| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 4599626 | 89 (1.090) | 12 (0.180) | 4/82 | NT | 12.4% | coding (908/915 nt) | yjjM | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | W3110S.gb | = 4599639 | 95 (1.390) | coding (895/915 nt) | yjjM | predicted DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
TTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATC > W3110S.gb/4599571‑4599708 | ttGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTct < 1:7055909‑M2/71‑3 (MQ=255)ttGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTct < 1:5896149‑M2/71‑3 (MQ=255) gATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTc > 1:5092451‑M2/1‑67 (MQ=255) aTAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTctcat < 1:7169052‑M2/71‑6 (MQ=255) aTAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTctcat < 1:4798454‑M2/71‑6 (MQ=255) aTAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTctcat < 1:3294350‑M2/71‑6 (MQ=255) tAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTctcat < 1:4930614‑M2/70‑6 (MQ=255) aCCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATg < 1:6491879/71‑1 (MQ=255) ccGTGCTCCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATg > 1:5035035/1‑70 (MQ=255) ccGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATgg < 1:941998/71‑1 (MQ=255) cGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGa < 1:3729049/71‑1 (MQ=255) gTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGa > 1:4257084/1‑70 (MQ=255) gTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGAt < 1:1619844/71‑1 (MQ=255) gTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGAt > 1:7358973/1‑71 (MQ=255) cACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCg < 1:3974099/70‑1 (MQ=255) aCCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCg < 1:5257981/69‑1 (MQ=255) ccGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGtt > 1:7846630/1‑52 (MQ=255) ccGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTATCATTAATGGATCGAAt > 1:7504612/1‑70 (MQ=255) gCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCat > 1:7281472/1‑71 (MQ=255) gCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCat > 1:2743680/1‑71 (MQ=255) cTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCat < 1:7414248/70‑1 (MQ=255) tAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCatt > 1:4540648/1‑70 (MQ=255) aTAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGa < 1:4774234/58‑1 (MQ=255) tAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCattgat > 1:5956385/1‑70 (MQ=255) aGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCatt < 1:5640713/66‑1 (MQ=255) gTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTct < 1:3317120‑M2/45‑3 (MQ=255) gTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCattg > 1:7768633/1‑66 (MQ=255) gTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCa < 1:4440633/63‑1 (MQ=255) gTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGt < 1:7384763/71‑1 (MQ=255) gTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGt > 1:7733844/1‑71 (MQ=255) tttGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGtt > 1:4625773/1‑71 (MQ=255) tGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGttt < 1:6017949/70‑1 (MQ=255) tGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGttt < 1:7565740/70‑1 (MQ=255) tGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGtt > 1:1275960/1‑69 (MQ=255) tGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGtt > 1:7706912/1‑69 (MQ=255) tGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGtt > 1:7846404/1‑69 (MQ=255) cTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCat < 1:1925471/59‑1 (MQ=255) cTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCat < 1:6735691/59‑1 (MQ=255) cTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATAATTGATTGTTTAg < 1:2216045/70‑1 (MQ=255) tGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAAt > 1:6777015/1‑46 (MQ=255) tGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATgg < 1:2748155/48‑1 (MQ=255) gTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCTTTGATTGtt > 1:5224205/1‑65 (MQ=255) gTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGtt > 1:3730902/1‑65 (MQ=255) gTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTAATTAATGGATCGAATCattg > 1:329837/1‑59 (MQ=255) tttttAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTctcatta > 1:6755322‑M2/1‑35 (MQ=255) tttttAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTg > 1:7104513/1‑70 (MQ=255) tttttAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTg > 1:2673080/1‑70 (MQ=255) tttAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAAt > 1:6010374/1‑71 (MQ=255) tttAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAAt > 1:2520901/1‑71 (MQ=255) tttAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGAGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTg > 1:2814877/1‑68 (MQ=255) aaTCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAg > 1:2266440/1‑62 (MQ=255) aaTCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTc < 1:7212391/70‑1 (MQ=255) aTCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCa < 1:110471/70‑1 (MQ=255) tCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCaaa < 1:2111437/71‑1 (MQ=255) ccGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGAt > 1:3578919/1‑40 (MQ=255) cGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATg > 1:4501070/1‑71 (MQ=255) cGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATg > 1:5890861/1‑71 (MQ=255) gTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGttt > 1:643506/1‑55 (MQ=255) tACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGt < 1:4587063/71‑1 (MQ=255) tACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGt < 1:1981301/71‑1 (MQ=255) tACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGt < 1:7910410/71‑1 (MQ=255) tACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGt < 1:7697207/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAAt > 1:2357983/1‑41 (MQ=255) aCTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAAt > 1:1470563/1‑41 (MQ=255) tAATGAGCATAACGCGTGTTctcattaagtacggattaaaaa > 1:3411817‑M2/1‑20 (MQ=255) tAATGAGCATAACGCGTGTTctcattaagtacggattaaaaa > 1:1189785‑M2/1‑20 (MQ=255) tAATGAGCATAACGCGTGTTctcattaagtacggattaaa > 1:6475273‑M2/1‑20 (MQ=255) tAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCaa > 1:7088354/1‑62 (MQ=255) tAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCaa > 1:4067776/1‑62 (MQ=255) aaTGAGCATAACGCGTGTTctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattagcgggtgcacggt > 1:1437552‑M2/1‑19 (MQ=255) aaTGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATc > 1:3890907/1‑38 (MQ=255) aaTGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACg < 1:2167035/70‑1 (MQ=255) aTGAGCATAACGCGTGTTctcattaagtacggattaaaaa < 1:5358438‑M2/40‑23 (MQ=255) aTGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACgg < 1:815432/70‑1 (MQ=255) aTGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACgg < 1:4005165/70‑1 (MQ=255) aTGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGa < 1:7909207/71‑1 (MQ=255) gAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTa > 1:6619801/1‑65 (MQ=255) gAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTa > 1:2651899/1‑65 (MQ=255) aGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAgcg > 1:1634522/1‑71 (MQ=255) aGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAgc < 1:1781545/70‑1 (MQ=255) gCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAgcgc < 1:1010380/71‑1 (MQ=255) tAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAg > 1:363312/1‑71 (MQ=255) aaCGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTa < 1:1070989/59‑1 (MQ=255) aaCGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTa < 1:5043184/59‑1 (MQ=255) aCGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGaa > 1:6163531/1‑46 (MQ=255) aCGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTa < 1:6036059/58‑1 (MQ=255) aCGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATAATTGATTGt > 1:233017/1‑37 (MQ=255) cgcgTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTc > 1:5313641/1‑48 (MQ=255) cgcgTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTc > 1:137067/1‑48 (MQ=255) gcgTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTg > 1:395881/1‑71 (MQ=255) gcgTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTg > 1:3636420/1‑71 (MQ=255) cgTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCaaa < 1:5482052/49‑1 (MQ=255) gtgtTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTgg > 1:2742211/1‑70 (MQ=255) gtgtTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTgg > 1:6285849/1‑70 (MQ=255) tgtTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCt < 1:898343/38‑1 (MQ=255) tgtTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCa > 1:5150090/1‑71 (MQ=255) gtTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCa > 1:5808991/1‑70 (MQ=255) ttCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAg < 1:2963247/56‑1 (MQ=255) ttCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATc < 1:357692/71‑1 (MQ=255) ttCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATc < 1:2614317/71‑1 (MQ=255) | TTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATC > W3110S.gb/4599571‑4599708 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |