| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2178633 | 59 (0.720) | 4 (0.060) | 3/86 | NT | 6.9% | coding (1023/1263 nt) | gatZ | D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
| ? | W3110S.gb | = 2178648 | 57 (0.800) | coding (1008/1263 nt) | gatZ | D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCA > W3110S.gb/2178563‑2178703 | tcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGA < 1:7304187‑M1/71‑1 (MQ=255) tttCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAata < 1:5528903/71‑1 (MQ=255) tCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATc > 1:4136067/1‑71 (MQ=255) tCGACGATATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATc > 1:5087/1‑71 (MQ=255) cGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATc < 1:3053308/70‑1 (MQ=255) gACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATcc < 1:7563097/70‑1 (MQ=255) aCGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAg < 1:2805986/71‑1 (MQ=255) aCGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAg < 1:6888178/71‑1 (MQ=255) cTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGA < 1:1653337‑M1/60‑1 (MQ=255) aTTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAat > 1:2305228/1‑60 (MQ=255) aTTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAAt > 1:767092/1‑70 (MQ=255) tttttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAAt < 1:1327551/69‑1 (MQ=255) tttttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAAt < 1:2695545/69‑1 (MQ=255) tttttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAAt < 1:3587038/69‑1 (MQ=255) ttttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGa > 1:5139941/1‑70 (MQ=255) tttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAt < 1:5143906‑M2/71‑2 (MQ=255) tttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAt < 1:5929336‑M2/71‑2 (MQ=255) tAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAtcg < 1:7261299‑M2/71‑4 (MQ=255) tAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAtc < 1:4901855‑M2/70‑3 (MQ=255) aTCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAttcattactggatattcgtt < 1:3086458‑M1/71‑21 (MQ=255) aTCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAttcattactggatattcgtt < 1:4723223‑M1/71‑21 (MQ=255) tCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAttcattactggatattcgtta < 1:326470‑M1/71‑22 (MQ=255) tCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAtcgtta > 1:2909488‑M2/1‑65 (MQ=255) cGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAtc < 1:7447467‑M2/65‑3 (MQ=255) cGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTaaa < 1:2515137/71‑1 (MQ=255) cTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAAcc < 1:1381312/71‑1 (MQ=255) cTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAAcc < 1:1969664/71‑1 (MQ=255) tATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTaa < 1:3037157/66‑1 (MQ=255) tGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAata < 1:2779360/45‑1 (MQ=255) tGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCg < 1:6588479/70‑1 (MQ=255) tGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCg > 1:7573684/1‑70 (MQ=255) tGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCg < 1:4298033/70‑1 (MQ=255) tGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCg < 1:1417325/70‑1 (MQ=255) tGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGt < 1:5650962/71‑1 (MQ=255) gCGGTCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGt < 1:1985055/70‑1 (MQ=255) gCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCa > 1:4214260/1‑48 (MQ=255) gCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGt < 1:6684440/70‑1 (MQ=255) ggCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAttcattactggatattcg < 1:2619809‑M1/57‑19 (MQ=255) ggCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGa < 1:2644079/53‑1 (MQ=255) ccAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAtcgt > 1:2001194‑M2/1‑52 (MQ=255) aGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAtcgtta < 1:5919718‑M2/56‑7 (MQ=255) aGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGataa < 1:720231/71‑1 (MQ=255) aGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGataa < 1:7484029/71‑1 (MQ=255) gTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGataa > 1:485532/1‑70 (MQ=255) taataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTaa < 1:210253/55‑1 (MQ=255) taataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGataata > 1:4350004/1‑71 (MQ=255) ataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGata > 1:316003/1‑66 (MQ=255) ataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAatat < 1:353665/70‑1 (MQ=255) taaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTaa < 1:6945538/52‑1 (MQ=255) taaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTaa < 1:2226796/52‑1 (MQ=255) taaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGt < 1:127132/59‑1 (MQ=255) aCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTaaaa > 1:4380407/1‑52 (MQ=255) aCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAAc > 1:1046112/1‑53 (MQ=255) cGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATAtttttt > 1:351154/1‑71 (MQ=255) gAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAt > 1:5154272‑M2/1‑41 (MQ=255) aaTACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAt > 1:3467282‑M2/1‑40 (MQ=255) aaTACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAAcc > 1:5732460/1‑51 (MQ=255) aaTACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTAAGATAATAtttt > 1:378868/1‑67 (MQ=255) aTACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTc > 1:7235765/1‑69 (MQ=255) tACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGataata < 1:7523316/61‑1 (MQ=255) cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAtcgtt < 1:7597631‑M2/41‑6 (MQ=255) cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAtcgtt < 1:823692‑M2/41‑6 (MQ=255) cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTa > 1:7198615/1‑71 (MQ=255) cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTa > 1:6145756/1‑71 (MQ=255) aTCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAAt > 1:2880200‑M2/1‑34 (MQ=255) tCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTc < 1:4629013/63‑1 (MQ=255) ccGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGc > 1:1516860/1‑71 (MQ=255) cGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTaa < 1:4814811/38‑1 (MQ=255) gACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTaaaa > 1:3599369/1‑39 (MQ=255) gACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTaaaa > 1:4314283/1‑39 (MQ=255) gACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCgg < 1:5668225/71‑1 (MQ=255) aCAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAg > 1:74006/1‑62 (MQ=255) cAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGtt > 1:149877/1‑71 (MQ=255) cTGTAACGGATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgtc < 1:3812754/71‑1 (MQ=255) cTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgtc < 1:1197343/71‑1 (MQ=255) tAACGAttcattactggatattcgttacagcctgtcggatcgtattcgttattactggccgcatagtcgga > 1:2909488‑M1/1‑6 (MQ=255) tAACGAttcattactggatattcgttacagcctgtcggatcgtattcgttattact < 1:5919718‑M1/56‑51 (MQ=255) tAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgtcg < 1:5209970/69‑1 (MQ=255) tAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgtcg < 1:5489003/69‑1 (MQ=255) tAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGa < 1:5197792/70‑1 (MQ=255) aaCGAttcattactggatattcgttacagcctgtcggatcg < 1:823692‑M1/41‑37 (MQ=255) aaCGAttcattactggatattcgttacagcctgtcggatcg < 1:7597631‑M1/41‑37 (MQ=255) aaCGAATATCCAGTAATGAAtcgttacagcctgtcggatcgtattcgttattactggccgcatagtcggat < 1:4723223‑M2/71‑52 (MQ=255) aaCGAATATCCAGTAATGAAtcgttacagcctgtcggatcgtattcgttattactggccgcatagtcggat < 1:3086458‑M2/71‑52 (MQ=255) actaaTATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCa < 1:2827811/68‑1 (MQ=255) aCGAttcattactggatattcgttacagcctgtcggatcgtattcgttattactgg > 1:2001194‑M1/1‑4 (MQ=255) aCGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGa > 1:506004/1‑37 (MQ=255) aCGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGa > 1:2623014/1‑37 (MQ=255) aCGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAg > 1:6534766/1‑69 (MQ=255) aCGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGc < 1:742469/70‑1 (MQ=255) cGAttcattactggatattcgttacagcctgtcggatcgtattcgttattactggccgcatagtcggatta < 1:7261299‑M1/71‑69 (MQ=255) cGAATATCCAGTAATGAAtcgttacagcctgtcggatcgtattcgttattactggcc < 1:2619809‑M2/57‑40 (MQ=255) cGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCAt > 1:4153646/1‑71 (MQ=255) gAttcattactggatattcgttacagcctgtcggatcgtattcgttattactggccgcatagtcggatta < 1:4901855‑M1/70‑69 (MQ=255) gAttcattactggatattcgttacagcctgtcggatcgtattcgttattactggccgcatagtcg < 1:7447467‑M1/65‑64 (MQ=255) gAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGataata > 1:6839340/1‑40 (MQ=255) attcattactggatattcgttacagcctgtcggatcgtattcgttattactggccgcatagtcggattaaa < 1:5929336‑M1/71‑71 (MQ=255) attcattactggatattcgttacagcctgtcggatcgtattc > 1:5547088‑M1/1‑1 (MQ=255) attcattactggatattcgttacagcctgtcggatcgtattc > 1:5154272‑M1/1‑1 (MQ=255) attcattactggatattcgttacagcctgtcggatcgtatt > 1:3467282‑M1/1‑1 (MQ=255) | TCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCA > W3110S.gb/2178563‑2178703 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |