| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2053057 | 112 (1.380) | 10 (0.140) | 4/88 | NT | 8.2% | coding (6010/7104 nt) | yeeJ | adhesin |
| ? | W3110S.gb | = 2053070 | 124 (1.700) | coding (6023/7104 nt) | yeeJ | adhesin | |||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
CACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAGCGGTGACCGATCA > W3110S.gb/2052993‑2053127 | caccaACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCa < 1:5735137/71‑1 (MQ=255) caACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTTGTAACCTGATCGAAGGt < 1:6791148/64‑1 (MQ=255) caACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACtg > 1:4381650/1‑71 (MQ=255) caACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACtg < 1:2961185/71‑1 (MQ=255) acacTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACtg < 1:6615747/69‑1 (MQ=255) tGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAATGTCTCACTGTGTAct < 1:1201458‑M2/71‑3 (MQ=255) tGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTAct < 1:1050609‑M2/71‑3 (MQ=255) gATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGTTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTAct > 1:3073912‑M2/1‑68 (MQ=255) gATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTAct > 1:4647264‑M2/1‑68 (MQ=255) aTTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTActtc < 1:2516376‑M2/71‑5 (MQ=255) aTTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTActtc < 1:2313803‑M2/71‑5 (MQ=255) aTTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTActtc > 1:7318326‑M2/1‑67 (MQ=255) aTTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTActt > 1:5195942‑M2/1‑67 (MQ=255) tttAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTActtcg > 1:5851069‑M2/1‑66 (MQ=255) tttAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTActtcg > 1:7047752‑M2/1‑66 (MQ=255) ttAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTActtc < 1:4791840‑M2/69‑5 (MQ=255) ttAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTActtc < 1:2902231‑M2/69‑5 (MQ=255) aaGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGcc < 1:5057081/70‑1 (MQ=255) aaGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCt > 1:6536448/1‑71 (MQ=255) aGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGtctc < 1:4594970/54‑1 (MQ=255) aGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCt < 1:7159246/70‑1 (MQ=255) tACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTa > 1:2407907/1‑60 (MQ=255) aCCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTaa > 1:379314/1‑70 (MQ=255) ccTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTaaaa < 1:1790273/71‑1 (MQ=255) ccTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTaaaa < 1:2841805/71‑1 (MQ=255) ccTTAAAGGCAACGGTTGAGGATCGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTaaaa < 1:554413/71‑1 (MQ=255) aaaGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTaaa > 1:3582153/1‑66 (MQ=255) aaaGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTaaa > 1:499645/1‑66 (MQ=255) aaaGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGc < 1:4641548/70‑1 (MQ=255) aaaGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCg > 1:185775/1‑71 (MQ=255) aaaGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCg > 1:7936675/1‑71 (MQ=255) aaGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCgg < 1:5956781/71‑1 (MQ=255) cGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGtacacagtgagaccttcg > 1:1248502‑M1/1‑33 (MQ=255) ggTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGtacacagtgagacctt < 1:1686914‑M1/48‑17 (MQ=255) ggTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGtacacagtgagacctt < 1:7732286‑M1/48‑17 (MQ=255) gTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACtgtg < 1:92315/42‑1 (MQ=255) gTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACtgtg < 1:7550370/42‑1 (MQ=255) gTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACtgtg < 1:2653524/42‑1 (MQ=255) ttGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGtacacagtgagaccttcg > 1:5968988‑M1/1‑30 (MQ=255) ttGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGcc > 1:1157939/1‑50 (MQ=255) gAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACtgta > 1:7041567/1‑38 (MQ=255) gAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTAc < 1:5550585‑M2/42‑2 (MQ=255) aGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACAtt > 1:3837126/1‑70 (MQ=255) ggATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTaa > 1:891963/1‑71 (MQ=255) aTGGCAGTGGTAACGTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACg < 1:4827388/71‑1 (MQ=255) aTGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGc < 1:5642087/53‑1 (MQ=255) aTGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGc < 1:7317184/53‑1 (MQ=255) aTGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACg < 1:1320543/71‑1 (MQ=255) aTGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACg < 1:4714079/71‑1 (MQ=255) tGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAg > 1:1454568/1‑51 (MQ=255) tGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGt < 1:2296043/71‑1 (MQ=255) tGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGt > 1:143592/1‑71 (MQ=255) gCAGTGGTAACCTGATCGAAGtacacagtgagaccttcga > 1:4038530‑M1/1‑21 (MQ=255) gCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCa < 1:3474305/71‑1 (MQ=255) gCAGTGCTAACCTGATCGAAGtacacagtgagaccttcga > 1:1018859‑M1/1‑21 (MQ=255) cAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCAt > 1:4388110/1‑71 (MQ=255) cAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCAt > 1:7696813/1‑71 (MQ=255) gTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTaa < 1:2828293/42‑1 (MQ=255) gTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTaa < 1:154950/42‑1 (MQ=255) gTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCAtt < 1:4050674/70‑1 (MQ=255) tGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGc < 1:3564432/49‑1 (MQ=255) tGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCca < 1:3212286/56‑1 (MQ=255) gTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTaa > 1:6235889/1‑69 (MQ=255) gTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTaa > 1:4007998/1‑69 (MQ=255) gTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAAc < 1:6464929/70‑1 (MQ=255) aaCCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCAt > 1:5529752/1‑64 (MQ=255) aaCCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCAt > 1:3311752/1‑64 (MQ=255) aaCCTGATCGAAGGGCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGctct < 1:6170175/48‑1 (MQ=255) aCCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACg < 1:5927712/59‑1 (MQ=255) ccTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTa < 1:1886366/64‑1 (MQ=255) cTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGc < 1:448684/39‑1 (MQ=255) cTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGc < 1:4646213/39‑1 (MQ=255) cTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAg < 1:4327598/67‑1 (MQ=255) cTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAGCGGt < 1:216486/71‑1 (MQ=255) cTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAGCGGt < 1:3987727/71‑1 (MQ=255) tGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCca < 1:2262659/48‑1 (MQ=255) tGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAGCGGt > 1:5841293/1‑70 (MQ=255) gATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAg > 1:3483066/1‑36 (MQ=255) aTCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAGCGGTg < 1:6122929/69‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAGCGGTGAc < 1:150087/71‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAGCGGTGAc > 1:164288/1‑71 (MQ=255) tCGAAGGTCTCACTGTGTActtcgatcaggttagcactgc > 1:1018859‑M2/1‑19 (MQ=255) tCGAAGGTCTCACTGTGTActtcgatcaggttaccactgc > 1:7939214‑M2/1‑19 (MQ=255) cGAAGGTCTCACTGTGTActtctatcaggttaccactgccatcctcaa > 1:7142951‑M2/1‑18 (MQ=255) cGAAGGTCTCACTGTGTActtcgatcaggttaccactgccatcctcaaccg > 1:7759440‑M2/1‑18 (MQ=255) cGAAGGTCTCACTGTGTActtcgatcaggttaccactgccatcctcaa > 1:2176786‑M2/1‑18 (MQ=255) gAAGtacacagtgtgaccttcgatcaggttaccactgccatcctcaaccgttgcctttaaggtacttaa < 1:450846‑M1/69‑66 (MQ=255) gAAGtacacagtgagaccttcgatcaggttaccactgccatcctcaaccgttgcctttaaggtacttaaat < 1:3728639‑M1/71‑68 (MQ=255) gAAGtacacagtgagaccttcgatcaggttaccactgccatcctcaaccgttgcctttaaggtacttaaat < 1:6327407‑M1/71‑68 (MQ=255) gAAGtacacagtgagaccttcgatcaggttaccactgccatcctcaaccgttgcctttaaggtacttaaat < 1:7889459‑M1/71‑68 (MQ=255) gAAGtacacagtgagaccttcgatcaggttaccactgccatcctcaaccgttgcctttaaggtacttaa < 1:7533369‑M1/69‑66 (MQ=255) gAAGtacacagtgagaccttcgatcaggttaccactgccatcctcaaccgttgcctttaaggtacttaa < 1:4791840‑M1/69‑66 (MQ=255) gAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAGCGGTGACCg < 1:5124631/70‑1 (MQ=255) aaGGTCTCACTGTGTActtcgatcaggttaccactgccatcctcaacc < 1:1686914‑M2/48‑33 (MQ=255) aaGGTCTCACTGTGTActtcgatcaggttaccactgccatcctcaacc < 1:7732286‑M2/48‑33 (MQ=255) aGtacacagtgagaccttcgatcaggttaccactgccatcctcaaccgttgcctttaaggtacttaaatca < 1:4322934‑M1/71‑70 (MQ=255) aGtacacagtgagaccttcgatcaggttaccactgccatcctcaaccgttgcctttaaggtacttaaat > 1:2813263‑M1/1‑2 (MQ=255) aGtacacagtgagaccttcgatcaggttaccactgccatcctcaaccgttgcctttaaggtacttaaat > 1:1514727‑M1/1‑2 (MQ=255) aGtacacagtgagaccttcgatcaggttaccactgccatcctcaaccgttgccttta > 1:1601851‑M1/1‑2 (MQ=255) ggTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAGCGGTGACCGATCa < 1:7115384/71‑1 (MQ=255) | CACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCAGTGGTAACCTGATCGAAGGTCTCACTGTGTACTTCGCCTTAAAAAGCGGCTCTGCCACATTAACGTCATTAACAGCGGTGACCGATCA > W3110S.gb/2052993‑2053127 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |