| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 4627298 | 110 (1.350) | 5 (0.070) | 3/92 | NT | 5.0% | coding (848/1332 nt) | yjjJ | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | W3110S.gb | = 4627314 | 85 (1.110) | coding (864/1332 nt) | yjjJ | predicted DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
TCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTATCTCTTCTCCGGGATCG > W3110S.gb/4627229‑4627368 | tCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGt < 1:7737659/71‑1 (MQ=255)tCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGt < 1:6849171/71‑1 (MQ=255)tCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGG > 1:1437357‑M1/1‑70 (MQ=255)tCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGG > 1:1473125‑M1/1‑70 (MQ=255) aaCGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGAt < 1:6969056/70‑1 (MQ=255) aCGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATgg < 1:6408583/71‑1 (MQ=255) gTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCg > 1:1849822/1‑71 (MQ=255) tGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAAc < 1:543722/62‑1 (MQ=255) tGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAAc < 1:1549154/62‑1 (MQ=255) cTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCtt < 1:767119/71‑1 (MQ=255) cTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCt < 1:2512155/70‑1 (MQ=255) cTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCt < 1:7192748/70‑1 (MQ=255) ttGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGt > 1:827591/1‑65 (MQ=255) tGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTaa > 1:3286053/1‑57 (MQ=255) tGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTaa > 1:3136986/1‑57 (MQ=255) gTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGcc < 1:2882676‑M2/71‑3 (MQ=255) gTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGcc < 1:2362468‑M2/71‑3 (MQ=255) tAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGcc > 1:6921850‑M2/1‑68 (MQ=255) aaCAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCtt < 1:2340811/66‑1 (MQ=255) aCAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTa < 1:4176721/70‑1 (MQ=255) aCAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTa < 1:5632943/70‑1 (MQ=255) aGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTAtt < 1:1997491/69‑1 (MQ=255) aGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATtgt < 1:4638411/71‑1 (MQ=255) aGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATtgt > 1:3984777/1‑71 (MQ=255) tAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGcaagcgaccatcgttacctttgcagt < 1:3085999‑M1/71‑27 (MQ=255) tAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGcaagcgaccatcgttacctttgcagt < 1:7911412‑M1/71‑27 (MQ=255) tAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCt < 1:4501088/59‑1 (MQ=255) tAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCt < 1:1390767/59‑1 (MQ=255) tAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCt < 1:3397572/59‑1 (MQ=255) tAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATtgt > 1:7574192/1‑69 (MQ=255) aCAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTg > 1:5550369/1‑59 (MQ=255) aCAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCg > 1:5657489/1‑71 (MQ=255) aggcaggTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATg > 1:6729825/1‑49 (MQ=255) aggcaggTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTc > 1:3176703/1‑52 (MQ=255) aggcaggTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTc > 1:4120281/1‑52 (MQ=255) aggcaggTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCt < 1:1070516/71‑1 (MQ=255) caggTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGa < 1:1131202/44‑1 (MQ=255) aggTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAg > 1:5815711/1‑71 (MQ=255) aggTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAg < 1:7014042/71‑1 (MQ=255) aggTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAg > 1:6956606/1‑71 (MQ=255) gttATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTa < 1:4431610/54‑1 (MQ=255) gTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTAtt < 1:179747/57‑1 (MQ=255) tATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGa < 1:1283506/40‑1 (MQ=255) aTTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTgtgt > 1:5363269/1‑59 (MQ=255) aTTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGc > 1:7173755/1‑62 (MQ=255) ttCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCt < 1:7828839/62‑1 (MQ=255) ccTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGcct > 1:197020‑M2/1‑46 (MQ=255) ccTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGa > 1:6887684/1‑63 (MQ=255) ccTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTg < 1:529183/70‑1 (MQ=255) cTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGAt > 1:2260973/1‑36 (MQ=255) cTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTg > 1:4357874/1‑69 (MQ=255) cTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCa < 1:4814605/71‑1 (MQ=255) gAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGcaagcgaccatcgttacct < 1:3911946‑M1/45‑20 (MQ=255) gAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCt > 1:3703519/1‑40 (MQ=255) gAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCt > 1:646825/1‑40 (MQ=255) gAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCt > 1:3964793/1‑40 (MQ=255) gAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCgg > 1:1426645/1‑64 (MQ=255) gAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCaga < 1:7249031/70‑1 (MQ=255) gAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCaga < 1:7309866/70‑1 (MQ=255) gAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCaga < 1:7494886/70‑1 (MQ=255) gAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCag < 1:739965/69‑1 (MQ=255) aaGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAgagt < 1:3723911/71‑1 (MQ=255) aGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAgagt > 1:699307/1‑70 (MQ=255) ggAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATtgt < 1:822333/45‑1 (MQ=255) ggAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAgagtgagt < 1:7770475/71‑1 (MQ=255) ggAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAgagtgagt < 1:5874882/71‑1 (MQ=255) gAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAgagtgagt < 1:3271187/70‑1 (MQ=255) gAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGtt > 1:5944219/1‑71 (MQ=255) aaCGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAgagtgag < 1:3875448/68‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAgagtgag < 1:6736883/68‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGACTGCAAAGGTAACCATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGttt < 1:1232705/71‑1 (MQ=255) aCGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTgtgt > 1:913890/1‑44 (MQ=255) aCGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTgtgt > 1:1685901/1‑44 (MQ=255) aCGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTgtgt > 1:5207848/1‑44 (MQ=255) aCGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAgagtgagt < 1:1960644/68‑1 (MQ=255) aCGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAgagtgag < 1:5177393/67‑1 (MQ=255) cTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCaga > 1:682030/1‑59 (MQ=255) ttGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGa > 1:5283224/1‑46 (MQ=255) tGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTAtctc < 1:3463158/69‑1 (MQ=255) tGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTATctct < 1:1963211/70‑1 (MQ=255) gACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTATCtcttc > 1:5516392/1‑71 (MQ=255) gACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTATCtctt < 1:4998395/70‑1 (MQ=255) cTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCa < 1:2966821/51‑1 (MQ=255) cTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCa < 1:4940272/51‑1 (MQ=255) cTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTATCTCTtctc < 1:2048388/71‑1 (MQ=255) cAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTATCTCTTCTCCgg > 1:2817671/1‑71 (MQ=255) aaaGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTg < 1:5319184/36‑1 (MQ=255) aaaGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTg < 1:4974322/36‑1 (MQ=255) aaaGGTAACGATGGTCGCTTGACTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTATCTCTTCTCCggg < 1:6216232/71‑1 (MQ=255) aGGTAACGATGGTCGCTTGcctttgcagtcaaagcgttccgcttcgaggaatacctgcct > 1:2659426‑M2/1‑19 (MQ=255) aGGTAACGATGGTCGCTTGcctttgcagtcaaagcgttccgcttc < 1:3705010‑M2/45‑27 (MQ=255) aGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTgg > 1:7000232/1‑35 (MQ=255) aGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGtt < 1:2160407/54‑1 (MQ=255) aGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTATCTCTTCTCCGGGAt > 1:3572747/1‑71 (MQ=255) ggcaagcgaccatcgttacctttgcagtcaaagcgttccgcttcgaggaatacctgcctgttacttgttac < 1:4420650‑M1/71‑70 (MQ=255) ggcaagcgaccatcgttacctttgcagtcaaagcgttccgcttcgaggaatacctgcctgttacttgttac < 1:2882676‑M1/71‑70 (MQ=255) ggcaagcgaccatcgttacctttgcagtcaaagcgttccgcttcgaggaatacctgcctgttacttgttac < 1:1846645‑M1/71‑70 (MQ=255) ggcaagcgaccatcgttacctttgcagtcaaagcgttccgcttcgaggaatacctgcctgttacttgtta > 1:6921850‑M1/1‑2 (MQ=255) gTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAgagtgag < 1:2662855/50‑1 (MQ=255) gTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTATCTCTTCTCCGGGATCg < 1:3547692/71‑1 (MQ=255) | TCGAGTCAACGGTGCTTGTAACAAGTAACAGGCAGGTATTCCTCGAAGCGGAACGCTTTGACTGCAAAGGTAACGATGGTCGCTTGCCTATTGTGTCGCTGGAGGCGGTGCAGAGTGAGTTTATCTCTTCTCCGGGATCG > W3110S.gb/4627229‑4627368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |