| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 3838034 | 51 (0.630) | 17 (0.230) | 10/88 | NT | 26.2% | coding (676/1020 nt) | rfaI | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase |
| ? | W3110S.gb | = 3838053 | 50 (0.680) | coding (695/1020 nt) | rfaI | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase | |||||
GCCAGAAATAATCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAAC > W3110S.gb/3837985‑3838123 | gCCAGAAATAATCAAAAAAAATAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTt > 1:6777742‑M2/1‑70 (MQ=255)gCCAGAAATAATCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTta > 1:4319490‑M2/1‑69 (MQ=255)gCCAGAAATAATCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTta > 1:938651‑M2/1‑69 (MQ=255) ccAGAAATAATCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTtat < 1:534870‑M2/71‑4 (MQ=255) ccAGAAATAATCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTtat < 1:6290041‑M2/71‑4 (MQ=255) ccAGAAATAATCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTtat > 1:774153‑M2/1‑68 (MQ=255) aaaTAATCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTc > 1:4178645/1‑71 (MQ=255) ataatCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTtatatt > 1:1730548‑M2/1‑62 (MQ=255) ataatCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTAtttt < 1:5737080/68‑1 (MQ=255) ataatCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTAtttt < 1:4560949/68‑1 (MQ=255) aatCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCt > 1:3547330/1‑70 (MQ=255) cAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGc > 1:7234557/1‑66 (MQ=255) aaaaaaa‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTtatt > 1:2749143‑M2/1‑56 (MQ=255) aaaaaaa‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTc < 1:5589212/63‑1 (MQ=255) aaaaaaa‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTc < 1:7082897/63‑1 (MQ=255) aaaaa‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATAtt > 1:194502/1‑70 (MQ=255) aaaaa‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTa < 1:446115/71‑1 (MQ=255) aaaaa‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTa < 1:7714930/71‑1 (MQ=255) aaaa‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTaa < 1:5648682/71‑1 (MQ=255) a‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCt < 1:4851212/60‑1 (MQ=255) tAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAatat < 1:6919756/71‑1 (MQ=255) tAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAatat < 1:4419485/71‑1 (MQ=255) acacATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCg > 1:4258390/1‑55 (MQ=255) acacATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATaa > 1:2566267/1‑71 (MQ=255) cacaTCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATaa > 1:3091625/1‑70 (MQ=255) acaTCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTc < 1:5048506/52‑1 (MQ=255) acaTCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAaca < 1:2495894/71‑1 (MQ=255) aTCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGc > 1:7734162/1‑52 (MQ=255) aTCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGc > 1:7743338/1‑52 (MQ=255) aTCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACAcc > 1:1709079/1‑71 (MQ=255) aTCATGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGc > 1:5242575/1‑52 (MQ=255) tCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAatat < 1:1332532/64‑1 (MQ=255) tCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAatat < 1:2336375/64‑1 (MQ=255) tCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACAccc < 1:1722950/71‑1 (MQ=255) ccTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACAcc > 1:4335327/1‑69 (MQ=255) ccTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACAcc > 1:2259138/1‑69 (MQ=255) cTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTtatt < 1:814433‑M2/44‑5 (MQ=255) aTCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTtattt > 1:3204150‑M2/1‑37 (MQ=255) cAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAg > 1:7896291/1‑71 (MQ=255) aGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGtt < 1:1406399/67‑1 (MQ=255) aTGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCa > 1:1190588/1‑61 (MQ=255) tgtgTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTa > 1:4439082/1‑70 (MQ=255) tgtgTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTa > 1:5239119/1‑70 (MQ=255) tgtTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAAt > 1:7352983/1‑71 (MQ=255) ttAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggatgtgttatttttttg > 1:2988467‑M2/1‑26 (MQ=255) ttAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggatgtgttatttttttg > 1:2084758‑M2/1‑26 (MQ=255) ttAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGata < 1:2129723/40‑1 (MQ=255) aaaTATGTTTTTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTAt > 1:6673458/1‑70 (MQ=255) aaaTATGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggatgtgttatttttttgattat > 1:3253488‑M2/1‑24 (MQ=255) aaaTATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGa > 1:4935856/1‑36 (MQ=255) aaaTATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGa < 1:6720202/36‑1 (MQ=255) aaaTATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAat > 1:4791061/1‑44 (MQ=255) aaaTATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAAt > 1:4811800/1‑67 (MQ=255) aaaTATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTa > 1:1134589/1‑69 (MQ=255) aaaTATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTAt < 1:85935/70‑1 (MQ=255) aaaTATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTAt < 1:5988856/70‑1 (MQ=255) aaaTATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTAt > 1:4469649/1‑70 (MQ=255) aaaTATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTAt > 1:2714003/1‑70 (MQ=255) aaTATGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaccacatcctgatcaggatgt > 1:4793159‑M2/1‑23 (MQ=255) aaTATGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggatgtgttatttttttgattatttctg < 1:5025980‑M2/71‑49 (MQ=255) atatGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggat > 1:1275086‑M2/1‑22 (MQ=255) atatGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCaa > 1:4552491/1‑71 (MQ=255) tatGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcagga > 1:1543208‑M2/1‑21 (MQ=255) tatGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcagga > 1:2203868‑M2/1‑21 (MQ=255) tatGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTaa < 1:5657842/39‑1 (MQ=255) atGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACAccc < 1:4263654/49‑1 (MQ=255) atGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt > 1:5566240/1‑71 (MQ=255) atGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt > 1:5162341/1‑71 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggatgtgttatttttttgattatt > 1:2872057‑M2/1‑19 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggat > 1:891874‑M2/1‑19 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggat > 1:1615772‑M2/1‑19 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggat > 1:3293511‑M2/1‑19 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggat > 1:4011970‑M2/1‑19 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACAcc > 1:7816933/1‑47 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt > 1:7095380/1‑70 (MQ=255) gTTGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggat > 1:3912662‑M2/1‑18 (MQ=255) gTTGCTCGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggatgtgttatttttttgattatttctggctca < 1:1017397‑M2/71‑54 (MQ=255) ttGCTGGCGGATAAACTtatttaacacatcctgatcaggatgtgttatttttttgattatttc < 1:2517450‑M2/63‑47 (MQ=255) tGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCa > 1:5306884/1‑69 (MQ=255) gCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCaaa < 1:483649/70‑1 (MQ=255) gCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCaaagaa < 1:6154164/69‑1 (MQ=255) gCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCaaagaa < 1:2246229/69‑1 (MQ=255) cGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGc < 1:4307972/71‑1 (MQ=255) cGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGc < 1:7549585/71‑1 (MQ=255) ggATAAACTtatttaacacatcctgatcaggatgtgtt > 1:316940‑M2/1‑9 (MQ=255) aTAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCttt < 1:4723665/71‑1 (MQ=255) aTAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCtt > 1:2474001/1‑70 (MQ=255) tAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCttt > 1:990099/1‑70 (MQ=255) tAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTta > 1:2727533/1‑71 (MQ=255) tAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTta < 1:6299758/71‑1 (MQ=255) aaaCTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTta < 1:2641770/70‑1 (MQ=255) aaCTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTATATTATCAACTCaaa < 1:2543422/59‑1 (MQ=255) aaCTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTtata < 1:6272698/71‑1 (MQ=255) ttATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAAc > 1:921043/1‑71 (MQ=255) | GCCAGAAATAATCAAAAAAA‑TAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAAATATGTTGCTGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACTCAAAGAAAGCTTTATAAAC > W3110S.gb/3837985‑3838123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |