| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 4541675 = | 49 (0.980) | 5 (0.110) | 3/92 | NT | 10.0% | coding (602/981 nt) | yjhS | conserved hypothetical protein |
| ? | W3110S.gb | 4541699 = | 46 (1.020) | coding (578/981 nt) | yjhS | conserved hypothetical protein | |||||
TTATTAAGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGCATGCGCCGAGG > W3110S.gb/4541630‑4541761 | ttattaAGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAgg < 1:239327/71‑1 (MQ=255)ttattaAGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAgg > 1:985799/1‑71 (MQ=255)ttattaAGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAgg > 1:2195075/1‑71 (MQ=255)ttattaAGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAgg < 1:3815605/71‑1 (MQ=255) tattaAGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAggg > 1:3395992/1‑71 (MQ=255) tattaAGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAggg > 1:3522936/1‑71 (MQ=255) ttaAGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTAGGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGgtg > 1:362509/1‑71 (MQ=255) aaGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGgtgt < 1:1162256/70‑1 (MQ=255) aaGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGgtgt < 1:1579328/70‑1 (MQ=255) aGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGgtgt < 1:4431553/69‑1 (MQ=255) gaATGGTATTGGTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGAcgcg > 1:3612375/1‑69 (MQ=255) tATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCAc < 1:1588191/70‑1 (MQ=255) aTTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTg > 1:1629370/1‑71 (MQ=255) gTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGa > 1:4023653/1‑55 (MQ=255) gTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTc < 1:2690649/64‑1 (MQ=255) ttAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCa > 1:2905700/1‑62 (MQ=255) aGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTa > 1:4267207/1‑70 (MQ=255) aGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTa < 1:1155471/70‑1 (MQ=255) gATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTaa < 1:2993288/70‑1 (MQ=255) gATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAg < 1:2558274/71‑1 (MQ=255) aTCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGgtgt < 1:1979894/46‑1 (MQ=255) aTCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTaa < 1:2469763/69‑1 (MQ=255) aTCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTaa < 1:2475208/69‑1 (MQ=255) ccTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCa < 1:3297249/70‑1 (MQ=255) cTAGGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCaaa < 1:4188849/71‑1 (MQ=255) cTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGgtg < 1:610651/41‑1 (MQ=255) cTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCa > 1:3333262/1‑61 (MQ=255) tACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCTTATTCACTGGt < 1:467890/58‑1 (MQ=255) tACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCa < 1:1141908/53‑1 (MQ=255) tACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGt < 1:3893423/58‑1 (MQ=255) aCGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAAtt > 1:3385089/1‑71 (MQ=255) cGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGtgtg > 1:989526/1‑40 (MQ=255) cGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTaa > 1:4573479/1‑62 (MQ=255) aGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGAGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCt > 1:3607294/1‑71 (MQ=255) ggCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCtt < 1:2844128/71‑1 (MQ=255) ggCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCtt > 1:3463523/1‑71 (MQ=255) ggCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCtt > 1:3847999/1‑71 (MQ=255) gCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTg < 1:388572/71‑1 (MQ=255) cTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAg < 1:1844591/56‑1 (MQ=255) ttCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTa < 1:274135/39‑1 (MQ=255) ttCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTg > 1:887152/1‑46 (MQ=255) tcaacactttaatcatatggttgaGGGTGTGACGCGTa < 1:3060711‑M2/14‑1 (MQ=255) tcaacactttaatcatatggttgaGGGTGTGACGCGTa < 1:560326‑M2/14‑1 (MQ=255) tcaacactttaataatatggttgaGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTg > 1:476178‑M2/25‑68 (MQ=255) TCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGAcgc > 1:3631695‑M1/1‑35 (MQ=255) TCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTc < 1:4280790‑M1/56‑1 (MQ=255) TCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCAt < 1:89708‑M1/71‑1 (MQ=255) TCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACCCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCAt < 1:124950‑M1/71‑1 (MQ=255) CAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGt < 1:623238‑M1/39‑1 (MQ=255) CAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTc < 1:3985633‑M1/61‑1 (MQ=255) CAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATc < 1:829273‑M1/71‑1 (MQ=255) CAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATc < 1:472543‑M1/71‑1 (MQ=255) aacactttaatcatatggttgaGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTc > 1:980036‑M2/23‑60 (MQ=255) aacactttaatcatatggttgaGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTc > 1:979902‑M2/23‑60 (MQ=255) CCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAg > 1:1052955‑M1/1‑71 (MQ=255) CCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAg > 1:2635489‑M1/1‑71 (MQ=255) CCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAg > 1:770711‑M1/1‑71 (MQ=255) CCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAg > 1:1901714‑M1/1‑71 (MQ=255) tatGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTgg < 1:4248782/39‑1 (MQ=255) tatGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTgg < 1:328127/39‑1 (MQ=255) tatGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGCAt > 1:3598574/1‑71 (MQ=255) tatGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGCAt < 1:1822868/71‑1 (MQ=255) tGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGCATgc < 1:1264151/71‑1 (MQ=255) tGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAATCAAATTCGCCTTGCATCCAGCATgc > 1:765393/1‑71 (MQ=255) gATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAAt > 1:2064971/1‑50 (MQ=255) gATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGcc > 1:3050792/1‑55 (MQ=255) ttAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTaa > 1:4361834/1‑41 (MQ=255) ttAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGt > 1:2682522/1‑43 (MQ=255) ttAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCa > 1:3933642/1‑62 (MQ=255) tAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGCATGCGcc > 1:2931356/1‑70 (MQ=255) tAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGCATGCGcc > 1:1572630/1‑70 (MQ=255) ttgaGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGc < 1:4477340‑M2/45‑1 (MQ=255) ttgaGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGc < 1:3799035‑M2/52‑1 (MQ=255) ttgaGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGCATGCGCCGAgg > 1:1992890‑M2/5‑67 (MQ=255) gaGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGc < 1:3569788‑M2/52‑1 (MQ=255) gaGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGc < 1:4001328‑M2/52‑1 (MQ=255) gaGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGc < 1:3996183‑M2/52‑1 (MQ=255) gggTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCaaa > 1:1275416/1‑35 (MQ=255) | TTATTAAGCTGAGAATGGTATTGTTTTAGATCCCTACGAAAGGCTTCAACCATATGATTAAAGTGTTGAGGGTGTGACGCGTAGTCACTGGTCATTAAGTCAAATTCGCCTTGCATCCAGCATGCGCCGAGG > W3110S.gb/4541630‑4541761 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |