| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,608,595 | 2 bp→GC | intergenic (+23/‑369) | prfC → / → osmY | peptide chain release factor RF‑3/OsmY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,608,595 | 0 | C | G | 100.0% | 240.5 / NA | 89 | intergenic (+23/‑370) | prfC/osmY | peptide chain release factor RF‑3/OsmY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (28/61); total (28/61) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,608,596 | 0 | G | C | 100.0% | 232.5 / NA | 90 | intergenic (+24/‑369) | prfC/osmY | peptide chain release factor RF‑3/OsmY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (28/62); total (28/62) | |||||||||||
GGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTACGCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTT > NC_000913/4608527‑4608661 || ggAACGTTGCCCGGACGTTCAGTTCCCCCAGCCCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTgc < 2:221135/76‑1 (MQ=255)ggAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTgc < 2:1407240/76‑1 (MQ=255) gAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTgcg < 1:3775708/76‑1 (MQ=255) gAACGTTATCCGGACGTTCAGCTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTgcg > 1:3495884/1‑76 (MQ=255) aaCGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTgcgc < 2:4466747/76‑1 (MQ=255) aaCGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTgcgc > 1:211551/1‑76 (MQ=255) aCGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGcc < 2:1224113/76‑1 (MQ=255) ttATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTg < 2:3864243/76‑1 (MQ=255) tATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGt < 2:2870597/76‑1 (MQ=255) ccGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCaa < 2:2464141/76‑1 (MQ=255) cGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAt > 1:3775806/1‑76 (MQ=255) cGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAt < 2:4344247/76‑1 (MQ=255) cGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAt > 2:1810474/1‑76 (MQ=255) cGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGACCTGTCAAt > 1:4567517/1‑76 (MQ=255) ggACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAtt > 2:4414458/1‑76 (MQ=255) cGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTcc < 2:4850910/76‑1 (MQ=255) gTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTccc > 2:3826132/1‑76 (MQ=255) ttCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCcct < 1:3027531/76‑1 (MQ=255) tCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCcctt > 1:610904/1‑76 (MQ=255) cAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCCATTTCccttc > 2:1649394/1‑76 (MQ=255) cAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCCATTTCccttc > 2:1617096/1‑76 (MQ=255) cAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttc > 1:2694397/1‑76 (MQ=255) aGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttcc > 1:457704/1‑76 (MQ=255) aGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttcc < 1:1842824/76‑1 (MQ=255) aGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttcc < 1:1554961/76‑1 (MQ=255) aGTTCCACAAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttcc < 1:1183550/76‑1 (MQ=255) gTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttcct < 2:1364505/76‑1 (MQ=255) gTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttcct > 1:1364506/1‑76 (MQ=255) ttCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttcctt > 2:2881913/1‑76 (MQ=255) tCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCtta < 1:317675/76‑1 (MQ=255) tCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCtta < 2:4563827/76‑1 (MQ=255) cccaccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCtta < 1:27202/75‑1 (MQ=255) ccaccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCttat < 2:1812912/76‑1 (MQ=255) ccaccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCttat > 1:4623896/1‑76 (MQ=255) ccaccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCttat < 1:2524579/76‑1 (MQ=255) caccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCttatt > 2:4290809/1‑76 (MQ=255) caGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGc < 2:1987204/76‑1 (MQ=255) aGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGcc < 2:2869500/76‑1 (MQ=255) aGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGcc < 1:4580125/76‑1 (MQ=255) aGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGcc < 2:771649/76‑1 (MQ=255) aGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGcc < 1:4284159/76‑1 (MQ=255) aGACCCGCGAGCAGTATTGCTGGCCGCCAGGGCGCGGGAGCCGCTGCGCCCTTGCAATTTCCCTTCCGTATTAGcc < 2:2903717/76‑1 (MQ=255) aGACCCGCGAGAATTAATGCTGGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGcc < 2:2904173/76‑1 (MQ=255) aGACCAGCGAGAGTTAATTCTTGCCTACAGGGCGCGGTAGCAGCTGCGCCCTGGCAATGTCCCTTCCTTAGTAGcc < 1:4329538/76‑1 (MQ=255) aCCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGc > 1:1381651/1‑76 (MQ=255) cccGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCt < 1:4108967/76‑1 (MQ=255) ccGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCtt < 2:617678/76‑1 (MQ=255) ccGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCtt < 1:4833738/76‑1 (MQ=255) ccGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCtt < 2:3859475/76‑1 (MQ=255) gcgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTAc < 2:1030461/76‑1 (MQ=255) gcgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTAc < 1:97362/76‑1 (MQ=255) cgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACg < 1:2261367/76‑1 (MQ=255) cgAGCATTAATTCTTGCATCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTGCCTTATTAGCCGCTTACg < 1:2269820/76‑1 (MQ=255) aGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCCCTTACGGa > 2:302015/1‑76 (MQ=255) agtttAGTTCTTGCCCCCGGGGCGGGGTAGCCGCGGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCCTATTAGCCGCTTACGGaa < 2:11725/73‑1 (MQ=255) cATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAAt < 2:1180092/76‑1 (MQ=255) cATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAAt < 1:2241612/76‑1 (MQ=255) aTTAATTCTTGCCTCCGGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATg < 1:2645656/76‑1 (MQ=255) aTTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATg < 1:4816039/76‑1 (MQ=255) aTTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATg < 1:3439823/76‑1 (MQ=255) tAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGtt > 2:3812205/1‑76 (MQ=255) tAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGtt < 1:3947829/76‑1 (MQ=255) aaTTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTc > 1:258090/1‑76 (MQ=255) aTTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCt < 2:1620908/76‑1 (MQ=255) aTTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCt < 1:2241461/76‑1 (MQ=255) aTTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCt < 1:2533712/76‑1 (MQ=255) cTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaa < 1:2979679/76‑1 (MQ=255) cTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaa < 1:4499573/76‑1 (MQ=255) ttGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaaa < 1:4270269/76‑1 (MQ=255) tGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaaaa < 1:1100914/76‑1 (MQ=255) tGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaaaa > 1:4752095/1‑76 (MQ=255) gCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAAc < 1:3935924/76‑1 (MQ=255) gCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAAc > 2:1994256/1‑76 (MQ=255) gCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAAc < 1:4234779/76‑1 (MQ=255) gCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAAc < 1:4382831/76‑1 (MQ=255) ccgccAGGGGGCTGTAGCCGCTGCGGCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACa < 2:58890/73‑1 (MQ=255) ccTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACa < 1:3818531/76‑1 (MQ=255) ccTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGGCAAGTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTGCTTAAAACa > 1:1013626/1‑76 (MQ=255) cTCCAGGGCGCGGTAGCCGATGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACAt < 1:4357722/76‑1 (MQ=255) tCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACAtt > 2:3132241/1‑76 (MQ=255) cccAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACAtt < 1:398081/75‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTc > 1:3824945/1‑76 (MQ=255) ccAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGCTCTTAAAACATTc > 1:4220413/1‑76 (MQ=255) cAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCa < 1:3032683/76‑1 (MQ=255) cAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCa > 1:3336610/1‑76 (MQ=255) ggggCGGGGTAGCGGCTGGGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCAc < 2:282594/75‑1 (MQ=255) ggggCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCAc < 2:1016508/75‑1 (MQ=255) aGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGGCAAGTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCAc < 2:1023611/76‑1 (MQ=255) ggCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACtt > 1:100493/1‑76 (MQ=255) ggCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACtt < 1:4400119/76‑1 (MQ=255) || GGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTACGCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTT > NC_000913/4608527‑4608661 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |