| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 914231 = | 82 (1.010) | 4 (0.060) | 3/84 | NT | 7.3% | coding (6/1653 nt) | hcp | hybrid‑cluster [4Fe‑2S‑2O] protein in anaerobic terminal reductases |
| ? | W3110S.gb | 914275 = | 31 (0.440) | intergenic (‑39/+105) | hcp/ybjE | hybrid‑cluster [4Fe‑2S‑2O] protein in anaerobic terminal reductases/predicted transporter | |||||
CGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAGCGC > W3110S.gb/914205‑914344 | cGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTa < 1:4176246/71‑1 (MQ=255) tccctgcgttaagcgtcttaaccttAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTa > 1:3740380‑M1/26‑70 (MQ=255) gATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAg > 1:7350134/1‑71 (MQ=255) gATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAg > 1:1435535/1‑71 (MQ=255) gATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAg > 1:2816911/1‑71 (MQ=255) gATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAg > 1:5879712/1‑71 (MQ=255) aTAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAgg > 1:837742/1‑71 (MQ=255) tttGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTaa < 1:1737932/71‑1 (MQ=255) gTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGAc > 1:7249034/1‑71 (MQ=255) cacaTTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCt > 1:3170104/1‑71 (MQ=255) cacaTTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCt > 1:4960342/1‑71 (MQ=255) cacaTTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCt > 1:1988896/1‑71 (MQ=255) acaTTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCt < 1:5179857/70‑1 (MQ=255) caTTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCtt > 1:1837635/1‑70 (MQ=255) caTTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCtt < 1:2748311/70‑1 (MQ=255) tGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGt > 1:5595086/1‑57 (MQ=255) tGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTaa > 1:6062004/1‑69 (MQ=255) tGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTaa > 1:6528578/1‑69 (MQ=255) tGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAAcg > 1:267083/1‑71 (MQ=255) cacacaAAACATGATCACACCTTTTAAATTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAAcgc < 1:6103691/70‑1 (MQ=255) acacaAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTa < 1:4586707/56‑1 (MQ=255) caAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGa > 1:1736358/1‑71 (MQ=255) taaacatgtatattaaatataactttaaaaggtgtgatcatgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCAGGGa > 1:3740380‑M2/46‑70 (MQ=255) aaacatgtatattaaatataactttaaaaggtgtgatcatgtttAAGGTTAAGACGCTTAAcg < 1:6313717‑M2/19‑1 (MQ=255) aaacatgtatattaaatataactttaaaaggtgtgatcatgtttAAGGTTAAGACGCTTAAcg < 1:1023760‑M2/19‑1 (MQ=255) ATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTa < 1:5040486‑M1/56‑1 (MQ=255) ATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTa < 1:2540343‑M1/56‑1 (MQ=255) ATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAg < 1:173824‑M1/71‑1 (MQ=255) ATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAg < 1:2232190‑M1/71‑1 (MQ=255) aTCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTaa > 1:3310403/1‑45 (MQ=255) aTCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTaa > 1:863801/1‑45 (MQ=255) aTCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTaa > 1:2448281/1‑45 (MQ=255) aTCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAggg < 1:1290931/70‑1 (MQ=255) aTCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAggg < 1:4115833/70‑1 (MQ=255) cacaCCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCt < 1:2145476/49‑1 (MQ=255) cacCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGAtttt < 1:2882760/71‑1 (MQ=255) acCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATaaaa > 1:7468017/1‑62 (MQ=255) acCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGAttttt < 1:7174050/71‑1 (MQ=255) ccTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTc < 1:2673883/71‑1 (MQ=255) cattttAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCt < 1:2136309/43‑1 (MQ=255) cTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCa < 1:6356072/71‑1 (MQ=255) aactttaaaaggtgtgatcatgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGAttt > 1:4801739‑M2/26‑62 (MQ=255) aaaGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGc > 1:987867/1‑38 (MQ=255) aGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACt < 1:7381482/71‑1 (MQ=255) gTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCgg > 1:4228587/1‑44 (MQ=255) atatTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACttt > 1:3756567/1‑69 (MQ=255) tttAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAgg < 1:1492466/70‑1 (MQ=255) tataCATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAgatt > 1:2856817/1‑71 (MQ=255) tataCATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAgatt > 1:2410446/1‑71 (MQ=255) tataCATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAgatt > 1:6543941/1‑71 (MQ=255) taCATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACttt < 1:1279795/59‑1 (MQ=255) taCATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAg > 1:3752261/1‑62 (MQ=255) taCATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAgattga > 1:4995262/1‑71 (MQ=255) catgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCa > 1:4815926‑M2/8‑48 (MQ=255) catgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCa > 1:323586‑M2/8‑48 (MQ=255) catgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAgattgatt > 1:5721708‑M2/8‑71 (MQ=255) catgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAgattgatt < 1:1007088‑M2/64‑1 (MQ=255) catgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAgattgatt < 1:6836922‑M2/64‑1 (MQ=255) atgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAg > 1:7878363‑M2/7‑59 (MQ=255) atgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAg > 1:120951‑M2/7‑59 (MQ=255) tgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTa < 1:4288073‑M2/66‑1 (MQ=255) gtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCa > 1:7202122‑M2/5‑49 (MQ=255) gtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAg > 1:6965201‑M2/5‑71 (MQ=255) tAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGga > 1:6128786‑M2/2‑57 (MQ=255) aaGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCa > 1:6009327/1‑41 (MQ=255) aaGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAgcgc < 1:3584122/70‑1 (MQ=255) | CGGATAGTTTGTTCACATTGCACACAAAACATGATCACACCTTTTAAAGTTATATTTAATATACATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAGCGC > W3110S.gb/914205‑914344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |