| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 315707 | NA (NA) | 104 (1.280) | 53/98 | NT | 100% | coding (654/687 nt) | ykgA | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | W3110S.gb | 576911 = | 0 (0.000) | coding (76/498 nt) | ybcS | predicted lysozyme | |||||
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
CCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTATG > W3110S.gb/576842‑576981 | ccATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCAc > 1:674878/1‑71 (MQ=255) cagtcctgaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTg > 1:1326965‑M2/68‑71 (MQ=255) atcatTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTt < 1:935400‑M2/71‑2 (MQ=255) tccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaa < 1:3180504‑M2/1‑1 (MQ=255) tccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaa < 1:1012785‑M2/1‑1 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgat < 1:6201225‑M2/71‑5 (MQ=255) aCGAAAAGCCGTTGCTGCTACTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACAtgat < 1:4067069‑M2/68‑5 (MQ=255) cGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatct > 1:6835523‑M2/1‑63 (MQ=255) aGCCGTTTCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccag < 1:7922061‑M2/71‑14 (MQ=255) tgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACt < 1:7257638‑M2/3‑1 (MQ=255) cGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa > 1:2156129‑M2/1‑55 (MQ=255) gaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGa > 1:661648‑M2/52‑71 (MQ=255) gTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa < 1:2305527‑M2/70‑17 (MQ=255) gctgctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagt < 1:4037746‑M2/71‑21 (MQ=255) ctgctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagt > 1:6773282‑M2/1‑50 (MQ=255) caagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATg < 1:2027446‑M2/22‑1 (MQ=255) gctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtgga < 1:4996716‑M2/71‑24 (MQ=255) aagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCt > 1:4623182‑M2/46‑71 (MQ=255) ctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtgga > 1:7823774‑M2/1‑47 (MQ=255) ctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacc < 1:5172031‑M2/57‑11 (MQ=255) agaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTg > 1:4528032‑M2/45‑71 (MQ=255) aacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGa < 1:3119208‑M2/29‑1 (MQ=255) acctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTgg > 1:555666‑M2/42‑69 (MQ=255) cctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAg < 1:7464410‑M2/31‑1 (MQ=255) ctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACt > 1:3432123‑M2/40‑42 (MQ=255) ctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTg > 1:7005667‑M2/40‑43 (MQ=255) aTTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtg > 1:7183602‑M2/1‑42 (MQ=255) aTTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtg > 1:6072525‑M2/1‑42 (MQ=255) aTTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtg > 1:4421306‑M2/1‑42 (MQ=255) ttGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcgg < 1:5043486‑M2/71‑31 (MQ=255) ttGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcg > 1:5651083‑M2/1‑41 (MQ=255) tcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaAc > 1:7714248‑M2/39‑40 (MQ=255) tcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGgt > 1:5073658‑M2/39‑71 (MQ=255) ggtggCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatct < 1:4777709‑M2/45‑7 (MQ=255) ggtggCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatct < 1:3915612‑M2/45‑7 (MQ=255) gcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTaa > 1:7572218‑M2/37‑53 (MQ=255) tggCGGAGCAATTGCTATATCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaa > 1:1495660‑M2/1‑37 (MQ=255) cGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagt < 1:3720078‑M2/70‑37 (MQ=255) gcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGc < 1:586683‑M2/39‑1 (MQ=255) gcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTa > 1:1063122‑M2/31‑71 (MQ=255) gcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTa < 1:5623026‑M2/41‑1 (MQ=255) gcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTa < 1:2273253‑M2/41‑1 (MQ=255) gcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTa > 1:6422883‑M2/31‑71 (MQ=255) gAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagt > 1:4460189‑M2/1‑32 (MQ=255) gAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttaccaagcaatagt > 1:6168072‑M2/1‑32 (MQ=255) ctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAca > 1:1605583‑M2/29‑71 (MQ=255) cAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttaccca < 1:7833785‑M2/41‑13 (MQ=255) tccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGc > 1:7393929‑M2/24‑62 (MQ=255) tGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtg > 1:845336‑M2/1‑25 (MQ=255) ccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcatacca > 1:7054916‑M2/23‑70 (MQ=255) cTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcg > 1:3489761‑M2/1‑23 (MQ=255) atattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCAacataccatt > 1:633185‑M2/21‑69 (MQ=255) tattacgtcggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATg < 1:5496689‑M2/22‑1 (MQ=255) attacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcata < 1:7858950‑M2/45‑1 (MQ=255) attacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:5258799‑M2/19‑70 (MQ=255) attacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa < 1:2495297‑M2/52‑1 (MQ=255) ataGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaag < 1:3975737‑M2/56‑36 (MQ=255) ataGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagt < 1:3028324‑M2/41‑21 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcata < 1:6003348‑M2/45‑1 (MQ=255) taGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcag > 1:3649604‑M2/1‑20 (MQ=255) taGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctc > 1:6408561‑M2/1‑20 (MQ=255) gCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtca > 1:3768271‑M2/1‑18 (MQ=255) gCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagt < 1:1747084‑M2/69‑52 (MQ=255) cgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTc > 1:2745529‑M2/15‑39 (MQ=255) cgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTc > 1:4354598‑M2/15‑39 (MQ=255) cgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAg > 1:5763076‑M2/15‑69 (MQ=255) cgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGat < 1:2882296‑M2/57‑1 (MQ=255) cATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcag > 1:3752536‑M2/1‑17 (MQ=255) gtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGata < 1:1901683‑M2/58‑1 (MQ=255) aTCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagt > 1:7439314‑M2/1‑16 (MQ=255) aTCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtg > 1:3390527‑M2/1‑16 (MQ=255) tCAGTGTTAATCACTttatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagag < 1:2557164‑M2/71‑57 (MQ=255) tCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagag < 1:4269753‑M2/71‑57 (MQ=255) aGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggt < 1:4611256‑M2/71‑59 (MQ=255) aGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggt > 1:3635637‑M2/1‑13 (MQ=255) gtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAttgt > 1:177643‑M2/10‑71 (MQ=255) taggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAttgtt > 1:7535208‑M2/9‑71 (MQ=255) gtTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctc < 1:4327519‑M2/58‑49 (MQ=255) aggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAttgtt > 1:2434459‑M2/8‑70 (MQ=255) ttAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcaga > 1:5929968‑M2/1‑9 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAttgttg < 1:3371924‑M2/64‑1 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAttgttg < 1:4702420‑M2/64‑1 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAttgttg < 1:3064967‑M2/64‑1 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTgg > 1:2912656‑M2/7‑71 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTgg > 1:5944256‑M2/7‑71 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTgg > 1:2228686‑M2/7‑71 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTgg > 1:2691603‑M2/7‑71 (MQ=255) gatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAc < 1:1161326‑M2/42‑1 (MQ=255) gatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACaa < 1:5351327‑M2/53‑1 (MQ=255) gatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa < 1:6471929‑M2/52‑1 (MQ=255) aaTCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactc > 1:1264829‑M2/1‑7 (MQ=255) tcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAttg > 1:4890524‑M2/4‑64 (MQ=255) aTCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcac > 1:3867760‑M2/1‑6 (MQ=255) caACTGTCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTa > 1:1436736‑M2/3‑71 (MQ=255) caACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTc > 1:776971‑M2/3‑38 (MQ=255) caACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGatat > 1:4213618‑M2/3‑61 (MQ=255) caACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGatat > 1:484591‑M2/3‑61 (MQ=255) caACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGatat > 1:263345‑M2/3‑61 (MQ=255) caACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTa > 1:6036187‑M2/3‑71 (MQ=255) aACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGa < 1:6514392‑M2/56‑1 (MQ=255) | CCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTATG > W3110S.gb/576842‑576981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |