| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2191937 | 61 (1.220) | 4 (0.090) | 3/90 | NT | 6.5% | coding (2308/2481 nt) | yehB | predicted outer membrane protein |
| ? | W3110S.gb | = 2191956 | 61 (1.380) | coding (2289/2481 nt) | yehB | predicted outer membrane protein | |||||
AATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACC > W3110S.gb/2191885‑2192025 | aataaCTGACTTCCCTGGCC‑ACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGtt < 1:2573526/71‑1 (MQ=255) ataaCTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGtt < 1:753343/71‑1 (MQ=255) aaCTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTaa < 1:1998084‑M2/71‑3 (MQ=255) aCTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTaat < 1:610512‑M2/71‑4 (MQ=255) cTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTaatg > 1:1732071‑M2/1‑67 (MQ=255) cTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTaatg > 1:3929314‑M2/1‑67 (MQ=255) cTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTaat < 1:667194‑M2/70‑4 (MQ=255) tGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTaatga < 1:2024071‑M2/71‑6 (MQ=255) gACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTaatgat < 1:726319‑M2/71‑7 (MQ=255) ttCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGc > 1:1351803/1‑71 (MQ=255) ttCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGCATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTa < 1:1222242‑M2/63‑2 (MQ=255) ccTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGtt < 1:1047684/59‑1 (MQ=255) ccTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGccc < 1:3204403/70‑1 (MQ=255) ccTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGccc < 1:3198909/70‑1 (MQ=255) cTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGtt < 1:2278164/58‑1 (MQ=255) gCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCt < 1:2329988/70‑1 (MQ=255) gCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTg > 1:232853/1‑71 (MQ=255) aCAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGctct < 1:3932118/71‑1 (MQ=255) aCAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGctct > 1:1224191/1‑71 (MQ=255) aCAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGctct > 1:946671/1‑71 (MQ=255) aCAACGCCAATATTATGACAATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCt > 1:2167744/1‑66 (MQ=255) cAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGctct > 1:1482793/1‑70 (MQ=255) cAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGctct > 1:1964363/1‑70 (MQ=255) cAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCtt < 1:989941/71‑1 (MQ=255) aaCGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTaat < 1:314949‑M2/52‑4 (MQ=255) gCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAAc > 1:1502914/1‑70 (MQ=255) gCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACg > 1:391797/1‑71 (MQ=255) ccAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGc > 1:3042483/1‑71 (MQ=255) cAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTaa < 1:277741‑M2/46‑3 (MQ=255) aaTATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTaat > 1:3295621‑M2/1‑43 (MQ=255) aaTATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCtt > 1:686925/1‑71 (MQ=255) tattatGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAAGGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCttt > 1:720886/1‑70 (MQ=255) tattatGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGccc < 1:1897421/52‑1 (MQ=255) tattatGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCttt > 1:3533519/1‑70 (MQ=255) tattatGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCttt < 1:3111911/70‑1 (MQ=255) tattatGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCttt > 1:4285237/1‑70 (MQ=255) tattatGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCttt > 1:223618/1‑70 (MQ=255) attatGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATc > 1:3600725/1‑54 (MQ=255) ttatGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTtat < 1:657322/71‑1 (MQ=255) ttatGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTta > 1:1413609/1‑70 (MQ=255) tatGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTtat < 1:4128151/70‑1 (MQ=255) aTGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACg > 1:4048185/1‑56 (MQ=255) tGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATgg < 1:1945905/71‑1 (MQ=255) ggATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGc > 1:1198672/1‑71 (MQ=255) ggATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGc > 1:872013/1‑71 (MQ=255) tatCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTg < 1:2555151/71‑1 (MQ=255) tCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATaaa > 1:3519341/1‑59 (MQ=255) tCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTgc < 1:1585327/70‑1 (MQ=255) tCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTgc < 1:4490019/70‑1 (MQ=255) aTTGACTTCATAACCAAACGTTaatgatatccatggtcataatatt > 1:4100447‑M2/1‑22 (MQ=255) aTTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGc < 1:3984698/39‑1 (MQ=255) ttGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTg < 1:2206095/71‑1 (MQ=255) gACTTCATAACCAAACGTTaatgatatccatggtcataatattggcgttgtcggccagggaagtcagtta > 1:4305911‑M2/1‑19 (MQ=255) gACTTCATAACCAAACGTTaatgatatccatggtcataatattggcgttgtcggccagggaagtcagtta > 1:248138‑M2/1‑19 (MQ=255) gACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTaa > 1:340006/1‑42 (MQ=255) gACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGAt > 1:1281771/1‑71 (MQ=255) gACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATATGCTCtt > 1:2382151/1‑40 (MQ=255) aCTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGc > 1:63799/1‑60 (MQ=255) aCTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATc < 1:3828959/71‑1 (MQ=255) cTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGct > 1:4377866/1‑35 (MQ=255) cTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAAGGCTTTTATAAAc > 1:2703984/1‑53 (MQ=255) cTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCg < 1:3245237/71‑1 (MQ=255) ttCATAACCAAACGTTaatgatatccatggtcataatattg < 1:4529996‑M2/41‑26 (MQ=255) ttCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAAc < 1:3016944/52‑1 (MQ=255) ttCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTgc < 1:821497/62‑1 (MQ=255) cATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTaa > 1:1431619/1‑37 (MQ=255) cATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGc > 1:2288773/1‑40 (MQ=255) cATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCgg < 1:3029307/69‑1 (MQ=255) cATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCgg < 1:3244227/69‑1 (MQ=255) cATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCgg < 1:1118293/69‑1 (MQ=255) cATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGt < 1:4143801/70‑1 (MQ=255) cATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGt < 1:804442/70‑1 (MQ=255) cATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTa > 1:1941497/1‑71 (MQ=255) tAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTa > 1:784213/1‑69 (MQ=255) aaCCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTta > 1:2397647/1‑42 (MQ=255) aCCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCa < 1:3102633/70‑1 (MQ=255) aCCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCa < 1:671204/70‑1 (MQ=255) aaaCGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATgg < 1:720878/48‑1 (MQ=255) aaaCGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCaaaa > 1:2068351/1‑70 (MQ=255) aaaCGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAAt > 1:3732509/1‑71 (MQ=255) aaCGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAAtt < 1:570828/71‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAAtt < 1:3815422/71‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAAtt < 1:662392/71‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAAt > 1:4232202/1‑70 (MQ=255) aCGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAAtt > 1:4191282/1‑70 (MQ=255) cGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTag < 1:2157568/71‑2 (MQ=255) gTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAAcc > 1:3945982/1‑40 (MQ=255) gTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCa > 1:2104899/1‑41 (MQ=255) gTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTg < 1:2679948/53‑1 (MQ=255) ttAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAAcc < 1:3579000/71‑1 (MQ=255) tAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGc > 1:1634414/1‑43 (MQ=255) tAATGATTGCACATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAAc > 1:1580614/1‑69 (MQ=255) | AATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACC > W3110S.gb/2191885‑2192025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |