| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2418819 = | 94 (1.150) | 10 (0.130) | 3/94 | NT | 9.6% | intergenic (‑241/‑97) | yfbV/ackA | conserved inner membrane protein/acetate kinase A and propionate kinase 2 |
| ? | W3110S.gb | 2418861 = | 98 (1.250) | intergenic (‑283/‑55) | yfbV/ackA | conserved inner membrane protein/acetate kinase A and propionate kinase 2 | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CTTCCATCATGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGAGTAAGTTAG > W3110S.gb/2418794‑2418931 | tcCATCATGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGctc > 1:2213123/1‑71 (MQ=255) ccATCATGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGATACg > 1:1120339/1‑67 (MQ=255) catcatGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGctc > 1:4566326/1‑69 (MQ=255) catcatGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTa > 1:6349779/1‑71 (MQ=255) catcatGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTa < 1:5228076/71‑1 (MQ=255) tcatGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATg > 1:7637873/1‑71 (MQ=255) atGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATgg > 1:5017299/1‑70 (MQ=255) gCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTc > 1:5597720/1‑71 (MQ=255) aaaaaaaTTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCt < 1:2608248/71‑1 (MQ=255) aaaaaaaTTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCt < 1:5021719/71‑1 (MQ=255) aaaaaaTTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCt > 1:3790402/1‑70 (MQ=255) aaaaaaTTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGGCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTg < 1:3928967/71‑1 (MQ=255) aaaaaTTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGa < 1:4693659/71‑1 (MQ=255) aaTTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGt < 1:1537036/71‑1 (MQ=255) aTTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGtt > 1:6564722/1‑71 (MQ=255) ttGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTAt > 1:7330681/1‑55 (MQ=255) tGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGttttt > 1:5202154/1‑71 (MQ=255) gCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGtttttt > 1:942719/1‑71 (MQ=255) cAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGct > 1:5175747/1‑48 (MQ=255) cAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGtttttt < 1:902763/70‑1 (MQ=255) cAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGtttttt < 1:806361/70‑1 (MQ=255) agcgcatgatgacaccgacatttatgattaacatcatgcactACGCTCTATGGCTCCCTg < 1:6759855‑M2/18‑1 (MQ=255) agcgcatgatgacaccgacatttatgattaacatcatgcactACGCTCTATGGCTCCCTg < 1:5754842‑M2/18‑1 (MQ=255) agcgcatgatgacaccgacatttatgattaacatcatgcactACGCTCTATGGCTCCCTg < 1:2033621‑M2/18‑1 (MQ=255) agcgcatgatgacaccgacatttatgattaacatcatgcactACGCTCTATGGCTCCCTg < 1:7813157‑M2/18‑1 (MQ=255) AGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTg > 1:4101318‑M1/1‑60 (MQ=255) AGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTg > 1:759085‑M1/1‑60 (MQ=255) AGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTg > 1:1756853‑M1/1‑60 (MQ=255) AGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTg > 1:3767394‑M1/1‑60 (MQ=255) AGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGtttttt < 1:81046‑M1/69‑1 (MQ=255) AGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGt < 1:4238986‑M1/64‑1 (MQ=255) AGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGt < 1:5448414‑M1/64‑1 (MQ=255) AGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGt < 1:2138480‑M1/64‑1 (MQ=255) AGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTa > 1:3522826‑M1/1‑71 (MQ=255) gcgcatgatgacaccgacatttatgattaacatcatgcactACGCTCTATGGCTCCCTGACGt < 1:4481799‑M2/22‑1 (MQ=255) gcgcatgatgacaccgacatttatgattaacatcatgcactACGCTCTATGGCTCCCTGACGt < 1:2080849‑M2/22‑1 (MQ=255) GTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAg < 1:3758519‑M1/71‑1 (MQ=255) GTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAg < 1:4285921‑M1/71‑1 (MQ=255) tGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGctc < 1:4973791/46‑1 (MQ=255) tGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGtt > 1:2014621/1‑63 (MQ=255) tGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGc > 1:2778478/1‑71 (MQ=255) tGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGc > 1:5471307/1‑71 (MQ=255) gcatgatgacaccgacatttatgattaacatcatgcactACGCTCTATGGCTCCCTGACGttt > 1:5833446‑M2/40‑63 (MQ=255) gcatgatgacaccgacatttatgattaacatcatgcactACGCTCTATGGCTCCCTGACGttt > 1:5140543‑M2/40‑63 (MQ=255) cATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGAc > 1:609913/1‑58 (MQ=255) cATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCa > 1:6914713/1‑71 (MQ=255) cATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGATACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCa > 1:6423662/1‑71 (MQ=255) cATGATGTTAATAATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGtt > 1:4334344/1‑61 (MQ=255) tgatgTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGctct < 1:3538581/43‑1 (MQ=255) gatgTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTa > 1:7834526/1‑43 (MQ=255) tgTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGc > 1:3391957/1‑45 (MQ=255) tgTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTAt > 1:2755367/1‑71 (MQ=255) tgTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTAt > 1:7105930/1‑71 (MQ=255) tgTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTAt > 1:4393753/1‑71 (MQ=255) ttAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTccc > 1:5957029/1‑47 (MQ=255) tAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCaa > 1:6618755/1‑71 (MQ=255) aaTCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCaa > 1:2690755/1‑70 (MQ=255) tCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATta < 1:7789974/71‑1 (MQ=255) tCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCATGACGtttttt < 1:444760/54‑1 (MQ=255) cATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATta > 1:6060734/1‑70 (MQ=255) aTAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTcc > 1:3876692/1‑40 (MQ=255) aTAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTcc > 1:7607676/1‑40 (MQ=255) aTAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATtata < 1:1799961/71‑1 (MQ=255) aTAAATGTCGGTGTCATCATGCGATACGCTCTATGGCTCCCTGACGt > 1:1983906/1‑47 (MQ=255) tAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGt < 1:4814945/46‑1 (MQ=255) aaaTGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAAt < 1:1490194/65‑1 (MQ=255) aaTGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTcc < 1:6621241/37‑1 (MQ=255) aTGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCa > 1:4801212/1‑61 (MQ=255) aTGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTa > 1:888322/1‑71 (MQ=255) tCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATta < 1:3395382/62‑1 (MQ=255) tCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACtt < 1:3255341/71‑1 (MQ=255) ggTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTc > 1:1065274/1‑70 (MQ=255) ggTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTc > 1:1059284/1‑70 (MQ=255) gtgtCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGttttttt < 1:5503423/43‑1 (MQ=255) gtgtCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCa > 1:658166/1‑71 (MQ=255) tgtCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCa > 1:535385/1‑70 (MQ=255) tgtCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCAt > 1:5697939/1‑71 (MQ=255) tcatcaTGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATtat < 1:7835774/57‑1 (MQ=255) tcatcaTGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATtat < 1:3021014/57‑1 (MQ=255) atcatGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTc > 1:895684/1‑70 (MQ=255) atcatGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCg < 1:339528/71‑1 (MQ=255) catGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGtttttt > 1:1251957/1‑35 (MQ=255) catGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAg > 1:2057196/1‑55 (MQ=255) catGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTCACGTTTTTTTAGCCACGTATCAAtt < 1:3787406/51‑1 (MQ=255) catGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTCACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAg > 1:1309438/1‑55 (MQ=255) atGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTc > 1:6641171/1‑61 (MQ=255) atGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGAg > 1:4226190/1‑70 (MQ=255) atGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGAg > 1:4052820/1‑70 (MQ=255) tGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATtat < 1:463413/51‑1 (MQ=255) tGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGAGTa < 1:6445433/71‑1 (MQ=255) tGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGAGTa < 1:6454670/71‑1 (MQ=255) gcgcTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAAt < 1:7553339/47‑1 (MQ=255) cgcTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAg > 1:2829658/1‑51 (MQ=255) gcTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCg > 1:2644608/1‑64 (MQ=255) gcTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGa > 1:4895427/1‑65 (MQ=255) gcTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGa > 1:7235581/1‑65 (MQ=255) gcTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGAGTAAGt > 1:689446/1‑71 (MQ=255) tACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGt > 1:7559860‑M2/2‑60 (MQ=255) tACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGAGTAAGt > 1:6944076‑M2/2‑69 (MQ=255) aCGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGAGTAAGTTAg > 1:6957595/1‑71 (MQ=255) | CTTCCATCATGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAATCATAAATGTCGGTGTCATCATGCGCTACGCTCTATGGCTCCCTGACGTTTTTTTAGCCACGTATCAATTATAGGTACTTCCATGTCGAGTAAGTTAG > W3110S.gb/2418794‑2418931 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |