| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2518173 | 96 (1.180) | 6 (0.090) | 3/80 | NT | 7.0% | intergenic (‑21/‑315) | mntH/nupC | manganese/divalent cation transporter/nucleoside (except guanosine) transporter |
| ? | W3110S.gb | = 2518177 | 80 (1.200) | intergenic (‑25/‑311) | mntH/nupC | manganese/divalent cation transporter/nucleoside (except guanosine) transporter | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTT > W3110S.gb/2518105‑2518243 | ttGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCtt > 1:2278827/1‑71 (MQ=255) gcgcgcCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTg < 1:708370‑M2/71‑2 (MQ=255) gcgcgcCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTg < 1:2007166‑M2/71‑2 (MQ=255) cgcgcgGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTg > 1:5170467‑M2/1‑69 (MQ=255) gcgcCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTg < 1:4543258‑M2/69‑2 (MQ=255) gccgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgctat < 1:1278001‑M2/71‑6 (MQ=255) gccgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgcta < 1:1299048‑M2/70‑5 (MQ=255) ccgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgctatg > 1:7038052‑M2/1‑65 (MQ=255) cgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgctatgt < 1:6527865‑M2/71‑8 (MQ=255) cgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgctatgt < 1:1817609‑M2/71‑8 (MQ=255) cccGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgctatgttt > 1:5575651‑M2/1‑62 (MQ=255) ccGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgctatgttt < 1:1432941‑M2/70‑10 (MQ=255) cGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCa < 1:2589431/71‑1 (MQ=255) gTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCAt > 1:4140707/1‑71 (MQ=255) cGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGc < 1:3715078/70‑1 (MQ=255) cGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGc < 1:5971668/70‑1 (MQ=255) cGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGc > 1:1210774/1‑70 (MQ=255) cGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGc > 1:1555906/1‑70 (MQ=255) cGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTCCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGc < 1:6360910/70‑1 (MQ=255) gctgctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgcta > 1:2843235‑M2/1‑55 (MQ=255) gctgctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTa < 1:7674361/71‑1 (MQ=255) gctgctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTa > 1:1124759/1‑71 (MQ=255) ctgctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgctatgttt < 1:6464597‑M2/63‑10 (MQ=255) ctgctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgc < 1:3794590‑M2/56‑3 (MQ=255) ctgctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTAt < 1:549035/71‑1 (MQ=255) tgctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATg > 1:3503033/1‑71 (MQ=255) tgctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCCTTGCTATGTTTCATGCTATg > 1:4894961/1‑71 (MQ=255) tgctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGACTTTgctatgtt < 1:3822206‑M2/61‑9 (MQ=255) aCTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCa < 1:4188666/60‑1 (MQ=255) ctctCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACTTAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCa < 1:4706022/69‑1 (MQ=255) ctctCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCa < 1:1707330/59‑1 (MQ=255) ctctCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCa < 1:6377750/69‑1 (MQ=255) tcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATg > 1:6042162/1‑63 (MQ=255) tcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAAc > 1:4376012/1‑69 (MQ=255) tcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGC > 1:3456953‑M1/1‑41 (MQ=255) aaCGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACgag > 1:844777/1‑70 (MQ=255) aaCGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACgag > 1:1537595/1‑70 (MQ=255) cgcgATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAAt < 1:407519/71‑1 (MQ=255) cgcgATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAAt > 1:685691/1‑71 (MQ=255) cgcgATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAAt > 1:3980870/1‑71 (MQ=255) cgATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGa < 1:2364578/71‑1 (MQ=255) gATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCtaaggctat < 1:462766‑M1/43‑10 (MQ=255) tAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTgctatgtt < 1:7761218‑M2/44‑9 (MQ=255) tAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTAt > 1:249701/1‑53 (MQ=255) tAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTa > 1:5745376/1‑71 (MQ=255) tAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTa > 1:5787224/1‑71 (MQ=255) tAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTa > 1:2569144/1‑71 (MQ=255) aGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGc < 1:7858911/49‑1 (MQ=255) aGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTAt > 1:7400287/1‑52 (MQ=255) ttCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGc < 1:1411550/47‑1 (MQ=255) ttCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCa < 1:2465195/71‑1 (MQ=255) tCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATg < 1:7032475/50‑1 (MQ=255) cGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGc < 1:5961564/45‑1 (MQ=255) cGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACga > 1:4874226/1‑57 (MQ=255) cGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCaaa > 1:2263067/1‑71 (MQ=255) gTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAAt > 1:6407366/1‑71 (MQ=255) tCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAAtt < 1:6644291/71‑1 (MQ=255) tCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAAtt < 1:1964029/71‑1 (MQ=255) aTCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTc < 1:648181/70‑1 (MQ=255) ttGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCAtt > 1:4504538/1‑70 (MQ=255) tgtgCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATg < 1:5304499/54‑1 (MQ=255) tgtgCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGAt > 1:6968049/1‑56 (MQ=255) tgtgCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGAt > 1:5165509/1‑56 (MQ=255) tgtgCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGAt > 1:5394833/1‑56 (MQ=255) ccTCTAAAACATAGCCTTTGCTGTGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATg > 1:2873300/1‑71 (MQ=255) tctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGa > 1:2829755/1‑71 (MQ=255) tAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAAt > 1:5000643/1‑45 (MQ=255) tAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTa < 1:7456894/63‑1 (MQ=255) tAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTa < 1:3293717/63‑1 (MQ=255) tAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGAtt > 1:4531750/1‑71 (MQ=255) tAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGAtt > 1:4413224/1‑71 (MQ=255) tAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATCTa < 1:3600189/63‑1 (MQ=255) taaaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAAt > 1:197008/2‑44 (MQ=255) aaaCATAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcagcggacgg < 1:3960356‑M1/70‑62 (MQ=255) aaaCATAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcagcggacgg < 1:2824520‑M1/70‑62 (MQ=255) aaaCATAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcagcggacgg < 1:3369560‑M1/70‑62 (MQ=255) aaaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGAtt < 1:1628493/69‑1 (MQ=255) aaaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGAt < 1:3034685/68‑1 (MQ=255) aaaCATAGCAAAGGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCaaa < 1:3273692/53‑1 (MQ=25) aaCATAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcagcggacgggc > 1:3970309‑M1/1‑8 (MQ=255) aaCATAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcagcggacgggc > 1:6190789‑M1/1‑8 (MQ=255) aaCATAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagca < 1:223317‑M1/61‑54 (MQ=255) aaCATAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaacta < 1:1062944‑M1/44‑37 (MQ=255) aCATAGCaaaggctatgttttggaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcagcggacgggcg > 1:1701390‑M1/1‑7 (MQ=255) aCATAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcagcggacgggcg < 1:1369782‑M1/71‑65 (MQ=255) aCATAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcagcggacgggcg > 1:6325986‑M1/1‑7 (MQ=255) aCATAGCCTTTgctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttga < 1:2009174‑M2/52‑42 (MQ=255) aCATAGCCTTTgctatgttttagaggcacaagatgacgaacta > 1:2147945‑M2/1‑11 (MQ=255) aCATAGCCTTTgctatgttttagaggcacaagatgacgaacta > 1:5175684‑M2/1‑11 (MQ=255) aCATAGCCTTTgctatgttttagaggcacaagatgacgaacta > 1:329722‑M2/1‑11 (MQ=255) cATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTgtggt < 1:7271739/71‑1 (MQ=255) aTAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcagcggacgggcggc < 1:3698224‑M1/71‑67 (MQ=255) aTAGCCTTTgctatgttttagaggcacaagatgacgaactatc < 1:2292261‑M2/43‑35 (MQ=255) tAGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgag < 1:3704536‑M1/50‑47 (MQ=255) aGCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcagcggacgggcggcgc > 1:4034374‑M1/1‑3 (MQ=255) aGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGAt > 1:1044805/1‑71 (MQ=255) gCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcag < 1:3794590‑M1/56‑55 (MQ=255) gCaaaggctatgttttagaggcacaagatgacgaactatcgcgttgagagtagcag < 1:1891435‑M1/56‑55 (MQ=255) gCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTa < 1:1865858/54‑1 (MQ=255) ccTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTa > 1:3183726/1‑53 (MQ=255) | CTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTT > W3110S.gb/2518105‑2518243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |