| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2724513 | 57 (0.700) | 3 (0.040) | 3/84 | NT | 5.3% | intergenic (‑111/+212) | kgtP/rrfG | alpha‑ketoglutarate transporter/5S ribosomal RNA |
| ? | W3110S.gb | = 2724532 | 58 (0.830) | intergenic (‑130/+193) | kgtP/rrfG | alpha‑ketoglutarate transporter/5S ribosomal RNA | |||||
GCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATG > W3110S.gb/2724444‑2724583 | gCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCAT < 1:3018463‑M1/70‑1 (MQ=255) tGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAAtt < 1:5067529/70‑1 (MQ=255) tATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagt > 1:6466302/1‑70 (MQ=255) ttttttttGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagttag < 1:6103551/71‑1 (MQ=255) ttttttttGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagtta < 1:284594/70‑1 (MQ=255) ttttttttGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagtt > 1:3418046/1‑69 (MQ=255) gTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagtta > 1:7542123/1‑62 (MQ=255) gTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGacaa > 1:2694770/1‑71 (MQ=255) gTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGaa < 1:7334062/69‑1 (MQ=255) gTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAa < 1:4163935‑M2/71‑2 (MQ=255) tAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagtta < 1:5338797/61‑1 (MQ=255) tAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAa > 1:2249433‑M2/1‑69 (MQ=255) tAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAa > 1:3956181‑M2/1‑69 (MQ=255) aaGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAatgg < 1:1520271‑M2/71‑5 (MQ=255) aaGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAatg > 1:4742924‑M2/1‑67 (MQ=255) aGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGc > 1:3826665/1‑60 (MQ=255) aGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGc > 1:5629465/1‑60 (MQ=255) ggAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAatggt < 1:776042‑M2/70‑6 (MQ=255) aaTATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTAtt > 1:1478191/1‑71 (MQ=255) aaTATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTAtt > 1:241212/1‑71 (MQ=255) aaTATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCAT < 1:2538194‑M1/43‑1 (MQ=255) tattatACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATtttcctgctaactaaattcatggttaagg < 1:1709475‑M1/70‑30 (MQ=255) tattatACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATg > 1:2116535/1‑42 (MQ=255) tattatACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGa > 1:5535175/1‑43 (MQ=255) tattatACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGa > 1:7648874/1‑43 (MQ=255) attatACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTgag > 1:238925/1‑71 (MQ=255) attatACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTgag > 1:4631406/1‑71 (MQ=255) aCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATtttcctgctaactaaattcatggtt > 1:1644667‑M1/1‑35 (MQ=255) aCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCt > 1:4899374/1‑71 (MQ=255) cATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCt > 1:382202/1‑70 (MQ=255) cATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCt > 1:1883985/1‑70 (MQ=255) aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATtttcctgctaactaaattcat < 1:4579332‑M1/54‑22 (MQ=255) aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCtt > 1:2664880/1‑70 (MQ=255) aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCt > 1:3066562/1‑69 (MQ=255) tttGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGaa < 1:1322344/50‑1 (MQ=255) ttgttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAatg < 1:2446416‑M2/53‑4 (MQ=255) ttgttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAg > 1:2145925/1‑71 (MQ=255) ttgttgCATAACATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAg > 1:2467009/1‑71 (MQ=255) tgttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAg > 1:7519637/1‑70 (MQ=255) gttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGaaa > 1:2747330/1‑48 (MQ=255) ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTAt < 1:2998159/55‑1 (MQ=255) ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTAt < 1:1954281/55‑1 (MQ=255) ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTAt < 1:6837503/55‑1 (MQ=255) ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTAt < 1:5503052/55‑1 (MQ=255) ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTAt < 1:2434503/55‑1 (MQ=255) ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGa < 1:5259147/70‑1 (MQ=255) cATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagtta > 1:6778680/1‑36 (MQ=255) cATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATaa < 1:5967306/70‑1 (MQ=255) cATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATaa < 1:684434/70‑1 (MQ=255) atatCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAAt < 1:2349179/71‑1 (MQ=255) atCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTgag < 1:5198085/53‑1 (MQ=255) tCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAAttt < 1:1296860/70‑1 (MQ=255) tCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTc < 1:1555682/71‑1 (MQ=255) tCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTc > 1:5324248/1‑71 (MQ=255) tATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAa < 1:6091218‑M2/37‑2 (MQ=255) tATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAa < 1:5370036‑M2/37‑2 (MQ=255) tATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTAtt < 1:6968527/45‑1 (MQ=255) tATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAAttt < 1:7728542/66‑1 (MQ=255) tATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTgg > 1:2961035/1‑70 (MQ=255) aTGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTga > 1:99547/1‑46 (MQ=255) aTGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTga > 1:90291/1‑46 (MQ=255) aTGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTga > 1:4907625/1‑46 (MQ=255) aTGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGt > 1:2232898/1‑70 (MQ=255) aTGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAG‑AGGAAAATGGTTATTga > 1:292035/1‑45 (MQ=255) tGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGt < 1:2609952/69‑1 (MQ=255) cAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAgg > 1:1435765/1‑54 (MQ=255) cAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAgg > 1:1470149/1‑54 (MQ=255) cAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAag > 1:4555769/1‑70 (MQ=255) aCCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTAt < 1:708982/38‑1 (MQ=255) aCCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAaggag > 1:870012/1‑71 (MQ=255) ccTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAatggttaaggttgcataatgatatgcaacaaatgtataata < 1:1709475‑M2/70‑42 (MQ=255) ccTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATa > 1:1782304/1‑54 (MQ=255) cTTAACCATTAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTg < 1:4750556/38‑1 (MQ=255) cTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAggagga < 1:7760639/71‑1 (MQ=255) ttAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAAt > 1:7260800/1‑55 (MQ=255) tAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGaca > 1:6162671/1‑71 (MQ=255) aaCCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAatggttaaggttgcataatgatatgcaacaaatgt > 1:1644667‑M2/1‑25 (MQ=255) aCCATtttcctgctaactaaattcatggttaaggttgcataatgatatgcaacaaatgtataatatttcc < 1:776042‑M1/70‑66 (MQ=255) ccATtttcctgctaactaaattcatggttaaggttgcataatgatatgcaacaaatgtataatatttcctt < 1:1520271‑M1/71‑68 (MQ=255) ccATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGt < 1:1678514/71‑1 (MQ=255) cATtttcctgctaactaaattcatggttaaggttgcataatgatatgcaacaaatgtataatatttcctt > 1:4742924‑M1/1‑3 (MQ=255) cATtttcctgctaactaaattcatggttaaggttgcataatgatatgcaacaa < 1:2446416‑M1/53‑51 (MQ=255) cATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAAt < 1:4218402/50‑1 (MQ=255) aTGAATTTAGTTAGCAGGAAAatggttaaggttgcataatgatatgcaacaaat < 1:4579332‑M2/54‑34 (MQ=255) ttttcctgctaactaaattcatggttaaggttgcataatgatatgcaacaaatgtataatatttcctttac < 1:4163935‑M1/71‑71 (MQ=255) ttttcctgctaactaaattcatggttaaggttgcataatgatatgcaacaaatgtataatatttccttta > 1:2249433‑M1/1‑1 (MQ=255) ttttcctgctaactaaattcatggttaaggttgcataatgatatgcaacaaatgtataatatttccttta > 1:3956181‑M1/1‑1 (MQ=255) ttttcctgctaactaaattcatggttaaggttgcata < 1:6091218‑M1/37‑37 (MQ=255) ttttcctgctaactaaattcatggttaaggttgcata < 1:5370036‑M1/37‑37 (MQ=255) tGAATTTAGTTAGCAGGAAGATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATg > 1:90235/1‑71 (MQ=255) tGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAAttt > 1:5420646/1‑50 (MQ=255) tGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATg > 1:4013671/1‑71 (MQ=255) tGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATg < 1:1085348/71‑1 (MQ=255) | GCTTTTGTTTATTTTTTTTGTAAAGGAAATATTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTGAGGAGCTTAAGGATAAATTTCTGGTAAGGAGGACACGTATG > W3110S.gb/2724444‑2724583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |