| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 3690778 = | NA (NA) | 5 (0.060) | 4/96 | NT | NA | noncoding (2202/2904 nt) | rrlC | 23S ribosomal RNA |
| ? | W3110S.gb | 3690797 = | NA (NA) | noncoding (2183/2904 nt) | rrlC | 23S ribosomal RNA | |||||
TGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < W3110S.gb/3690848‑3690778‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCAAAGCCTCCCACCTATCCTA > W3110S.gb/3690797‑3690867 TGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:524703/1‑71TGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:4527775/1‑71TGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:3720432/1‑71TGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:3508806/1‑71TGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:2953888/1‑71TGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:3491476/1‑71TGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:3284801/1‑71 GAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGCCCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:1400521/1‑71 GAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:197203/1‑71 GAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:7655737/1‑71 GAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:3414444/1‑71 AAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:3547572/1‑70 AAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:6653511/1‑70 AAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT < 1:3953776/70‑1 AAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:3848122/1‑70 AAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:3617540/1‑70 AAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT < 1:1167480/70‑1 AAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT < 1:1941938/70‑1 AAGGGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT < 1:2788348/70‑1 TGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT < 1:5046126/65‑1 CGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:5744806/1‑61 CAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:172856/1‑58 CAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:516037/1‑58 CAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:5373507/1‑58 CAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:466648/1‑58 CAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:7335052/1‑58 CAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:7656162/1‑58 CAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:7647053/1‑58 CAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT < 1:4453738/57‑1 CAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT < 1:822249/57‑1 AGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:3943254/1‑56 AGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:3883989/1‑56 AGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:3047194/1‑56 AGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:2125082/1‑56 AGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:4837081/1‑56 AGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:7419624/1‑56 CTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:6113595/1‑54 TGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT > 1:837263/1‑53 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT < 1:4984722/40‑1 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT < 1:2542980/40‑1 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTT < 1:1067368/40‑1 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT > 1:6725868/1‑39 TTAATGTTTGATGTTCTAACGTTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACT < 1:4775365/59‑1 TAATGTTTGATGTTCTAACGTTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTT > 1:2251290/1‑71 TAATGTTTGATGTTCTAACGTTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACT < 1:3530484/70‑1 TAATGTTTGATGTTCTAACGTTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACAC < 1:4818373/69‑1 TAATGTTTGATGTTCTAACGTTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGC > 1:3845708/1‑46 ACGTTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCAAAGCCTCCCACCTA < 1:5670813/70‑1 TTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTG < 1:4118938/39‑1 TTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTG < 1:1038067/39‑1 TTAAAGGGT‑GTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCAAAGCCTCCCACCTATCCTA < 1:2381838/71‑1 TGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < W3110S.gb/3690848‑3690778‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCAAAGCCTCCCACCTATCCTA > W3110S.gb/3690797‑3690867 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |