| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 1961939 | 87 (1.070) | 8 (0.110) | 3/88 | NT | 9.4% | coding (164/1734 nt) | argS | arginyl‑tRNA synthetase |
| ? | W3110S.gb | = 1961957 | 76 (1.040) | coding (182/1734 nt) | argS | arginyl‑tRNA synthetase | |||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
AAAAGTTCAGTTCGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGTTGAGATCGCC > W3110S.gb/1961871‑1962009 | aaaaGTTCAGTTCGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACcgc > 1:5564935/1‑71 (MQ=255)aaaaGTTCAGTTCGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACcgc < 1:2896594/71‑1 (MQ=255) aaaGTTCAGTTCGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACcgc > 1:1028287/1‑70 (MQ=255) agttcagttcGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGa > 1:385309/1‑70 (MQ=255) agttcagttcGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGa > 1:3353386/1‑70 (MQ=255) cagttcGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAAt < 1:7403458/70‑1 (MQ=255) agttcGGCGACTATCAGGCTAAGGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTa < 1:4197716/71‑1 (MQ=255) gttcGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTag < 1:5789751/71‑1 (MQ=255) tcGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACaa > 1:138195/1‑65 (MQ=255) tcGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTagc < 1:3660349/70‑1 (MQ=255) cGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTag > 1:542835/1‑68 (MQ=255) cGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTag > 1:5435030/1‑68 (MQ=255) cGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTagcagagc < 1:6718295/71‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTagcagagca < 1:7656422/71‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTagcagagca < 1:689924/71‑1 (MQ=255) gACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTagcagag > 1:279728/1‑69 (MQ=255) gACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTagcagag > 1:1006858/1‑69 (MQ=255) gACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTag > 1:2877724/1‑64 (MQ=255) cTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAg < 1:4409966‑M2/70‑2 (MQ=255) tATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggt < 1:4285021‑M2/71‑4 (MQ=255) tATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggt < 1:4214151‑M2/71‑4 (MQ=255) tCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGa > 1:5986738/1‑52 (MQ=255) tCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggtg > 1:1934562‑M2/1‑66 (MQ=255) tCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggtg > 1:1503611‑M2/1‑66 (MQ=255) aGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCtgctctgctaattgtcgcggtgc > 1:7136666‑M1/1‑46 (MQ=255) aGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCtgctctgctaattgtcgcggtgc > 1:3795713‑M1/1‑46 (MQ=255) aGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCtgctctgctaattgtcgcggtgc > 1:7244305‑M1/1‑46 (MQ=255) aGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCtgctctgctaattgtcgcggtgc > 1:4633280‑M1/1‑46 (MQ=255) aGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCtgctctgctaattgtcgcggtgc > 1:6828312‑M1/1‑46 (MQ=255) aGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggtgc < 1:318479‑M2/69‑6 (MQ=255) ggCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAgg > 1:4358449‑M2/1‑63 (MQ=255) ggCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGa > 1:7121274/1‑71 (MQ=255) ggCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGa > 1:4412579/1‑71 (MQ=255) tAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCt > 1:6034113/1‑66 (MQ=255) tAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCt > 1:1284138/1‑66 (MQ=255) tAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTACGGCACCGCGACAAtt < 1:6417861/51‑1 (MQ=255) cGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATc > 1:181209/1‑71 (MQ=255) ggCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTagcagagca > 1:1665525/1‑56 (MQ=255) ggCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCt > 1:7336160/1‑71 (MQ=255) cATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTgg < 1:6746232/71‑1 (MQ=255) tgatgGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAAtt > 1:6885359/1‑43 (MQ=255) tgatgGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAAtt > 1:861021/1‑43 (MQ=255) tgatgGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTa < 1:1170912/44‑1 (MQ=255) tgatgGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGAt < 1:4014459/71‑1 (MQ=255) gatgGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATc > 1:6368352/1‑71 (MQ=255) tgGCTGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCt > 1:6152605/1‑70 (MQ=255) ggCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCtgctctgctaattgtcg < 1:2985800‑M1/47‑18 (MQ=255) ggCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCtt > 1:5131234/1‑70 (MQ=255) cAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAAc > 1:4772843/1‑71 (MQ=255) ttGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTagcagagc > 1:639560/1‑42 (MQ=255) ttGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggt > 1:5344903‑M2/1‑43 (MQ=255) ttGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCtt > 1:672395/1‑65 (MQ=255) tGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggtgc < 1:1918241‑M2/47‑6 (MQ=255) tGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCt > 1:2399407/1‑48 (MQ=255) tGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCt > 1:6248525/1‑48 (MQ=255) gCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTa < 1:16358/70‑1 (MQ=255) gCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTa < 1:5273698/70‑1 (MQ=255) gCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTa < 1:5055573/70‑1 (MQ=255) gCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTAt > 1:4152225/1‑71 (MQ=255) cTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTAt < 1:1966856/70‑1 (MQ=255) tAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGAAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTa > 1:5597516/1‑62 (MQ=255) aaaaaaCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAgg > 1:1190091‑M2/1‑38 (MQ=255) aaaaaaCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGc > 1:6114233/1‑71 (MQ=255) aaaaaCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGAt > 1:7171862/1‑56 (MQ=255) aaaaaCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGAt > 1:146984/1‑56 (MQ=255) aaaaaCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGAt > 1:4267325/1‑56 (MQ=255) aaaaaCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGc > 1:680986/1‑70 (MQ=255) aaaaaCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGc > 1:4197283/1‑70 (MQ=255) aaacCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggtgc < 1:6730131‑M2/41‑6 (MQ=255) aaaaCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTa > 1:5550455/1‑59 (MQ=255) aaaCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCt < 1:3323476/41‑1 (MQ=255) aaaCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAg > 1:2353834/1‑71 (MQ=255) aCTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGc > 1:7193953/1‑70 (MQ=255) ggTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAg < 1:584101/70‑1 (MQ=255) ggTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGt < 1:4584266/71‑1 (MQ=255) ggTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGt < 1:3941357/71‑1 (MQ=255) gTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGtt < 1:3643341/71‑1 (MQ=255) gTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGtt < 1:1746074/71‑1 (MQ=255) tATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATc < 1:4976015/41‑1 (MQ=255) aTGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggtgccatacccagttttttagcaactgccatcatgccgttagcc < 1:1812496‑M2/71‑46 (MQ=255) tGGCACCTCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGTTgag < 1:5683065/71‑1 (MQ=255) gCACCtgctctgctaattgtcgcggtgccatacccagttttttagcaactgccatcatgccgttagcct < 1:318479‑M1/69‑65 (MQ=255) gCACCtgctctgctaattgtcgcggtgccatacccagttttttagca < 1:1918241‑M1/47‑43 (MQ=255) gCACCtgctctgctaattgtcgcggtgccatacccagttttttagc < 1:636122‑M1/46‑42 (MQ=255) gCACCtgctctgctaattgtcgcggtgccatacccagttttttagc < 1:5412140‑M1/46‑42 (MQ=255) gCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggtgccatacccagttttttagcaactgccatcatgccgttagcct > 1:3795713‑M2/1‑23 (MQ=255) gCACCGCGACAATTAGCAGAGCAggtgccatacccagttttttagcaactgccatcatgccgttagcct > 1:6819094‑M2/1‑23 (MQ=255) cACCtgctctgctaattgtcgcggtgccatacccagttttttagc > 1:113289‑M1/1‑4 (MQ=255) cACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGa > 1:5675474/1‑40 (MQ=255) aCCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGTTGAGATCg > 1:2187987/1‑71 (MQ=255) cctgctctgctaattgtcgcggtgccatacccagtttttt > 1:2597653‑M1/1‑2 (MQ=255) cctgctctgctaattgtcgcggtgccatacccagtttttt > 1:3391320‑M1/1‑2 (MQ=255) ccGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCtt < 1:2293057/42‑1 (MQ=255) ccGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCt < 1:6932519/41‑1 (MQ=255) ccGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGc < 1:7653952/57‑1 (MQ=255) ccGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGTTGAGATCGc < 1:2319358/71‑1 (MQ=255) ccGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGTTGAGATCGc < 1:4303770/71‑1 (MQ=255) ccGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGTTGAGATCGc < 1:4869179/71‑1 (MQ=255) ctgctctgctaattgtcgcggtgccatacccagttttttagcaactgccatcatgccgttagcc > 1:1011074‑M1/1‑1 (MQ=255) cgcgACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGTTGAGATCGcc > 1:2826757/1‑71 (MQ=255) | AAAAGTTCAGTTCGGCGACTATCAGGCTAACGGCATGATGGCAGTTGCTAAAAAACTGGGTATGGCACCGCGACAATTAGCAGAGCAGGTGCTGACTCATCTGGATCTTAACGGTATCGCCAGCAAAGTTGAGATCGCC > W3110S.gb/1961871‑1962009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |