| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2728864 | NA (NA) | 13 (0.170) | 10/90 | NT | NA | noncoding (950/1542 nt) | rrsG | 16S ribosomal RNA |
| ? | W3110S.gb | = 2728876 | NA (NA) | noncoding (938/1542 nt) | rrsG | 16S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
ATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/2728791‑2728864‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGAAGT < W3110S.gb/2728876‑2728807 ATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACC < 1:2482705/71‑1 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:3883624/71‑1 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:5077912/71‑1 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:7820476/1‑71 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:6047006/1‑71 TTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:1510187/71‑1 TCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:6129243/1‑70 TCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:3767620/1‑70 TCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:139112/1‑70 TCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:1233259/1‑70 TCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:1344279/1‑70 CTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:488868/1‑71 CTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:2549993/1‑71 CTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:1819981/70‑1 CTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:2096682/70‑1 CTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:5145458/70‑1 CTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTAGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:726803/1‑71 TCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC > 1:6785104/1‑69 TCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC > 1:1841381/1‑69 ATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA < 1:1331049/68‑1 TGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:4829753/1‑61 TGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA > 1:3204549/1‑61 GAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACC < 1:2495998/59‑1 AAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:1226680/59‑1 AAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:6404757/59‑1 AAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:3932067/1‑60 AACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCA < 1:2910185/71‑1 AACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACC > 1:456567/1‑56 ACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCAT > 1:5746975/1‑71 GTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTT < 1:4429272/71‑1 TGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:5505877/50‑1 TGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:6139898/50‑1 TGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:4685795/50‑1 GGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTT > 1:6930736/1‑70 GGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC > 1:547071/1‑49 ATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:4258814/46‑1 ATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:4249618/46‑1 TGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTA > 1:1450120/1‑68 TCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:5337167/44‑1 TCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:938207/44‑1 TCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:3198475/44‑1 TCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCAC < 1:355109/44‑1 TCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:6814627/43‑1 CAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:724064/42‑1 AAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTT < 1:5908333/63‑1 AAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:6121590/1‑43 AAGACCAGGTAAGGTTCTTAGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGTGG > 1:4733496/1‑60 GACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA > 1:4931333/1‑63 GACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA > 1:3099241/1‑63 GACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:6847667/1‑41 CAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:1398806/1‑38 CAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACA > 1:1640026/1‑38 AGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCA < 1:7260961/35‑1 TTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGC > 1:447806/1‑40 TTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGC > 1:6656266/1‑40 CTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACAAGCGGTGGAGCATGTGG > 1:3512202/1‑44 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGA < 1:1343848/71‑1 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:7423342/1‑70 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:2663199/1‑70 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:2742325/1‑70 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:3705490/1‑70 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:4072357/1‑70 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCAC < 1:3516552/68‑1 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCC < 1:4735398/66‑1 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCC < 1:2206500/66‑1 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTC > 1:5475405/1‑57 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC > 1:5857652/1‑51 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC > 1:7184861/1‑51 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC > 1:3004788/1‑51 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTT < 1:3740394/49‑1 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAAC > 1:84056/1‑46 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAG > 1:3533953/1‑43 CACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGA > 1:2807135/1‑41 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:6632319/1‑69 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:3471020/1‑69 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGG > 1:324139/1‑69 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC > 1:2794393/1‑50 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC > 1:2929484/1‑50 ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTA > 1:7126217/1‑49 ACAAGCGGT‑GAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACA < 1:7522314/61‑1 CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACGGAAG > 1:5101931/1‑71 CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGT < 1:6264781/54‑1 CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCT > 1:7268794/1‑51 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |