| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 225915 | NA (NA) | 8 (0.420) | 5/86 | NT | NA | noncoding (157/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | W3110S.gb | = 225926 | NA (NA) | noncoding (168/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/225838‑225915‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA < W3110S.gb/225926‑225860 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:90899/1‑71 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:580547/71‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:526675/1‑70 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:1879688/1‑71 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:1845064/71‑1 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:765044/1‑71 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:272351/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:856596/1‑70 GGTGATATGAACCGTTGTAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:1885222/71‑1 TGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:1888846/1‑71 GATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT < 1:1844613/66‑1 ATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:274438/1‑66 ATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1823113/62‑1 AACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:955620/57‑1 CGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:1177729/1‑58 CGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:952481/54‑1 GTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:543479/1‑55 GTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:894966/1‑55 TTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:1909183/1‑58 TTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1437053/52‑1 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:1572360/1‑57 TAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1100960/53‑1 GGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA < 1:162448/70‑1 GGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:1034365/65‑1 GGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:1178370/65‑1 GGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:1176290/1‑44 ATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:83475/42‑1 TTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC < 1:1260218/46‑1 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAAT > 1:225960/1‑62 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1406082/42‑1 TGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGT > 1:450965/1‑51 TGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:1480770/1‑38 AACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATA > 1:505411/1‑53 TGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA < 1:1782560/44‑1 TTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:632813/35‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:618137/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:87496/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:1784254/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:1550683/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATC > 1:494568/1‑67 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATC > 1:1571703/1‑67 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATC > 1:1331576/1‑67 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAA > 1:89309/1‑65 CATTAACCTATGTATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:1352349/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:600368/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:700499/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:211743/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:1858414/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:262695/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:1444791/1‑70 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCC > 1:1856894/1‑69 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGA < 1:1713058/62‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAATGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:2037652/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:468267/1‑40 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:2087725/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG < 1:1540309/69‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCG > 1:229956/1‑59 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:1377434/1‑40 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTT < 1:1830958/71‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:154838/1‑70 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAA < 1:46694/62‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTG < 1:1125814/44‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:194525/35‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:344966/35‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAACCACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAAT > 1:2086292/1‑62 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:582009/1‑71 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1007117/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGC < 1:1046183/64‑1 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGG > 1:1267006/1‑43 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:1886199/1‑35 CCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:1094963/36‑1 CCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:197042/36‑1 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/225838‑225915‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA < W3110S.gb/225926‑225860 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |