| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2761456 = | 71 (0.870) | 6 (0.090) | 4/84 | NT | 8.6% | coding (741/2190 nt) | yfjK | conserved hypothetical protein |
| ? | W3110S.gb | 2761483 = | 67 (0.960) | coding (714/2190 nt) | yfjK | conserved hypothetical protein | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
AAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGAT > W3110S.gb/2761386‑2761526 | aaaCGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCATGTaa < 1:1722488/71‑1 (MQ=255)aaaCGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTaa < 1:7891661/71‑1 (MQ=255)aaaCGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTaa < 1:3439512/71‑1 (MQ=255)aaaCGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTaa < 1:6487056/71‑1 (MQ=255) cgacaactgaaaagcggggacattgatcatcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcaa > 1:5976872‑M1/70‑71 (MQ=255) cgacaactgaaaagcggggacattgatcatcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagca > 1:4292715‑M1/70‑70 (MQ=255) aaCGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTaa < 1:6966196/70‑1 (MQ=255) aCGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTaaa > 1:4460555/1‑70 (MQ=255) gAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTaa < 1:7293888/67‑1 (MQ=255) gAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACt < 1:601508/71‑1 (MQ=255) aaaGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTg > 1:2494416/1‑71 (MQ=255) aTGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTg > 1:2754867/1‑70 (MQ=255) tGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTaa < 1:6327175/60‑1 (MQ=255) tGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTgg < 1:1846306/70‑1 (MQ=255) tGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTgg < 1:6045444/70‑1 (MQ=255) tGCGGAAATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTg > 1:3408083/1‑69 (MQ=255) cGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGga > 1:2884812/1‑69 (MQ=255) agcggggacattgatcatcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagca > 1:3170140‑M1/58‑58 (MQ=255) agcggggacattgatcatcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcAAAc > 1:7059306‑M1/58‑61 (MQ=255) agcggggacattgatcatcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcAAAc > 1:2241144‑M1/58‑61 (MQ=255) gggacattgatcatcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcaaa > 1:3792286‑M1/54‑56 (MQ=255) tCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGc > 1:3880464/1‑58 (MQ=255) tCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTa < 1:7453957/70‑1 (MQ=255) gacattgatcatcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcAAACTg < 1:452285‑M1/6‑1 (MQ=255) ccAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGc < 1:38800/57‑1 (MQ=255) ccAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGc > 1:5350062/1‑57 (MQ=255) acattgatcatcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcaaa > 1:7318704‑M1/51‑53 (MQ=255) aaGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAAc > 1:6416881/1‑52 (MQ=255) aaGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAg > 1:4976453/1‑69 (MQ=255) aaGTTTTTCGAGACCGCAAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAAc > 1:510000/1‑52 (MQ=255) ttgatcatcaagaggaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAg > 1:6056566‑M1/48‑71 (MQ=255) gTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGt > 1:586295/1‑71 (MQ=255) gTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGt < 1:4422343/71‑1 (MQ=255) gTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGt > 1:5891450/1‑71 (MQ=255) gTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGt > 1:2495632/1‑71 (MQ=255) ttttCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGttt > 1:4723643/1‑71 (MQ=255) atcatcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGttt < 1:1208248‑M1/27‑1 (MQ=255) tttCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGttt < 1:287713/70‑1 (MQ=255) ttCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTg < 1:7930055/70‑1 (MQ=255) tCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGc < 1:5643576/70‑1 (MQ=255) atcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcAAAc < 1:7931617‑M1/4‑1 (MQ=255) atcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcAAAc < 1:3632801‑M1/4‑1 (MQ=255) tcaagacgaacgagtcatcgcgctcaacattgcgttaagca > 1:3384931‑M1/41‑41 (MQ=255) tcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagca > 1:279730‑M1/41‑41 (MQ=255) tcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagca > 1:4934712‑M1/41‑41 (MQ=255) tcaagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagca > 1:480242‑M1/41‑41 (MQ=255) cGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCt > 1:2860430/1‑70 (MQ=255) gagaCCGCGAATGCTGTTAACGAACGTTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTa < 1:6594338/71‑1 (MQ=255) gagaCCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTa < 1:6010886/71‑1 (MQ=255) gagaCCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTa < 1:202916/71‑1 (MQ=255) aagacgaacgagtcatcgagctcaacattgcgttaagcaaa < 1:6486916‑M1/3‑1 (MQ=255) gaCCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTTCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAAc > 1:1036966/1‑71 (MQ=255) gaCCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTaa > 1:7185950/1‑70 (MQ=255) cgcgAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTaa < 1:3132855/35‑1 (MQ=255) cgcgAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTaa < 1:3976058/35‑1 (MQ=255) cgcgAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTaa < 1:3927898/35‑1 (MQ=255) cgAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAAt > 1:5699324/1‑71 (MQ=255) cgAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAAt > 1:3239255/1‑71 (MQ=255) gAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATg < 1:2569299/71‑1 (MQ=255) aTGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGtt < 1:4638334/71‑1 (MQ=255) tGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTg < 1:2069705/71‑1 (MQ=255) tGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTg < 1:2529276/71‑1 (MQ=255) gCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGtt > 1:1788399/1‑69 (MQ=255) tGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGc > 1:1506295/1‑71 (MQ=255) atcgagctcaacattgcgttaagcAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTg < 1:18148‑M1/28‑1 (MQ=255) ttAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTAAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTc > 1:3569184/1‑71 (MQ=255) aacgaacgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCg < 1:7566190/70‑1 (MQ=255) acgaacgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGtt < 1:3269538/46‑1 (MQ=255) acgaacgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGtt < 1:6081932/46‑1 (MQ=255) acgaacgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGtt < 1:1068835/46‑1 (MQ=255) acgaacgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGAt < 1:715131/71‑1 (MQ=255) acgaacgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGAt < 1:1005181/71‑1 (MQ=255) gaacgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTg < 1:6994033/61‑1 (MQ=255) cccGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTg > 1:380690/1‑54 (MQ=255) cccGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTg > 1:6553752/1‑54 (MQ=255) ccGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACtcgt < 1:2205221/68‑1 (MQ=255) ccGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACtcgt < 1:484820/68‑1 (MQ=255) cGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACtcgttcgt < 1:2246882/71‑1 (MQ=255) gTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTa < 1:1792943/40‑1 (MQ=255) gTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACtcg < 1:7886572/65‑1 (MQ=255) gTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACtcg < 1:4406452/65‑1 (MQ=255) tCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCt > 1:1515558/1‑71 (MQ=255) aGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCtt < 1:23812/70‑1 (MQ=255) aGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTtg < 1:2307369/71‑1 (MQ=255) 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aaaaCTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTtgatga > 1:361561/1‑71 (MQ=255) aaaaCTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTAGCTTAACGCAATGTTGa > 1:570310/1‑45 (MQ=255) AAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTgatgat < 1:5194687‑M1/71‑1 (MQ=255) AAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTgatgat < 1:119410‑M1/71‑1 (MQ=255) AAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTgatgat < 1:391851‑M1/71‑1 (MQ=255) AAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGACTTgatgat < 1:5680011‑M1/71‑1 (MQ=255) | AAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGAT > W3110S.gb/2761386‑2761526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |