| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 1942762 = | 32 (0.640) | 3 (0.070) | 3/94 | NT | 9.2% | coding (588/1323 nt) | yebA | predicted peptidase |
| ? | W3110S.gb | 1942786 = | 30 (0.650) | coding (564/1323 nt) | yebA | predicted peptidase | |||||
CTTCGGCGCTGGTTAAACCGGCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTAAAACCGTTAGCGGCAGTACGG > W3110S.gb/1942722‑1942855 | cTTCGGCGCTGGTTAAACCGGCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTca > 1:2940260/1‑66 (MQ=255) cGGCGCTGGTTAAACCGGCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTg > 1:477435/1‑71 (MQ=255) gcTGGTTAAACCGGCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTaa > 1:2652324/1‑71 (MQ=255) atgcagcaaggagagtgggttaacaatctgctgAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTca < 1:4307755‑M1/26‑1 (MQ=255) cTGGTTAAACCGGCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGt < 1:3638694/67‑1 (MQ=255) aaCCGGCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCActc < 1:3366971/70‑1 (MQ=255) ccGGCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACtctc > 1:4546455/1‑70 (MQ=255) ccGGCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTcc > 1:4551831/1‑71 (MQ=255) cGGCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGGTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCt < 1:2330535/71‑1 (MQ=255) ggCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTaa > 1:1321114/1‑59 (MQ=255) gCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTc < 1:1156874/45‑1 (MQ=255) gCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCCCTCTCCTtg > 1:385348/1‑71 (MQ=255) gCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTtg < 1:2342183/71‑1 (MQ=255) cGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTtgc < 1:29738/71‑1 (MQ=255) gTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTtgct > 1:1233724/1‑71 (MQ=255) ttCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAAc > 1:503138/1‑55 (MQ=255) tCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCa > 1:1771683/1‑71 (MQ=255) gcgcTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCAttt < 1:3921550/70‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCAttt < 1:1574340/70‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCAt < 1:513959/68‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTc > 1:3173891/1‑71 (MQ=255) gcgcTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTc < 1:1741004/71‑1 (MQ=255) cTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCt < 1:579741/71‑1 (MQ=255) aacaaAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCa > 1:4350370/1‑71 (MQ=255) aacaaAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCa < 1:1265705/71‑1 (MQ=255) tgaaaggtaccgtcgggggaagctttCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCAt < 1:4307755‑M2/33‑1 (MQ=255) acaaAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAAcc < 1:1864539/42‑1 (MQ=255) acaaAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCa < 1:4470957/70‑1 (MQ=255) caaAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCAtt > 1:3727428/1‑71 (MQ=255) aaaggtaccgtcgggggaagctttCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCAttt > 1:3323595‑M2/25‑59 (MQ=255) AAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGtt < 1:4148890‑M1/36‑1 (MQ=255) AAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAAGC‑ACTCTCCTTGCTGCATTTCGc > 1:2146146‑M1/1‑61 (MQ=255) AAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCAct < 1:2795613‑M1/44‑1 (MQ=255) AAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCa < 1:901526‑M1/56‑1 (MQ=255) AAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTg > 1:737462‑M1/1‑64 (MQ=255) AAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTg > 1:439176‑M1/1‑64 (MQ=255) AAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCAttt < 1:622386‑M1/71‑1 (MQ=255) AAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCAttt < 1:2580865‑M1/71‑1 (MQ=255) AAAGCTTCCCCCGACGGTACATTTCAGCAGATTGTTAACCCa < 1:4232742‑M1/42‑1 (MQ=255) aggtaccgtcgggggaagctttCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCAtttt > 1:3717095‑M2/23‑70 (MQ=255) AGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCa < 1:1778356‑M1/54‑1 (MQ=255) GCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTaa < 1:2820673‑M1/35‑1 (MQ=255) GCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTaa > 1:776150‑M1/1‑71 (MQ=255) GCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTaa > 1:3941452‑M1/1‑71 (MQ=255) GCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTaa > 1:1970657‑M1/1‑71 (MQ=255) GCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGGCATTTTaa > 1:2367270‑M1/1‑71 (MQ=255) ttCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTtgctgc < 1:3172082/50‑1 (MQ=255) cccccGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTAAAAcc > 1:4382754/1‑71 (MQ=255) ccGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCtt > 1:313299/1‑40 (MQ=255) ccGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCa > 1:552998/1‑58 (MQ=255) gACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTAAAACCGTTAg > 1:3217282/1‑71 (MQ=255) ggTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTAAAACCGTTAGCgg < 1:366021/71‑1 (MQ=255) gTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCg < 1:3519905/45‑1 (MQ=255) gTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCg < 1:3008544/45‑1 (MQ=255) aCCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTAAAACCGTTAGCgg > 1:3236222/1‑68 (MQ=255) aCCTTTCACCACATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCAATTCGCTGGTCATTTTAAAACCGTTAGCgg > 1:4003406/1‑68 (MQ=255) tttCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCAttt < 1:3773361‑M2/47‑1 (MQ=255) ttCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCAttt > 1:894484‑M2/3‑37 (MQ=255) ttCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCAttt > 1:4220575‑M2/3‑37 (MQ=255) ttCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTaa > 1:746811‑M2/3‑52 (MQ=255) ttCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTAAAACCGTTAGCGGCAGTACg > 1:4562821‑M2/3‑71 (MQ=255) tCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTAAAACCGTTAGCGGCAGtaa < 1:480500‑M2/68‑2 (MQ=255) tCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTAAAACCGTTAGCGGCAGTACgg > 1:845991‑M2/2‑71 (MQ=255) cagcagATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTAAAACCGTTAGCGGCAGTACgg < 1:2879524/70‑1 (MQ=255) | CTTCGGCGCTGGTTAAACCGGCGTTTCTGGCGCTGGCAACAAAGCTTCCCCCGACGGTACCTTTCAGCAGATTGTTAACCCACTCTCCTTGCTGCATTTCGCTGGTCATTTTAAAACCGTTAGCGGCAGTACGG > W3110S.gb/1942722‑1942855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |