| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 443782 = | 83 (1.020) | 9 (0.170) | 3/62 | NT | 20.3% | intergenic (‑43/‑125) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate reductase, NADPH‑specific/predicted nucleotide binding protein |
| ? | W3110S.gb | 443830 = | 18 (0.350) | intergenic (‑91/‑77) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate reductase, NADPH‑specific/predicted nucleotide binding protein | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGG > W3110S.gb/443713‑443851 | ctcccttcatttttgatgcgaagcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTa < 1:4737145‑M1/2‑1 (MQ=255)aCCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCt < 1:7891866/70‑1 (MQ=255)aCCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTa > 1:3007174/1‑71 (MQ=255) ccGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTa > 1:7181736/1‑70 (MQ=255) cGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTAt > 1:4357096/1‑70 (MQ=255) cGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTAt > 1:3736549/1‑70 (MQ=255) cGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATc < 1:7533225/71‑1 (MQ=255) gCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATc > 1:6830091/1‑70 (MQ=255) gCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATc > 1:7550752/1‑70 (MQ=255) ccttcatttttgatgcgaagcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATc > 1:867127‑M1/67‑70 (MQ=255) cATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATccc < 1:7825212/71‑1 (MQ=255) catttttgatgcgaagcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCtt > 1:4482479‑M1/63‑70 (MQ=255) catttttgatgcgaagcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCtt < 1:4823212‑M1/8‑1 (MQ=255) catttttgatgcgaagcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCt < 1:7227987‑M1/7‑1 (MQ=255) ccAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTa > 1:6979216/1‑70 (MQ=255) tttttgatgcgaagcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCt > 1:6022653‑M1/61‑67 (MQ=255) tttttgatgcgaagcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTaa > 1:7306141‑M1/61‑70 (MQ=255) tttgatgcgaagcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATtg < 1:6425256‑M1/13‑1 (MQ=255) tACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATtgt > 1:3305608/1‑71 (MQ=255) tACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATtgt < 1:3263825/71‑1 (MQ=255) tACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATtgt < 1:5700680/71‑1 (MQ=255) tACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATtgt < 1:2314906/71‑1 (MQ=255) atgcgaagcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATTGTGc > 1:6710753‑M1/55‑70 (MQ=255) tgcgaagcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATc > 1:7514482‑M1/54‑57 (MQ=255) aTTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCt < 1:7227580/71‑1 (MQ=255) aTTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCt < 1:4032982/71‑1 (MQ=255) aTTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCt < 1:5939246/71‑1 (MQ=255) agcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATtg > 1:4868876‑M1/49‑61 (MQ=255) gcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTaa > 1:7888628‑M1/48‑57 (MQ=255) gcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTaa > 1:3341495‑M1/48‑57 (MQ=255) gcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTaa > 1:3984331‑M1/48‑57 (MQ=255) gcataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATtgt < 1:469302‑M1/14‑1 (MQ=255) tCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTg > 1:5211952/1‑71 (MQ=255) ataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATtg > 1:7402251‑M1/46‑58 (MQ=255) ataatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATtg > 1:3575028‑M1/46‑58 (MQ=255) aTTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCa < 1:1410562/61‑1 (MQ=255) aTTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCa < 1:2922098/61‑1 (MQ=255) aTTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGc < 1:3138723/70‑1 (MQ=255) aTTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCg < 1:3616225/71‑1 (MQ=255) aTTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCg < 1:1043177/71‑1 (MQ=255) aTTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGCTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTTTTGCg < 1:1518611/71‑1 (MQ=255) ttGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGc < 1:6808015/69‑1 (MQ=255) ttGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGc < 1:6210507/69‑1 (MQ=255) ttGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGc < 1:2609215/69‑1 (MQ=255) ttGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGc < 1:4668696/69‑1 (MQ=255) aatacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATtgtg < 1:639797‑M1/15‑1 (MQ=255) tGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTAt > 1:5214946/1‑45 (MQ=255) tacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATtgt < 1:6850073‑M1/14‑1 (MQ=255) tacccgcaaagttaaataaccgacagtcctgaaccaggacgTATCCCTTAATtgt < 1:4814930‑M1/14‑1 (MQ=255) gTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGAc > 1:588447/1‑70 (MQ=255) ttCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATtgtg < 1:1186225/55‑1 (MQ=255) ttCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACt < 1:2148322/70‑1 (MQ=255) ttCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTa < 1:6533345/71‑1 (MQ=255) ttCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTa < 1:2259586/71‑1 (MQ=255) cctcctCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATtgt > 1:6229031/1‑52 (MQ=255) tcctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTAt < 1:4081293/68‑1 (MQ=255) cctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATg > 1:7004496/1‑54 (MQ=255) ctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATtg > 1:3920270/1‑47 (MQ=255) ctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGcaca < 1:2140746/71‑1 (MQ=255) ctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGcac > 1:241447/1‑70 (MQ=255) ctcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGcac > 1:5469784/1‑70 (MQ=255) aaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAAt > 1:941459‑M1/35‑45 (MQ=255) aaagttaaataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAAt > 1:5119831‑M1/35‑45 (MQ=255) tcACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATtgtg < 1:4084492/48‑1 (MQ=255) cACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTaa < 1:7519577/42‑1 (MQ=255) aCCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATtgtg < 1:2713641/46‑1 (MQ=255) cccGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAAtt < 1:2421306/42‑1 (MQ=255) cccGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAAtt > 1:6520514/1‑70 (MQ=255) cGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATtgtg < 1:3721879/43‑1 (MQ=255) cGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCa > 1:1602574/1‑45 (MQ=255) cGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCa > 1:6274232/1‑45 (MQ=255) cGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCa > 1:4821000/1‑45 (MQ=255) gCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATg > 1:2733075/1‑60 (MQ=255) gCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTa > 1:5622457/1‑68 (MQ=255) gCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTa > 1:1405164/1‑68 (MQ=255) gCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAgg > 1:2491269/1‑71 (MQ=255) aataaccgacagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATTGTGCAt < 1:2766954‑M1/18‑1 (MQ=255) aaCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGc > 1:668680/1‑59 (MQ=255) aaCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGa < 1:1649793/71‑1 (MQ=255) aCTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTAt > 1:6542742/1‑53 (MQ=255) cagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGcaca < 1:7524621‑M1/37‑1 (MQ=255) cagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGcaca < 1:7452841‑M1/37‑1 (MQ=255) cagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGcaca < 1:1294570‑M1/37‑1 (MQ=255) cagtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGcaca < 1:3437759‑M1/37‑1 (MQ=255) cGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGc > 1:502847/1‑43 (MQ=255) cGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTc < 1:2109895/69‑1 (MQ=255) cGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCt > 1:4022683/1‑71 (MQ=255) cGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCt > 1:4710853/1‑71 (MQ=255) cGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCt > 1:770159/1‑71 (MQ=255) gtcctgcaccaggacgTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATg > 1:3831321‑M1/17‑49 (MQ=255) ttCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGc < 1:3969751/37‑1 (MQ=255) ttCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGc < 1:6005484/37‑1 (MQ=255) cAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGcac > 1:806686/1‑45 (MQ=255) aaTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACaa < 1:2216653/46‑1 (MQ=255) aaTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGa > 1:3025440/1‑71 (MQ=255) aTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGAc > 1:3310579/1‑36 (MQ=255) aTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGAc > 1:5378413/1‑36 (MQ=255) ggCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTc < 1:4557892/71‑1 (MQ=255) cTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCgg < 1:5943841/71‑1 (MQ=255) cTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCgg > 1:5800638/1‑71 (MQ=255) | ACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGG > W3110S.gb/443713‑443851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |