| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 169029 | 76 (0.930) | 10 (0.140) | 3/84 | NT | 10.4% | coding (1546/2244 nt) | fhuA | ferrichrome outer membrane transporter |
| ? | W3110S.gb | = 169050 | 108 (1.550) | coding (1567/2244 nt) | fhuA | ferrichrome outer membrane transporter | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
GACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATGGTAATATTT > W3110S.gb/168980‑169119 | gacgacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGgtg > 1:3522477/1‑71 (MQ=255) acgacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGt > 1:2589249‑M2/1‑70 (MQ=255) acgacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGt > 1:888555‑M2/1‑70 (MQ=255) cgacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGta > 1:4707313‑M2/1‑69 (MQ=255) gacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTTCCTGTTTGATAATGGTGt > 1:7820033‑M2/1‑68 (MQ=255) gacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGt > 1:2007755‑M2/1‑68 (MQ=255) ccGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaaca > 1:5034714‑M2/1‑66 (MQ=255) ccGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGt > 1:3979762‑M2/1‑66 (MQ=255) ccGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGt > 1:555583‑M2/1‑66 (MQ=255) aTAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCt < 1:4735508/71‑1 (MQ=255) aTAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCt > 1:6704889/1‑71 (MQ=255) aTAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCt < 1:703687/71‑1 (MQ=255) tAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCt > 1:565426/1‑70 (MQ=255) aaCGTGATGACAAACAGTTTACCTTGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTAc < 1:387170/71‑1 (MQ=255) atgaCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAg < 1:7381674/70‑1 (MQ=255) atgaCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGc > 1:7655213/1‑71 (MQ=255) gaCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaaca < 1:5850043‑M2/57‑6 (MQ=255) gaCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCta > 1:3713853/1‑71 (MQ=255) aCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCta > 1:2042487/1‑70 (MQ=255) aaaCAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAg > 1:5972519/1‑71 (MQ=255) aaCAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaa < 1:5794249‑M2/51‑4 (MQ=255) aaCAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaa < 1:1671801‑M2/51‑4 (MQ=255) aCAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGc > 1:2685807/1‑70 (MQ=255) ttACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGgtg > 1:7884561/1‑42 (MQ=255) tACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGt > 1:1875669/1‑71 (MQ=255) aCCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGATTCGt < 1:1890802/70‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTg < 1:6121981/71‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGa < 1:4082178/69‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAAc > 1:1907939/1‑71 (MQ=255) cGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaa > 1:7525182‑M2/1‑34 (MQ=255) cGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAAcc < 1:4154485/71‑1 (MQ=255) tggtggtgTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACctt > 1:6569868/1‑71 (MQ=255) gtggtgTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACcttc < 1:6962835/70‑1 (MQ=255) tggtgTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAg < 1:308952/45‑1 (MQ=255) tggtgTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCg < 1:1587836/58‑1 (MQ=255) gtgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCa > 1:4468750/1‑42 (MQ=255) gtgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCa > 1:1235506/1‑42 (MQ=255) gtgtTAACTACCTGTCTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCa > 1:125182/1‑42 (MQ=255) tgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcgg > 1:1112766‑M2/1‑26 (MQ=255) tgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcgg > 1:1051382‑M2/1‑26 (MQ=255) tgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcgg > 1:6557978‑M2/1‑26 (MQ=255) tgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacaccaccacgccaggtaaactgtttg < 1:3522683‑M2/55‑30 (MQ=255) tgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACtt < 1:5805157/39‑1 (MQ=255) tgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGc < 1:6014727/71‑1 (MQ=255) ttAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGttt < 1:406623/56‑1 (MQ=255) ttAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGttt < 1:5357632/56‑1 (MQ=255) ttAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCg > 1:4994474/1‑68 (MQ=255) ttAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCg > 1:1191342/1‑68 (MQ=255) ttAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCa < 1:4671570/70‑1 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacaccaccacgccaggtaaactgtttgt < 1:4848360‑M2/53‑31 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCta > 1:5476611/1‑42 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGttt > 1:7038131/1‑55 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGttt > 1:5598504/1‑55 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAg > 1:6204762/1‑71 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAg > 1:6896633/1‑71 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAg > 1:286242/1‑71 (MQ=255) aaCTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGc > 1:492789/1‑39 (MQ=255) aaCTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGc > 1:3636476/1‑39 (MQ=255) aaCTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGATTCGTTTGa < 1:1948670/56‑1 (MQ=255) aaCTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTg < 1:7476072/55‑1 (MQ=255) aaCTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTg < 1:3029265/55‑1 (MQ=255) cTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCtat > 1:2611981/1‑40 (MQ=255) cTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTg > 1:1337138/1‑71 (MQ=255) aCCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGc < 1:947312/35‑1 (MQ=255) aCCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGt < 1:2789648/48‑1 (MQ=255) ccTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCta > 1:1081087/1‑36 (MQ=255) cTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCta > 1:7142096/1‑35 (MQ=255) cTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTggg > 1:5289828/1‑69 (MQ=255) tGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCg < 1:2308268/39‑1 (MQ=255) tGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGtt > 1:4908042/1‑46 (MQ=255) tGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGtt > 1:3240978/1‑46 (MQ=255) tGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTggg < 1:2271370/68‑1 (MQ=255) gTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAg > 1:3217372/1‑62 (MQ=255) tttGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATc < 1:6763961/41‑1 (MQ=255) tttGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACct < 1:1478227/51‑1 (MQ=255) tttGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCttcttc > 1:6339093/1‑56 (MQ=255) tttGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAgg < 1:1003363/70‑1 (MQ=255) tttGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAgg < 1:2760067/70‑1 (MQ=255) ttGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCa > 1:7674216/1‑58 (MQ=255) ttGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAATGAt > 1:6843558/1‑71 (MQ=255) tGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTg > 1:2328397/1‑44 (MQ=255) tGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCaa > 1:3881584/1‑58 (MQ=255) tGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCaa > 1:6062079/1‑58 (MQ=255) tGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTggg > 1:692070/1‑64 (MQ=255) tGATAATGGTATAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCaa > 1:7612515/1‑58 (MQ=255) gATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGtt < 1:3211035/41‑1 (MQ=255) gATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGa > 1:6006354/1‑44 (MQ=255) gATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGa > 1:6594075/1‑44 (MQ=255) gATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATgg > 1:5934777/1‑71 (MQ=255) aTGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATGGTaa > 1:2728670/1‑70 (MQ=255) aTGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATGGTAat < 1:2262609/71‑1 (MQ=255) aTGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATGGTAat < 1:7751769/71‑1 (MQ=255) tGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATGGTAata > 1:6875372/1‑71 (MQ=255) ggTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAg > 1:7834666/1‑60 (MQ=255) ggTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATGGTAatat > 1:7762021/1‑71 (MQ=255) gtgtAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTggg < 1:2838485/56‑1 (MQ=255) gtgtAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTggg < 1:6850243/56‑1 (MQ=255) gtgtAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATGGTAATAtt < 1:7224026/71‑1 (MQ=255) gtgtAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATGGTAATAtt > 1:2543004/1‑71 (MQ=255) gtAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATGGTAATAttt < 1:1792966/70‑1 (MQ=255) | GACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGTTGGGAAGGATGGTAATATTT > W3110S.gb/168980‑169119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |