| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 4037965 | 107 (1.310) | 10 (0.140) | 3/86 | NT | 11.0% | coding (296/669 nt) | ftsE | predicted transporter subunit |
| ? | W3110S.gb | = 4037982 | 68 (0.950) | coding (313/669 nt) | ftsE | predicted transporter subunit | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GGCATGATTTTCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTCGGCGGCGCTGGATAAAGTCGGGCTA > W3110S.gb/4037913‑4038050 | ggCATGATTTTCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGa < 1:84201/70‑1 (MQ=255)ggCATGATTTTCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAt < 1:7144387‑M2/71‑2 (MQ=255) gCATGATTTTCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAtt > 1:2744649‑M2/1‑69 (MQ=255) aTGATTTTCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCCTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAttat < 1:7446640‑M2/71‑5 (MQ=255) gATTTTCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAttatcg < 1:3580038‑M2/71‑7 (MQ=255) gATTTTCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAttatcg < 1:1240124‑M2/71‑7 (MQ=255) aTTTTCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGc < 1:7253945/71‑1 (MQ=255) aTTTTCCAGGATAACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGc < 1:2705749/71‑1 (MQ=255) ttttCAAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGcc < 1:7126491/71‑1 (MQ=255) tttCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCg > 1:3932009/1‑71 (MQ=255) tttCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCg > 1:6330695/1‑71 (MQ=255) tttCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCg > 1:2527789/1‑71 (MQ=255) tttCAAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGcc < 1:1645474/70‑1 (MQ=255) ttCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCg < 1:187665/70‑1 (MQ=255) ttCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCg > 1:2795472/1‑70 (MQ=255) cAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTg < 1:2664954/70‑1 (MQ=255) aGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGc > 1:7218161/1‑70 (MQ=255) aGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGc > 1:4481708/1‑70 (MQ=255) gaccACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAg < 1:3427367/68‑1 (MQ=255) gATCACCATCTACTGATGGCCCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTg > 1:4672123/1‑67 (MQ=255) gATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTg > 1:1193568/1‑67 (MQ=255) gATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAg < 1:3327149/71‑1 (MQ=255) gATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAg > 1:1654250/1‑71 (MQ=255) gATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAg < 1:6662785/71‑1 (MQ=255) gATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAg < 1:2394033/71‑1 (MQ=255) gATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAg > 1:1998648/1‑71 (MQ=255) aTCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGcc > 1:7522581/1‑62 (MQ=255) aTCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGcc > 1:3497525/1‑62 (MQ=255) aTCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGcc > 1:1938779/1‑62 (MQ=255) tCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTATGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCa < 1:1951554/68‑1 (MQ=255) tCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCa < 1:1114596/68‑1 (MQ=255) tCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCa < 1:4135808/68‑1 (MQ=255) tCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCg > 1:2908135/1‑71 (MQ=255) aCCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGt < 1:3211692/71‑1 (MQ=255) aCCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGt < 1:1618971/71‑1 (MQ=255) ccATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTg < 1:5162891/71‑1 (MQ=255) ccATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTg < 1:4822276/71‑1 (MQ=255) cATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAttatcg < 1:795441‑M2/55‑7 (MQ=255) aTCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGAc < 1:4656602/71‑1 (MQ=255) cTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAttatcg > 1:4417866‑M2/1‑46 (MQ=255) tACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGa > 1:3251170/1‑70 (MQ=255) aCTGATGAACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGcc > 1:6153338/1‑52 (MQ=255) cTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCg < 1:2974318/52‑1 (MQ=255) cTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACg < 1:7686484/67‑1 (MQ=255) cTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGatat < 1:3149779/71‑1 (MQ=255) cTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGatat > 1:7502513/1‑71 (MQ=255) cTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGat < 1:5358023/69‑1 (MQ=255) cTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGa < 1:4005012/68‑1 (MQ=255) tGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGcc < 1:3484905/50‑1 (MQ=255) tGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGc < 1:6345624/49‑1 (MQ=255) tGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGc < 1:2902793/49‑1 (MQ=255) gATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATtc > 1:4930477/1‑71 (MQ=255) aTGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGat > 1:4410082/1‑66 (MQ=255) aTGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATAtt < 1:1567162/69‑1 (MQ=255) aTGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATAtt < 1:1657185/69‑1 (MQ=255) aTGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATtcg < 1:6595554/71‑1 (MQ=255) tGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAttatc < 1:4842813‑M2/44‑6 (MQ=255) tGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAttaac < 1:4516994‑M2/44‑6 (MQ=255) tGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATtcg < 1:5507638/70‑1 (MQ=255) ggACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATtcgtc > 1:33417/1‑71 (MQ=255) aCCGTACTGTCTACGACAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCC‑GTGCCAGCGGTg < 1:2859330/56‑1 (MQ=255) ccGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAtt < 1:4674877‑M2/37‑3 (MQ=255) ccGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAtt < 1:4688253‑M2/37‑3 (MQ=255) ccGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGAtt < 1:1047936‑M2/37‑3 (MQ=255) ccGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGcc > 1:6861491/1‑71 (MQ=255) ccGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGcc < 1:702839/71‑1 (MQ=255) tACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGa < 1:865018/54‑1 (MQ=255) tACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGa < 1:6003818/54‑1 (MQ=255) ctttCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGgtg < 1:3933426/68‑1 (MQ=255) cTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATtc > 1:7667079/1‑60 (MQ=255) cTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATtc > 1:7664019/1‑60 (MQ=255) cTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATtc > 1:255057/1‑60 (MQ=255) cTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATtc > 1:6489305/1‑60 (MQ=255) tGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGgtgt > 1:3316889/1‑71 (MQ=255) gTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGgt > 1:3483014/1‑68 (MQ=255) gTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGgt > 1:6620421/1‑68 (MQ=255) tCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGgtgt < 1:454876/69‑1 (MQ=255) tCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTc < 1:7346069/70‑1 (MQ=255) tCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTc < 1:6854764/70‑1 (MQ=255) cGATAACGTGGCGATCCCGCTGAttatcgtagatagtacggtccatcagtagatggtgatcctggaaaatc > 1:3240145‑M2/1‑23 (MQ=255) cGATAACGTGGCGATCCCGCTGAttatcgtagacagtacggtccatcagtagatggtgatcctggaaaatc > 1:2863716‑M2/1‑23 (MQ=255) cGATAACGTGGCGATCCCGCTGAttatcgtagacagtacggtccatcagtagatggtgatcctggaaaatc > 1:151707‑M2/1‑23 (MQ=255) cGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCgg > 1:4520132/1‑42 (MQ=255) cGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCgg > 1:1122851/1‑42 (MQ=255) cGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTcggcgg > 1:356354/1‑71 (MQ=255) cGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTcggcgg > 1:6146378/1‑71 (MQ=255) aTAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTcggcg < 1:1409593/68‑1 (MQ=255) gTGGCGATCCCGCTGAttatcgtagacagtacggtccatcagta > 1:2837079‑M2/1‑16 (MQ=255) gTGGCGATCCCGCTGAttatcgtagacagtacggtccatcagta > 1:6424835‑M2/1‑16 (MQ=255) ggCGATCCCGCTGAttatcgtagacagtacggtccatcagtaga < 1:372163‑M2/44‑31 (MQ=255) ggCGATCCCGCTGAttatcgtagacagtacggtccatcagtaga < 1:7471830‑M2/44‑31 (MQ=255) ggCGATCCCGCTGAttatcgtagacagtacggtccatcagtaga < 1:4677942‑M2/44‑31 (MQ=255) gATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTcgg < 1:2033628/56‑1 (MQ=255) gATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTCGGCGGCGCTGGATAAAg < 1:1809342/71‑1 (MQ=255) aTCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTCGGCGGCGCTGGATAAAGt < 1:4667650/71‑1 (MQ=255) tCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTCGGCGGCGCTGGATAAAGt < 1:1205605/70‑1 (MQ=255) cccGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTCGGCGGCGCTGGATAAAGTCg > 1:6657830/1‑71 (MQ=255) cTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTCGGCGGCGCTGGATAAAGTCGGGCt < 1:5593205/71‑1 (MQ=255) cTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTCGGCGGCGCTGGATAAAGTCGGGCt < 1:3947091/71‑1 (MQ=255) aTTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTCGGCGGCGCTGGATAAAGTCGGGCTa < 1:1514581/69‑1 (MQ=255) | GGCATGATTTTCCAGGATCACCATCTACTGATGGACCGTACTGTCTACGATAACGTGGCGATCCCGCTGATTATCGCCGGTGCCAGCGGTGACGATATTCGTCGCCGGGTGTCGGCGGCGCTGGATAAAGTCGGGCTA > W3110S.gb/4037913‑4038050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |