‑74 (MQ=255)
                                   aCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGt                                        >  1:3701042/1‑76 (MQ=255)
                                   aCGGGGTGGGTATGGGTATGAAAAACCCGATTGGAGGCGTGCCAGTGGCGCTAGGCGCGTTTACCTCCTTCCCggg                                        >  1:4490850/1‑75 (MQ=255)
                                    cGGTGTGGGTCTGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTACCCGGtg                                       <  2:887189/76‑1 (MQ=255)
                                    cGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtg                                       <  2:3985323/76‑1 (MQ=255)
                                      gtgtGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgat                                     >  1:1315748/1‑76 (MQ=255)
                                       tgtgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatg                                    <  1:575703/76‑1 (MQ=255)
                                        gtgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatga                                   <  2:3375121/76‑1 (MQ=255)
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                                         agggTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatgct                                  >  2:4695820/2‑74 (MQ=255)
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                                          gggTATGGTTAGCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatgatg                                 <  1:4177044/76‑1 (MQ=255)
                                             tATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGc                              <  1:3356162/76‑1 (MQ=255)
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                                               tGGTTATCAAAAACCCGAATGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTACCGGTGATGATGAGCtt                            >  2:3830437/1‑76 (MQ=255)
                                                 gTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGc                          >  2:3804182/1‑76 (MQ=255)
                                                  ttATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCt                         <  1:2283598/76‑1 (MQ=255)
                                                    aTCAAAACCCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgg                       <  1:533538/76‑1 (MQ=255)
                                                     tCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCg                                                              >  2:2696579/1‑36 (MQ=37)
                                                      cAAAACCCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgggg                     <  2:1050236/76‑1 (MQ=255)
                                                      cAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTGCCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgggg                     <  2:4454282/76‑1 (MQ=255)
                                                      cAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgggg                     >  1:527299/1‑76 (MQ=255)
                                                      cAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgggg                     <  1:2022121/76‑1 (MQ=255)
                                                      cAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgggg                     <  1:3678750/76‑1 (MQ=255)
                                                       aaaaaCCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGc                    <  2:3457365/76‑1 (MQ=255)
                                                        aacaCCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCt                   <  1:204819/73‑1 (MQ=255)
                                                        aaaaCCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCt                   <  2:1824711/76‑1 (MQ=255)
                                                          aaCCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTgg                 <  2:2846685/76‑1 (MQ=255)
                                                           aCCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGc                >  1:4189485/1‑76 (MQ=255)
                                                           aCCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGc                <  2:3948582/76‑1 (MQ=255)
                                                            cccGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCg               >  1:436863/1‑76 (MQ=255)
                                                             ccGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCgg              <  1:4322552/76‑1 (MQ=255)
                                                              cGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGt             >  1:2405877/1‑76 (MQ=255)
                                                              cGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCCTGCTGGGgcgggcggg             >  2:4788483/1‑75 (MQ=255)
                                                               gATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTc            >  2:3438752/1‑76 (MQ=255)
                                                                aTTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCgggcc           >  2:4298103/1‑73 (MQ=255)
                                                                aTTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCgggcc           >  1:891279/1‑73 (MQ=255)
                                                                 ttGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCAGGCGGTcct          >  2:2677099/1‑74 (MQ=255)
                                                                   gAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCt        >  1:3797397/1‑76 (MQ=255)
                                                                   gAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGGCctct        >  2:3528973/1‑76 (MQ=255)
                                                                   gAAGGCGTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCt        <  2:4574225/76‑1 (MQ=255)
                                                                    aaGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGGCCTCtt       >  2:4119462/1‑76 (MQ=255)
                                                                    aaGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGGCATCtt       >  1:843082/1‑76 (MQ=255)
                                                                     aGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTc      <  1:4397991/76‑1 (MQ=255)
                                                                     aGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTc      <  1:1416180/76‑1 (MQ=255)
                                                                     aGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTc      <  2:619753/76‑1 (MQ=255)
                                                                     aGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGGCACCTTc      >  2:2489442/1‑76 (MQ=255)
                                                                       gCTTGCCAGTGGCGCTCTGTGCGTTTACCTCCTTCCCGTTGATGATGCGCTTGCTGGGTCTTGCGTTCCTCTTCgg    <  1:3145181/76‑1 (MQ=255)
                                                                       gCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCgg    <  2:2537780/76‑1 (MQ=255)
                                                                        ttggCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTGCTTCCCGGTGATTATGAGCTTGCTGGGGGTGGCGGTCCTCTTCTGcc  <  1:3927832/73‑1 (MQ=255)
                                                                            |                                                                        
CGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCC  >  NC_000913/3025600‑3025747

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: