| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2116525 = | 73 (0.900) | 7 (0.100) | 4/84 | NT | 9.3% | intergenic (‑61/+114) | galF/wcaM | predicted subunit with GalU/predicted colanic acid biosynthesis protein |
| ? | W3110S.gb | 2116545 = | 74 (1.060) | intergenic (‑81/+94) | galF/wcaM | predicted subunit with GalU/predicted colanic acid biosynthesis protein | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CTGTAAAATGGTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACT > W3110S.gb/2116477‑2116612 | cTGTAAAATTGTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTAc > 1:5477118/1‑71 (MQ=255)cTGTAAAATGGTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTAc > 1:5999161/1‑71 (MQ=255) tGTAAAATGGTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACt > 1:2018711/1‑71 (MQ=255) tAAAATGGTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTg < 1:4575698/70‑1 (MQ=255) aaaTGGTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGaa > 1:1850927/1‑70 (MQ=255) aaaTGGTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAAt > 1:1193421/1‑71 (MQ=255) tGGTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTAc < 1:5302784/71‑1 (MQ=255) ggTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACt > 1:658121/1‑71 (MQ=255) gTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACtt < 1:864287/71‑1 (MQ=255) gTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACt < 1:4742499/70‑1 (MQ=255) tGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTAc > 1:3661071/1‑59 (MQ=255) tGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTAc > 1:4640565/1‑59 (MQ=255) gCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTtgt > 1:5272296/1‑70 (MQ=255) cTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGAttc > 1:7882827/1‑55 (MQ=255) cTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGa > 1:2203318/1‑71 (MQ=255) cTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGa > 1:57451/1‑71 (MQ=255) aacgaagcggcgtaacatcacaagtaattcagtaATCAATTACCCTGAATTGAtt < 1:1950158‑M1/21‑1 (MQ=255) tGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACt > 1:345993/1‑65 (MQ=255) tGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGAt > 1:5698186/1‑71 (MQ=255) tGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACACTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGAt > 1:2438783/1‑71 (MQ=255) aaTTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGAt < 1:822830/69‑1 (MQ=255) ataGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTAcg > 1:997254/1‑71 (MQ=255) taGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTAcg < 1:7626560/70‑1 (MQ=255) gCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTAcgccg < 1:3430359/71‑1 (MQ=255) gCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTAcgccg > 1:2833432/1‑71 (MQ=255) cTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTAcgccgc > 1:6421915/1‑71 (MQ=255) ttGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGAt < 1:1072617/60‑1 (MQ=255) ttGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCt > 1:6007794/1‑71 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGAt > 1:3289147/1‑59 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTAATTGTGATGTTACGCCGCtt > 1:1138639/1‑71 (MQ=255) gATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACtt < 1:997437/49‑1 (MQ=255) gATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACtt < 1:6620792/49‑1 (MQ=255) gATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACtt < 1:2221852/49‑1 (MQ=255) gATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGtt < 1:316751/70‑1 (MQ=255) gATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTtg < 1:2705829/71‑1 (MQ=255) tttttttCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTtgtg > 1:5106968/1‑71 (MQ=255) ttttCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTg > 1:5222195/1‑36 (MQ=255) tttCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAAtt > 1:3336642/1‑39 (MQ=255) ttCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTg > 1:2072794/1‑71 (MQ=255) tCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGt < 1:2515483/61‑1 (MQ=255) tCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGt < 1:1509141/61‑1 (MQ=255) cGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTtgtg < 1:6742744/43‑1 (MQ=255) cGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGAt > 1:2487446/1‑45 (MQ=255) cGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGt < 1:7902950/60‑1 (MQ=255) cGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGc < 1:1913564/70‑1 (MQ=255) ccAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTtgtg < 1:5295960/41‑1 (MQ=255) ccAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACTCCGCTTCGTtgt < 1:5640342/61‑1 (MQ=255) ccAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTtgt < 1:2289409/61‑1 (MQ=255) ccAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCa < 1:962759/69‑1 (MQ=255) cAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTa < 1:3611429/71‑1 (MQ=255) aGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTgg > 1:5095617/1‑61 (MQ=255) aGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTgg > 1:3910214/1‑61 (MQ=255) gCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTa < 1:4775641/44‑1 (MQ=255) gCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTa < 1:7020127/44‑1 (MQ=255) gCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTTCAg < 1:4255094/67‑1 (MQ=255) gCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAg < 1:784828/67‑1 (MQ=255) gCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAg > 1:2981419/1‑70 (MQ=255) gCATCAATTAACCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTtgt > 1:1939920/1‑58 (MQ=255) cATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCa > 1:2984365/1‑71 (MQ=255) cATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCa > 1:108330/1‑71 (MQ=255) atcaattcagggtaattgatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCa < 1:5788262‑M2/44‑1 (MQ=255) tcaattcagggtaattgatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTtgt > 1:4954337‑M2/20‑55 (MQ=255) TCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGc < 1:3995568‑M1/62‑1 (MQ=255) TCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGc < 1:3430090‑M1/68‑1 (MQ=255) TCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCAtt > 1:1713662‑M1/1‑71 (MQ=255) CAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACTCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTa > 1:7694734‑M1/1‑65 (MQ=255) CAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTa > 1:769980‑M1/1‑65 (MQ=255) CAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTg < 1:6898929‑M1/71‑1 (MQ=255) AATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTg > 1:3713156‑M1/1‑70 (MQ=255) AATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTg > 1:6125292‑M1/1‑70 (MQ=255) ATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGc < 1:7647168‑M1/65‑1 (MQ=255) ATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGc < 1:6826001‑M1/65‑1 (MQ=255) TTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTc < 1:643122‑M1/46‑1 (MQ=255) TTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCg > 1:5381170‑M1/1‑47 (MQ=255) TTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCg > 1:5858032‑M1/1‑47 (MQ=255) TTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCAGCTTCg > 1:1012253‑M1/1‑47 (MQ=255) TTACCCGGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTc < 1:16223‑M1/46‑1 (MQ=255) aCCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCa > 1:5153496/1‑57 (MQ=255) aCCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCa > 1:7526817/1‑57 (MQ=255) cccTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCAtt < 1:1462716/64‑1 (MQ=255) cccTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCt < 1:2510796/70‑1 (MQ=255) cccTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCt < 1:114572/70‑1 (MQ=255) cccTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTa < 1:745393/71‑1 (MQ=255) ccTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCt > 1:634947/1‑69 (MQ=255) tGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCa > 1:1170961/1‑53 (MQ=255) tGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCa > 1:2432614/1‑53 (MQ=255) tGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAg > 1:7590758/1‑70 (MQ=255) gAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACTCCGCTTCGtt > 1:5350497/1‑42 (MQ=255) gAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGtt > 1:5979396/1‑42 (MQ=255) gAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGtt > 1:3869803/1‑42 (MQ=255) aattgatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCt < 1:1672024‑M2/58‑1 (MQ=255) aattgatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGt < 1:6140936‑M2/62‑1 (MQ=255) aattgatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTAt < 1:1939063‑M2/64‑1 (MQ=255) aattgatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTAt < 1:1106463‑M2/64‑1 (MQ=255) aattgatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTAt < 1:5123336‑M2/64‑1 (MQ=255) ttgatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTg < 1:7173725‑M2/42‑1 (MQ=255) ttgatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTg < 1:4501291‑M2/42‑1 (MQ=255) gatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTg < 1:3988261‑M2/42‑1 (MQ=255) gatTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACt > 1:5262692‑M2/4‑71 (MQ=255) atTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAg < 1:4473907‑M2/45‑1 (MQ=255) | CTGTAAAATGGTTGCTGAATTATAGCTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACT > W3110S.gb/2116477‑2116612 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |